甲状腺激素受体配体化合物的定量构效关系(QSAR)研究  被引量:1

Atomic interaction field to QSAR studies for thyroid hormone receptor ligands

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作  者:杨善彬[1,4] 梁桂兆[1,3] 潘元[2] 舒茂[1,2,3] 许罗南[2] 杨青林[2] 陈国华[1,2,3] 孙家英[1,2,3] 田菲菲[1,2,3] 李志良[1,2,3] 

机构地区:[1]重庆大学生物工程学院,生物医学工程教育部与重庆市重点实验室,重庆400044 [2]重庆大学化学化工学院,重庆400044 [3]湖南大学化学生物传感与计量学国家重点实验室,四川长沙410082 [4]宜宾学院生物工程系,四川宜宾644000

出  处:《分子科学学报》2008年第4期228-234,共7页Journal of Molecular Science

基  金:国家高技术研究发展计划项目(“863”计划)和专题资助项目(2006AA02Z312);化学生物传感与计量学国家重点实验室(湖南大学)基金资助项目(2005012);国家“春晖计划”教育部启动基金资助项目(99-4-4+99-3-7);霍英东基金资助项目(98-7-6);重庆直辖市应用基础基金资助项目(01-3-6);生物力学与组织修复工程创新引智基地(教技[2005]7号111计划);重大自主创新科技攻关项目(03-5-6+04-10-10)

摘  要:研究了68个TR(Thyroid Hormone Receptor,甲状腺激素受体)配体化合物的化学结构与活性的定量构效关系.采用实验室新近提出的三维原子场全息相互作用矢量,对化合物进行了结构参数化表达,采用逐步回归对变量进行筛选后,建立了定量构效关系模型.复相关系数和交互检验复相关系数R2=0.767,Q2=0.625(TRα),R2=0.734,Q2=0.61(TRβ).模型具有良好的稳定性和预测能力,证明了该三维原子场全息相互作用矢量在分子结构表征和生物活性预测上的适用性,并可应用于潜在和新型的TR配体化合物的设计和开发.A newly developed three-dimemional holographic vector of atomic interaction field (3D-HoVAIF) was used to describe the chemieal structure of Thyroid receptors ligands with activity. After the structural characterization, the descriptors obtained were screened by stepwise multiple regression (SMR), and the correlation coefficients and crossvalidated correlation coefficients were obtained, R^2 = 0. 767, Q^2 = 0. 625 (TRα), R^2 = 0. 734, Q^2 = 0.61 (TRβ). These results Showed that the model had favorable stabihty and good prediction capability and the 3D-HoV- AIF was apphcable to the molecular structural characterization and biological activity prediction, suggesting that the models could be useful in the design of novel potential TR ligands.

关 键 词:三维原子场全患相互作用矢量(3D—HoVAIF) 甲状腺激素受体(TR)配体 定量构效关系(QSAR) 

分 类 号:O641[理学—物理化学]

 

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