拟南芥花药表达基因调控关系的预测  

作　　者：黄继风[1] 杨晶晶[2] 王冠[2] 余庆波[2] 杨仲南[2] 

机构地区：[1]上海师范大学数理信息学院,上海200234 [2]上海师范大学生命与环境科学学院,上海200234

出　　处：《科学通报》2008年第17期2054-2059,共6页Chinese Science Bulletin

基　　金：国家自然科学基金(批准号:30530100);上海市教育委员会教育科学研究(批准号:07ZZ60)资助项目

摘　　要：模式植物拟南芥花药的发育由复杂的基因网络所调控.至今为止,研究人员对这一调控网络的了解非常有限.本研究利用一种整合基因芯片数据与启动子序列分析的生物信息学方法来预测拟南芥花药表达基因之间的调控关系.基于这种方法,一共预测到了7710对具有调控关系的基因对,其中80对为高可信度的调控关系.在这80对基因中,有3对调控关系已被之前的实验验证,表明本研究预测的结果有一定的可靠性.我们所预测的基因调控关系有助于拟南芥花药发育分子机理的深入研究,提出的生物信息学研究方法也可用于其他基因调控关系的预测。

关 键 词：拟南芥 花药发育 基因调控网络 生物信息学 基元 

分 类 号：Q943[生物学—植物学]