田菲菲

作品数:21被引量:71H指数:5
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供职机构:重庆大学更多>>
发文主题:定量构效关系特异性细胞毒性特异性CTL原子电性作用矢量遗传算法更多>>
发文领域:理学医药卫生生物学化学工程更多>>
发文期刊:《化工学报》《分子科学学报》《细胞与分子免疫学杂志》《科学通报》更多>>
所获基金:教育部“春晖计划”重庆市应用基础研究项目霍英东基金化学生物传感与计量学国家重点实验室开放基金更多>>
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细胞毒性T淋巴细胞生物杀伤效应的检测方法被引量:3
《细胞与分子免疫学杂志》2008年第12期1222-1224,共3页王政 田菲菲 刘丁 吕凤林 
国家高技术研究发展计划(863)资助项目(2006AA02Z312)
关键词:细胞毒性T淋巴细胞 生物杀伤效应 自身免疫性疾病 检测 抗感染免疫 抗肿瘤免疫 免疫效应 细胞介导 
甲状腺激素受体配体化合物的定量构效关系(QSAR)研究被引量:1
《分子科学学报》2008年第4期228-234,共7页杨善彬 梁桂兆 潘元 舒茂 许罗南 杨青林 陈国华 孙家英 田菲菲 李志良 
国家高技术研究发展计划项目(“863”计划)和专题资助项目(2006AA02Z312);化学生物传感与计量学国家重点实验室(湖南大学)基金资助项目(2005012);国家“春晖计划”教育部启动基金资助项目(99-4-4+99-3-7);霍英东基金资助项目(98-7-6);重庆直辖市应用基础基金资助项目(01-3-6);生物力学与组织修复工程创新引智基地(教技[2005]7号111计划);重大自主创新科技攻关项目(03-5-6+04-10-10)
研究了68个TR(Thyroid Hormone Receptor,甲状腺激素受体)配体化合物的化学结构与活性的定量构效关系.采用实验室新近提出的三维原子场全息相互作用矢量,对化合物进行了结构参数化表达,采用逐步回归对变量进行筛选后,建立了定量构效关...
关键词:三维原子场全患相互作用矢量(3D—HoVAIF) 甲状腺激素受体(TR)配体 定量构效关系(QSAR) 
将潜因多元建模技术与遗传虚拟筛选模式相结合:改善定量构效关系被引量:1
《中国科学(B辑)》2008年第3期259-268,共10页李志良 田菲菲 吴世容 杨善彬 杨胜喜 张巧霞 周原 覃仁辉 梅虎 陈刚 李根容 
国家高技术研究发展(863)计划(批准号:2006AA02Z312);霍英东基金(批准号:98-7-6);湖南大学化学生物传感与计量学国家重点实验室基金(批准号:2005012);国家“春晖计划”教育部启动基金(批准号:99-4-4+37);重庆应用基础研究基金(批准号:01-3-6);重大自主创新基金攻关课题(批准号:030506+04-9-9)资助项目
提出了改进的定量构效关系(mmQSAR)研究方法,即认为在知晓配基与受体相互作用模式前提下建立一种较可靠的定量构效关系模型,从而克服了传统做法中仅根据样本集分子自身信息来构建预测模型的某些弊端.将此思路应用于功能肽/蛋白质亲和活...
关键词:功能肽与蛋白质结合模式 遗传虚拟筛选 潜因多元建模 定量构效关系 偏最小二乘 遗传算法 交互检验 评价函数 
支持向量机和线性判别分析用于禽流感病毒编码蛋白识别被引量:2
《中国科学(B辑)》2007年第6期592-596,共5页梁桂兆 陈泽聪 杨善彬 梅虎 周原 舒茂 杨力 杨胜喜 郑小林 陈国华 周鹏 田菲菲 廖春阳 吴世容 李根容 李德静 何留 甘孟瑜 高剑坤 陈国平 王贵学 龙莎 景举华 曾晖 张巧霞 张梦军 杨娟 仝建波 王娇娜 刘永红 李波 仇亮加 蔡绍皙 赵娜 杨艳 苏霞利 宋健 陈美霞 陈刚 张雪姣 孙家英 李经纬 邓婕 彭传友 李志 许罗南 廖立敏 吴玉乾 朱万平 苏勤亮 卢大军 李军 黄振虎 周萍 李志良 
重庆大学研究生创新团队项目科技创新基金(批准号:200711C1A0010260);国家"春晖计划"教育部启动基金(批准号:99-4-4+37);霍英东基金(批准号:98-7-6);重庆直辖市应用基础基金(批准号:01-3-6);生物力学与组织修复工程创新引智基地(教技[2005]7号111计划);湖南大学化学生物传感与计量学国家重点实验室项目(批准号:20050012);重大自主创新科技攻关项目(批准号:03-5-6+04-10-10)资助
以支持向量机(SVM)和线性判别分析(LDA)对200条禽流感病毒、100条B型流感和100条C型流感病毒蛋白共400条为训练集样本,从表征序列的200个整体与局部变量中以逐步(stepwise)方法选取24个变量作为LDA模型的输入建立线性识别模型,病毒蛋白...
关键词:禽流感病毒 编码蛋白 支持向量机(SVM) 线性判别分析(LDA) 径向基函数(RBF) 
新型三维原子场全息相互作用矢量用于几类典型药物体系的QSAR研究被引量:9
《高等学校化学学报》2007年第6期1027-1030,共4页周鹏 梅虎 田菲菲 李志良 
化学生物传感与计量学国家重点实验室基金(批准号:0501201);国家'春晖计划'教育部启动基金(批准号:990404+37)资助
将有机化合物中常见原子按元素周期表的族和杂化状态进行分类,基于药物与受体相互作用的3类非键效应,从分子空间立体结构出发得到了一种新型三维原子场全息作用矢量(3D-HoVAIF).利用该矢量对几类典型药物体系进行了系统的QSAR研究,结果...
关键词:三维原子场全息作用矢量 分子结构表征 定量构效关系 偏最小二乘回归 
采用柔性分子对接技术模拟蛋白质在疏水作用色谱上的保留行为
《中国科学(B辑)》2007年第3期267-273,共7页周鹏 田菲菲 李志良 
国家863计划(批准号:2006AA02Z312)化学生物传感与计量学国家重点实验室基金(批准号:0501201)资助项目
将蛋白质与疏水作用色谱(HIC)固定相相互作用分为直接非键/构象作用和蛋白质表面疏水效应两个热力学过程,从而定量给出了处于浓盐析盐水溶液中HIC保留时间与配基/蛋白质结合自由能之间的二元线性关系.通过ICM柔性分子对接策略及遗传算法...
关键词:疏水作用色谱 柔性分子对接 遗传算法 蛋白质 盐溶因子 
基于大尺度数据库的肽离子迁移谱碰撞截面定量预测模型被引量:1
《化工学报》2007年第4期814-816,共3页周鹏 田菲菲 李志良 
国家"春晖计划"教育部启动基金项目(990104);重庆市应用基础研究基金项目(010306);重庆大学创新基金项目(030101)~~
As the definitions of 36 atomic fragment types in organic compounds,multi-order atom-pair frequency matrix was constructed in terms of atomic fragments occurring in pair at different bond distances,and based on a new ...
关键词:特征原子对全息码 定量构谱关系 离子迁移谱  
基于定量序效模型的计算机辅助虚拟疫苗库设计
《化学学报》2006年第20期2065-2070,共6页周鹏 李志良 田菲菲 张梦军 
化学生物传感与计量学国家重点实验室基金(No.05-12-1);重庆大学创新基金(No.04-10-10);第三军医大学青年教师自主创新基金(No.05-5-28)资助项目.
给出了基于定量序效模型(QSAM)的计算机辅助虚拟疫苗库设计方案,并以此为基础成功组建了一个合理规模的HLA-A*0201限制性CTL表位库,其实现流程如下:(1)从天然氨基酸516种理化性质经主成分分析(PCA)得到一种新的氨基酸描述子:氨基酸综合...
关键词:定量序效模型 虚拟疫苗库 HLA-A*0201分子 CTL表位 遗传算法 
新型广义相关指数与有机化合物沸点相关性研究
《化工学报》2006年第12期2812-2815,共4页周鹏 梅虎 田菲菲 李志良 
国家"春晖计划"教育部启动基金项目(99-1-4);重庆市应用基础研究基金项目(01-3-6);重庆大学创新基金项目(03-5-6)~~
Generalized correlative index (GCI) is a novel user-oriented descriptor for molecular structural representation.By defining generalized correlative function (GCF), property correlative parameters (PCPs) and distance-r...
关键词:广义相关指数 定量构性关系 常压沸点 
支持向量机用于高分子聚合物的折射率预测被引量:1
《应用化学》2006年第12期1410-1412,共3页周鹏 梅虎 田菲菲 李志良 
化学生物传感与计量学国家重点实验室基金(05-12-1);重庆应用基础研究基金(01-3-6);重庆大学创新基金(06-1-10)资助项目
引入支持向量机(SVM)技术对95个高聚物的折射率进行定量构性相关(QSPR)研究,并将其与多元线性回归(MLR)、神经网络(ANN)进行了比较。结果表明,对于小样本非线性问题支持向量机具较强稳定性及泛化能力,多数情况优于传统方法。所得模型复...
关键词:支持向量机 定量构性相关 高聚物 折射率 
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