斯氏假单胞菌Pseudomonas stutzeriA1501氧胁迫下基因表达谱研究  

作　　者：窦岳坦[1] 燕永亮[2] 平淑珍[2] 陆伟[2] 陈明[2] 张维[2] 王忆平[3] 金奇[4] 林敏[1] 

机构地区：[1]中国农业大学生物学院,北京100094 [2]中国农业科学院生物技术研究所,北京100081 [3]北京大学生命科学学院,北京100871 [4]中国疾病预防控制中心病毒基因工程国家重点实验室,北京100176

出　　处：《科学通报》2008年第6期664-671,共8页Chinese Science Bulletin

基　　金：国家重点基础研究发展计划(批准号:2001CB108904和2007CB707805);国家高技术研究发展计划(批准号:2006AA020202和2006AA0Z229)资助项目

摘　　要：斯氏假单胞菌Pseudomonas stutzeri A1501分离自我国南方水稻田,在低铵和微好氧条件下能紧密结合在水稻根表,并侵入根内生长和固氮.为探讨氧对A1501基因组表达的影响,利用全基因组芯片技术,研究不同氧浓度(0.5%,21%)下A1501基因组表达谱,结果表明:(ⅰ)67个基因在高氧浓度下表达上调2倍以上,其中17个基因的功能未知;(ⅱ)68个基因在高氧条件下表达,其中约50%的基因参与固氮或反硝化.实时定量RT-PCR验证结果表明,4个编码氧化还原酶的基因和7个编码胞外夹膜多糖和抗原寡糖合成的基因在高氧下表达上调,其中sodC在高氧下表达上调2.7倍、编码黄素单胺氧化酶相关蛋白的基因PST1610表达上调2.2倍、编码α-酮戊二酸-铁氧化酶族氧化还原酶的基因PST3584表达上调3.2倍、编码NAD依赖型氧化还原酶的基因PST2179表达上调2.9倍.这些基因及其表达产物可能在A1501氧保护机制中发挥作用.

关 键 词：斯氏假单胞菌 PSEUDOMONAS STUTZERI A1501 全基因组芯片 氧胁迫 联合固氮 氧化还原酶 

分 类 号：Q93[生物学—微生物学]