李雪

作品数:4被引量:4H指数:1
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供职机构:内蒙古师范大学物理与电子信息学院更多>>
发文主题:同义密码子氨基酸MRNA序列回文结构回文更多>>
发文领域:生物学医药卫生更多>>
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不同类氨基酸的使用度对蛋白质折叠速率的影响被引量:3
《内蒙古师范大学学报(自然科学汉文版)》2018年第3期213-216,共4页郭春阳 李瑞芳 李雪 
内蒙古自然科学基金资助项目(2016MS0362);内蒙古高等学校科学技术研究项目(NJZY17043)
根据氨基酸约化分类,定义描述氨基酸序列信息的参量—相对氨基酸使用度(RAAU),在现有数据库和相关文献的基础上,建立了包含相对氨基酸使用度和蛋白质折叠信息的蛋白质折叠数据库.在此基础上,分析了相对氨基酸使用度对蛋白质折叠速率的影...
关键词:相对氨基酸使用度 约化分类 蛋白质折叠速率 相关性 
A型流感病毒同义密码子的使用偏性对RNA二级结构的影响
《病毒学报》2016年第6期773-781,共9页李瑞芳 于志芬 黄俏 郭春阳 李雪 
内蒙古自治区自然科学基金项目(项目号:2016MS0362);题目:氨基酸特性及mRNA序列和结构对相应蛋白质折叠速率的影响
以A型流感病毒为研究样本,分析了同义密码子使用偏性对RNA二级结构的影响,为进一步研究同义密码子存在的意义及A型流感病毒RNA特征提供一些理论依据。收集整理了NCBI中收录的全部A型流感病毒的核酸序列信息,计算了每一条核酸序列的RNA...
关键词:A型流感病毒 同义密码子使用偏性 RNA二级结构 RNA柔性 折叠自由能 
mRNA序列中回文密度对蛋白质折叠速率的影响被引量:1
《内蒙古师范大学学报(自然科学汉文版)》2016年第3期333-337,共5页李雪 李瑞芳 张培龙 黄俏 郭春阳 
内蒙古自然科学基金资助项目(2016MS0362;2012MS0115);内蒙古师范大学研究生科研创新基金项目(CXJJS15077)
建立了一个包括回文结构特征等核苷酸信息的蛋白质折叠数据库,以数据库中每一个蛋白质为研究样本,计算了相应mRNA序列中回文结构的回文密度,分析了回文密度与蛋白质折叠速率之间的相关性.结果证实,对于所有蛋白质,回文密度与蛋白质折叠...
关键词:MRNA序列 蛋白质折叠速率 回文结构 回文密度 
冠状病毒同义密码子使用对mRNA二级结构的影响
《内蒙古大学学报(自然科学版)》2015年第6期609-618,共10页黄俏 李瑞芳 于志芬 李雪 
内蒙古自治区自然科学基金资助项目(2012MS0115);内蒙古自治区研究生教育创新计划资助项目(S20141013523);内蒙古师范大学研究生科研创新基金资助项目(CXJJS14061)
从NCBI中获得了45种冠状病毒的mRNA序列总计416条.分别计算了每条编码序列中相对同义密码子使用度(RSCU),然后预测每条mRNA序列的RNA二级结构,计算相应mRNA茎结构含量、环结构含量、单位平均折叠自由能以及mRNA柔性.由此,建立了冠状病毒...
关键词:冠状病毒 同义密码子使用度 MRNA二级结构 折叠自由能 mRNA柔性 
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