张雯

作品数：21被引量：67H指数：5
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供职机构：中国疾病预防控制中心传染病预防控制所更多>>
发文主题：病原菌基因组测序数据库高通量测序更多>>
发文领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术农业科学更多>>
发文期刊：《中国微生态学杂志》《遗传》《江苏大学学报（医学版）》《中国人兽共患病学报》更多>>
所获基金：国家自然科学基金国家科技重大专项艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项国家高技术研究发展计划更多>>
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物种分化因素影响下的巴尔通体差异转录组分析
《遗传》2025年第3期366-381,共16页陈敏 韩娜 缪玉 强裕俊 张雯 刘蓬勃 刘起勇 栗冬梅 
国家自然科学基金项目(编号:31970005);公共卫生应急反应机制的运行-传染病防控(编号:102393220020020000029)资助。
为揭示不同种和不同宿主来源的巴尔通体(Bartonella spp.)转录水平差异及其对进化关系的影响,本研究以来自4种巴尔通体种(汉赛巴尔通体、科勒巴尔通体、克氏巴尔通体和五日热巴尔通体)和3种宿主(家猫、猕猴和人)的共27株巴尔通体菌株为...
关键词：巴尔通体 转录组 物种分化 基因组 系统发育 
纳米孔测序技术在DNA信息存储领域的应用
《江苏大学学报（医学版）》2023年第6期498-501,508,共5页韩娜 黄蕾 强裕俊 彭贤慧 张婷婷 李秀文 张雯 
传染病预防控制国家重点实验室基金(2021SKLID509);国家科技重大专项(2018ZX10712001,2018ZX10305410);生物安全关键技术研发项目(2018YFC1200100)。
脱氧核糖核酸(DNA)存储是一种以人工合成的生物大分子DNA作为信息载体的新型存储技术,具有存储密度高、存储量大、存储时间长、损耗率低等优点,有望成为一种新的数据存储介质。随着DNA合成技术(数据写入)和DNA测序技术(数据读取)的快速...
关键词：纳米孔 测序 DNA 信息存储 信息读取 国产平台 
《基于高通量测序的病原体筛查通用准则》团体标准解读被引量：2
《中国病原生物学杂志》2021年第6期741-742,F0004,共3页韩娜 肖艳 安小平 王媛媛 王营 张雯 任丽丽 童贻刚 
国家科技重大专项(No.2017ZX10103004,2018ZX10305410);生物安全关键技术研发(No.2018YFC1200100);大同市平台基地项目(No.2018181)。
基于高通量测序技术筛查病原体是近年来新兴且极受关注的热点技术,在2020年新冠疫情应对中该技术在病原体筛查中也发挥了重要作用。目前国内多个科研院所、大学、医疗机构都已开展相关的研究和应用工作,然而目前仍缺乏相应的标准化指南...
关键词：高通量测序 病原体 筛查 团体标准 
基于NGS方法评估不同保存条件对粪便样本中菌群含量的影响被引量：1
《中国微生态学杂志》2021年第6期712-717,共6页强裕俊 韩娜 彭贤慧 张婷婷 李秀文 张雯 
国家科技重大专项(2018ZX10305410);生物安全关键技术研发(2018YFC1200100)。
目的评估粪便样本的不同保存条件对肠道微生态研究结果的影响。方法设计相关实验,比较7种不同的保存方法,基于高通量测序技术比对不同时间、不同贮存温度对粪便样本DNA质量、菌群多样性及病原菌检出等结果之间的差异。结果证实了对于粪...
关键词：肠道菌群 高通量测序 粪便 保存条件 
微生物组测序与分析专家共识被引量：7
《生物工程学报》2020年第12期2516-2524,共9页段云峰 王升跃 陈禹保 杨瑞馥 李后开 朱怀球 童贻刚 杜文斌 付钰 胡松年 王军 辛玉华 赵方庆 鲍一明 张雯 李娟 曾明 牛海涛 周欣 李岩 崔生辉 袁静 李俊桦 王加义 刘东来 倪铭 孙青 邓晔 朱宝利 
国家重点研发计划重点专项项目(No.2018YFC1603903)资助。
在过去的十几年,微生物组相关研究和应用持续升温。微生物组逐渐成为生命科学、环境科学和医学等领域的研究焦点。与此同时,全球多个国家和组织也都积极发起各自的微生物组计划,进行多方面的布局,力争在这一具有广阔前景的领域获得战略...
关键词：微生物组 高通量基因测序 专家共识 国家标准 微生物组计划 
一种新的定量16S rRNA基因扩增子测序方法被引量：4
《生物工程学报》2020年第12期2548-2555,共8页韩娜 彭贤慧 张婷婷 强裕俊 李秀文 张雯 
国家重点研发计划(No.2018YFC1200100);国家自然科学基金(No.81700016)资助。
近年来,16S扩增子测序技术被广泛应用于肠道微生物菌群结构和多样性研究,同时也常被用于临床样本中未知病原菌的检测。然而其对样本中物种组成的分辨率只能到属水平的相对丰度,且实验过程中多种因素皆可对结果产生一定影响,如样本起始...
关键词：16S RRNA 扩增子 定量 随机标签 内参 
应用微生物数据分析云平台筛选巴尔通体特异基因及设计探针
《中国媒介生物学及控制杂志》2020年第5期526-530,共5页康央 李庆多 苗娇娇 宋秀平 徐爱玲 张雯 栗冬梅 
国家科技重大专项(2017ZX10303404)。
目的应用微生物数据分析云平台筛选巴尔通体特异基因,并设计巴尔通体属(Bartonella spp.)细菌检测通用引物和探针。方法登录微生物数据分析云平台,选择“Special_Marker_Gene”工作流,上传目标菌基因组序列,设置参数Align(覆盖度)和E(...
关键词：巴尔通体 特异基因 引物设计 云平台 荧光定量PCR 
四环素类耐药基因在不同国家人体、动物和环境微生态中的多样性被引量：12
《中国感染控制杂志》2019年第9期797-802,共6页张婷婷 苗娇娇 强裕俊 李秀文 彭贤慧 张雯 韩娜 
“生物安全关键技术研发”重点专项(2018YFC1200100);国家自然科学基金(81700016);国家科技重大专项(2018ZX10305410、2018ZX10712001、2018ZX10733402)
目的了解四环素类耐药基因在不同国家人体、动物和环境微生态中的分布情况及其多样性。方法利用生物信息学方法,对2 036份不同来源的微生态样本宏基因组测序数据进行四环素耐药基因的鉴定,研究四环素耐药基因在不同来源、不同国别、不...
关键词：宏基因组学 四环素 耐药性 四环素耐药基因 细菌 
侧流层析–重组酶聚合酶扩增技术快速检测土拉弗朗西斯菌被引量：7
《疾病监测》2019年第5期455-459,共5页彭遥 阚飙 夏连续 李伟 张雯 秦爱平 卢金星 
中国疾病预防控制中心传染病所病原菌检测能力建设项目(No.131031102000150003);国家科技重大专项(No.2018ZX10733402)~~
目的利用侧流层析–重组酶聚合酶扩增(LF-RPA)技术建立快速、敏感、特异的土拉弗朗西斯菌(土拉菌)检测方法。方法基于土拉菌特异性基因(tul4)设计重组聚合酶恒温扩增方法的引物及探针,优化反应时间和温度,同时评价该方法的灵敏度及特异...
关键词：土拉弗朗西斯菌 重组酶 重组酶聚合酶扩增 侧流层析 
传染病控制中基因组大数据管理的初步构建被引量：1
《中国媒介生物学及控制杂志》2018年第3期309-312,共4页阳波 王海涛 张婷婷 张雯 曹立娜 李文平 罗成旺 
目的探讨基因组大数据管理架构,提升传染病控制中基因组大数据管理水平。方法收集和参考传染病控制领域基因组大数据的重要科技文献以及政策性资料,采用Delphi法咨询相关专家总结归纳管理要素,建设信息化的管理平台。结果初步构建数据...
关键词：传染病 基因组 大数据 
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