赵方庆

作品数:19被引量:148H指数:7
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供职机构:中国科学院北京生命科学研究院更多>>
发文主题:藻胆蛋白生物组生物信息学微生物宏基因组更多>>
发文领域:生物学医药卫生化学工程环境科学与工程更多>>
发文期刊:《生物化学与生物物理进展》《生物学通报》《南方医科大学学报》《中国科学院院刊》更多>>
所获基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划中国科学院知识创新工程中国科学院重点部署项目更多>>
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孕期微生物:解密母体微生态,为母婴健康保驾护航
《科学通报》2024年第17期2321-2323,共3页肖力文 周田 左振强 孙宁霞 赵方庆 
怀孕是女性生命中的一段重要时光,是每位准妈妈生命中的一段特殊旅程,它不仅伴随着母亲身体的巨大变化,还涉及母亲微生物组在体内的复杂互动[1,2].微生物组是指生活在我们身体内外的微小生物的总体,包括细菌、真菌和病毒等.这些微生物...
关键词:微生物组 女性生命 微生物群落 母婴健康 微生态 准妈妈 
微生物组测序与分析专家共识被引量:7
《生物工程学报》2020年第12期2516-2524,共9页段云峰 王升跃 陈禹保 杨瑞馥 李后开 朱怀球 童贻刚 杜文斌 付钰 胡松年 王军 辛玉华 赵方庆 鲍一明 张雯 李娟 曾明 牛海涛 周欣 李岩 崔生辉 袁静 李俊桦 王加义 刘东来 倪铭 孙青 邓晔 朱宝利 
国家重点研发计划重点专项项目(No.2018YFC1603903)资助。
在过去的十几年,微生物组相关研究和应用持续升温。微生物组逐渐成为生命科学、环境科学和医学等领域的研究焦点。与此同时,全球多个国家和组织也都积极发起各自的微生物组计划,进行多方面的布局,力争在这一具有广阔前景的领域获得战略...
关键词:微生物组 高通量基因测序 专家共识 国家标准 微生物组计划 
牙菌斑生物膜的形成与控制被引量:25
《微生物学报》2018年第11期1950-1960,共11页乌日汉 郭小娟 王怡 王金锋 赵方庆 
中国科学院重点部署项目(KFZD-SW-219)~~
牙菌斑生物膜是附着于牙釉质表面,由复杂的微生物群落构成的一种聚集体。牙菌斑生物膜的形成与生长对口腔健康有着直接或间接的影响,许多研究证实口腔疾病如龋齿和牙周病都与细菌的积累及牙菌斑的形成有关。在牙菌斑生物膜形态建成过程...
关键词:微生物 牙菌斑 生物膜 龋病 牙周病 
关于中国微生物组数据中心建设的思考被引量:3
《中国科学院院刊》2017年第3期290-296,共7页马俊才 赵方庆 苏晓泉 徐健 吴林寰 
国家"863"计划(2015AA020108)
近年来,美国、欧盟都陆续启动了微生物组相关的研究项目。但微生物组大数据的收集、存储、功能挖掘和开发利用一直是制约微生物组发展的核心问题。文章分析了我国目前在微生物组数据管理中存在着标准不统一、缺乏跨领域的数据整合、高...
关键词:微生物组 标准化 大数据 中国微生物组数据中心 
转化生物信息学研究前沿及挑战被引量:7
《遗传》2015年第7期619-620,共2页赵方庆 方向东 李亦学 
得益于高通量测序技术的长足发展,基因组、表观组和转录组等组学数据呈现出了爆炸式的增长,并且这一趋势将随着技术的发展而进一步延续。目前,全世界每年的生物数据产生总量已经高达EB级。如此海量的数据为我们深入了解生物学过程、疾...
关键词:生物信息学 生物数据 学科基础知识 测序技术 数据分析 通信工程 计算机科学 基因组学 产生总量 生命科学 
百乐克(BIOLAK)活性污泥宏基因组的生物多样性及功能分析被引量:24
《环境科学》2015年第5期1739-1748,共10页田美 刘汉湖 申欣 赵方庆 陈帅 姚永佳 
国家自然科学基金项目(41430643)
百乐克(BIOLAK)是一种在全球范围内得到成功推广的多级活性污泥工艺,然而,迄今对于百乐克工艺的核心元件——活性污泥的生物群落及其功能尚鲜见报道.以连云港市大浦工业区废水处理厂为例,借助于新一代高通量测序技术,获得百乐克活性污...
关键词:百乐克(BIOLAK) 宏基因组 活性污泥 生物多样性 氮代谢 反硝化 
生物大数据可视化的现状及挑战被引量:15
《科学通报》2015年第5期547-557,共11页周琳 孔雷 赵方庆 
国家自然科学基金(31100952;91131013)资助
在过去的10年中,以基因组学、医学遗传学和神经信息学等为代表的生命科学各研究领域,以前所未有的增长趋势,积累了海量的数据信息.这些数据类型复杂、数量庞大,其中蕴含的价值更是不可估量.通过传统的处理手段,难以理清海量原始数据中...
关键词:大数据 生物信息学 可视化 
应用新一代测序技术测定大室别藻苔虫线粒体基因组全序列
《海洋学报》2012年第2期136-142,共7页申欣 田美 朱长保 刘会莲 赵方庆 
国家自然科学基金(40906067);中国科学院基金(Y064021BJ1;0869011BJ5);江苏省"青蓝工程"人才基金(苏教师[2010]27号)
线粒体基因组的获得传统上通常是采取长PCR结合鸟枪法或步移法测序。近年来新一代测序技术蓬勃发展,以454,Solexa和SOLiD测序平台为代表。应用新一代高通量测序技术(Solexa)并结合巢式PCR扩增,完成了大室别藻苔虫(Membranipora grandice...
关键词:大室别藻苔虫 线粒体基因组 新一代测序技术 巢式PCR 基因排列 
海洋链霉菌M518产的新星形孢菌素衍生物的生物活性被引量:4
《高技术通讯》2007年第8期874-879,共6页吴少杰 李富超 秦松 赵方庆 侯艳华 Serge Fotso Heinz H.Fiebig Hartmurt Laatsch 
863计划(2003AA624020)、青岛市科技计划(05-2-JC-56)和江苏省海洋生物技术重点建设实验室开放课题(2005HS002)资助项目.
从海洋放线菌M518中分离到1个新结构化合物N-甲酰胺基-星形孢菌素(N-carboxamido-staurosporine) (1c),以及两个同类型已知化合物星形孢菌素(staurosporine)(1a)和N-甲酰基-星形孢菌素(N-formyl-staurosporine)(1b).为了解...
关键词:星形孢菌素 生物活性 海洋链霉菌 16SrRNA 
Evidence for Positive Darwinian Selection of Vip Gene in Bacillus thuringiensis
《Journal of Genetics and Genomics》2007年第7期649-660,共12页吴金雨 赵方庆 白洁 邓刚 秦松 包其郁 
National Natural Science Foundation of China (No. 30571009).
Vegetative insecticidal proteins (VIPs), produced during the vegetative stage of their growth in Bacillus thuringiensis, are a group of insecticidal proteins and represent the second generation of insecticidal trans...
关键词:Bacillus thuringiensis positive selection sliding window maximum likelihood Vip proteins 
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