李亦学

作品数：60被引量：233H指数：8
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供职机构：中国科学院上海生命科学研究院更多>>
发文主题：基因组DNA提取基因组试剂盒引物高灵敏度更多>>
发文领域：生物学医药卫生自动化与计算机技术农业科学更多>>
发文期刊：《高技术通讯》《遗传》《大数据》《科学新闻》更多>>
所获基金：国家高技术研究发展计划国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家科技基础条件平台建设计划更多>>
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前沿信息技术在生物医学大数据中的应用及展望被引量：10
《遗传》2021年第10期924-929,共6页郑广勇 曾涛 李亦学 
中国科学院战略性先导科技专项课题(编号:XDB38050200)资助。
近年来,随着以高通量组学检测技术为代表的生物技术(biological technology,BT)的发展,生物医学研究领域开始进入大数据时代。面对高维度、跨层次、多模态生物医学大数据,科学研究需要数据密集型科研新范式。云计算、区块链、人工智能...
关键词：组学 云计算 区块链 人工智能 数据密集型科研新范式 
基于宫颈上皮与血管特征的阴道镜图像深度学习模型探索被引量：3
《复旦学报（医学版）》2021年第4期435-442,共8页李燕云 王永明 周奇 李亦学 王振 王珏 孟妍 蔡青青 隋龙 华克勤 
上海市科委医学引导类科技支撑项目(19411960100);上海市经济和信息化委员会人工智能创新发展专项(2018-RGZN-02041)。
目的通过识别阴道镜图像中的上皮与血管特征,探讨深度学习的目标检测技术在宫颈癌前病变定位及分类中的可行性。方法收集2018年3月至2019年7月复旦大学附属妇产科医院病理诊断为宫颈低级别(5708例)、高级别(2206例)癌前病变和宫颈癌(514...
关键词：阴道镜 宫颈癌前病变 标准化术语 深度学习 目标检测 
一种由Arid1a蛋白介导的染色体可及性状态调控肝细胞对肝损伤相关的YAP信号的响应被引量：1
《科学新闻》2020年第2期65-65,共1页李维平 杨力光 何强 Chaobo Hu Linying Zhu Xiaolong Ma Xueyan Ma Shujie Bao Lu Li Yingying Chen Xing Deng Xin Zhang Jin Cen Lei Zhang Zhong Wang Wei-Fen Xie 李虹 李亦学 惠利健 
中科院;基金委;科技部;上海市科委等基金资助。
文章简介肝脏是体内最重要的器官之一,由于其代谢解毒功能,经常受到各种外来物质的损伤,导致肝脏的再生能力严重下降。因此,研究肝脏损伤再生及其分子调控机制具有重要意义。最近几年利用谱系示踪技术发现,肝脏损伤后主要是通过肝细胞...
关键词：肝脏损伤 肝细胞 细胞重编程 肝损伤 外来物质 状态调控 门静脉 可及性 
生物医学大数据发展的新挑战与趋势被引量：28
《中国科学院院刊》2018年第8期853-860,共8页张国庆 李亦学 王泽峰 赵国屏 
国家重点研发计划精准医学专项(2017YFC0907505、2017YFC0908405、2016YFC0901904、2016YFC0901604); 中国科学院重点部署项目(ZD-SW-219)
生物医学数据从PB量级的组学时代进入到EB量级的多维度大数据时代,引发了生物医学研究向数据密集型的第四科学范式的深刻变革。如何将临床数据与研究数据进行高维度多层次的汇交共享,实现从"组学"到临床与健康人群数据的生物医学大数据...
关键词：生物医学 大数据 整合 交互 数据挖掘 
宏基因组大数据分析的质量控制流程规范被引量：5
《大数据》2018年第3期1-12,共12页郑广勇 杨桢 曹瑞芳 刘婉 李亦学 张国庆 
国家重点研发计划基金资助项目(No.SQ2017 Y FSF120182,No.2017 Y FC09 07505,No.2016Y FC09 019 04,No.2016YFC0901604);中国科学院微生物组计划基金资助项目(No.KFZD-SW-219-5)~~
宏基因组数据具有数据量大、复杂度高的特点,从数据类型来看,其涵盖了元数据和测序数据。为了保证宏基因组数据后续功能分析的有效性和正确性,需要对这些元数据和测序数据进行严格的质量控制检测。详细描述了宏基因组数据的质量控制流程...
关键词：微生物组 宏基因组 大数据分析 二代测序 质量控制 
忆钟扬,哭钟扬
《世界科学》2017年第11期38-38,共1页李亦学 
2017年9月25日的下午,我正在西安开一个小型的精准医学会议,中科院巴斯德研究研究员郝沛打电话来,因为正在会议中,我掐掉了电话,回了短信说正在开会,问他有什么事情。过了一会短信回来,说：＂钟扬老师今天凌晨在鄂尔多斯突然出车祸去世...
关键词：鄂尔多斯 电话 研究员 巴斯德 中科院 短信 
应用于蛋白质组学的数据非依赖型质谱采集方法及相关算法研究
《中国科技期刊数据库 科研》2015年第12期261-262,共2页张青 李园园 李亦学 
蛋白质组学研究中的数据非依赖型(Data;Independent;Acquisition;DIA)质谱采集方法;是指质谱在采集样品的二级质谱图时,按照设定的方法,采集所有母离子的碎片信息,而不是依赖与先前采集的数据进行母离子的挑选。与传统的数据依赖型(Data...
关键词：蛋白质组学 非依赖型质谱采集 
转化生物信息学研究前沿及挑战被引量：7
《遗传》2015年第7期619-620,共2页赵方庆 方向东 李亦学 
得益于高通量测序技术的长足发展,基因组、表观组和转录组等组学数据呈现出了爆炸式的增长,并且这一趋势将随着技术的发展而进一步延续。目前,全世界每年的生物数据产生总量已经高达EB级。如此海量的数据为我们深入了解生物学过程、疾...
关键词：生物信息学 生物数据 学科基础知识 测序技术 数据分析 通信工程 计算机科学 基因组学 产生总量 生命科学 
基于人类信号转导网络研究卵巢癌病变过程的信号转导模式
《生物物理学报》2015年第3期251-262,共12页曹木水 杨竞 吴素娟 李亦学 李园园 
国家自然科学基金项目(31171268;81272279;91229106);上海市科委基础研究项目(14DZ1951300;14DZ2252000)~~
为了系统地研究卵巢癌病变过程的信号转导模式,综合多种信息构建了完整的人类信号转导网络,发现卵巢癌相关基因在网络中的拓扑学性质与其它基因存在显著差异。将正常、早期卵巢癌和晚期卵巢癌三种状态下的基因表达谱数据映射到信号转导...
关键词：人类信号转导网络 卵巢癌 基因表达谱 网络模体 共表达 
哺乳动物细胞色素P450酶中底物识别位点与功能的进化关系被引量：2
《生物物理学报》2015年第2期154-164,共11页王臖霞 毕杰 卢星宇 王振 李亦学 
国家"973"计划项目(2011CB910204;2011CB510102;2010CB529200);科技部重大仪器专项项目(2012YQ03026108);国家科技支撑计划项目(2013BAI101B09);国家自然科学基金项目(31301032);中国博士后科学基金项目(2013M531226)~~
细胞色素P450（cytochromeP450，CYP）酶存在于所有哺乳动物中，它们从共同的祖先通过基因倍增进化而来，以一种“爆炸性”的趋势形成了庞大的超家族。除代谢脂质等内源性物质外，部分CYP酶还在药物等外源性物质的代谢方面起到重要作用...
关键词：cYP酶 家族规模 活跃亚家族 底物识别位点 进化速率 
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