蛋白质相互作用的文本挖掘研究进展  

Progress in Protein-Protein Interaction with Text Mining

作　　者：张智[1] 张正国[1] 

机构地区：[1]中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院,北京100005

出　　处：《中国生物医学工程学报》2008年第5期764-772,782,共10页Chinese Journal of Biomedical Engineering

基　　金：中华医学基金(CMB03-787)

摘　　要：生物体的生理功能主要由细胞中的蛋白质调控,因此研究蛋白质间的相互作用成为理解生命活动的基础。使用文本挖掘方法研究蛋白质相互作用可以充分利用现有的大量文献揭示出与蛋白质相关的潜在知识,构造蛋白质相互作用网络。着重从相关的语料集和工具、所涉及的技术和方法等方面,对蛋白质相互作用的文本挖掘进行综述,并对研究前景进行展望。The physiological functions of organisms are mainly regulated by proteins in cells,so protein-protein interactions（PPIs） are fundamental to understand biological processes.The researchers can make study on PPI with text mining technology by fully using numerous literatures to reveal the underlying knowledge relevant to proteins and generating PPI networks.In this paper,the research progress in PPI text mining was reviewed according to related corpus and tools, methods and technology.Finally prospects in this field were presented.

关 键 词：文本挖掘 关系抽取 蛋白质相互作用 模式识别 

分 类 号：R318[医药卫生—生物医学工程]