RE-OEM:一种半结构化生物数据的信息抽取模型  

RE-OEM:model for information extraction from semi-structured biological data

作　　者：曹顺良[1] 刘杰[2] 王健[3] 刘念祖[2] 李亦学[4] 

机构地区：[1]上海立信会计学院信息科学系,上海201620 [2]复旦大学管理学院,上海200433 [3]上海大学生命科学院,上海200444 [4]上海生物信息技术研究中心,上海200235

出　　处：《计算机应用研究》2008年第9期2647-2650,2654,共5页Application Research of Computers

基　　金：国家"863"计划资助项目(2006AA02Z334)

摘　　要：在分析半结构化生物数据特点的基础上,提出了一种新的半结构化数据抽取模型RE-OEM。它将OEM数据模型和正则表达式有机地结合起来,不但能够灵活方便地表示各种数据结构,而且能够非常方便地进行模式匹配和数据的定位,为半结构化生物数据的抽取打下坚实基础。In the biological data integration process, it is key to extract information, with specific integration goal in mind, from semi-structured data and represent this information in a structured manner. This paper proposed RE-OEM based on analysis of biological data characteristics. It combined OEM data model and regular expression to represent data structure. It facilitates data extraction from semi-structured biological data by enabling convenient pattern matching and data locating.

关 键 词：半结构化 生物数据 抽取模型 OEM数据模型 正则表达式 

分 类 号：TP393.04[自动化与计算机技术—计算机应用技术]