扩增子

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基于肠道菌群和广泛靶向代谢组学的山柰酚抗骨质疏松的作用机制
《中国组织工程研究》2025年第20期4190-4204,共15页梁周 张驰 潘成镇 杨博 蒲张林 刘桦 彭金辉 文立春 凌观汉 陈锋 
广西青年岐黄学者培养项目(GXQH202421),项目负责人:梁周;广西壮族自治区中医药自筹经费科研课题(GXZYK20230695),项目负责人:梁周;广西高校中青年教师科研基础能力提升项目(2024KY0295),项目负责人:张驰;广西研究生教育创新计划项目(YCBXJ2023034),项目负责人:梁周;广西中医药大学引进博士科研启动基金项目(2023BS043),项目负责人:张驰;广西中医药防治骨伤疾病重点研究室(培育)(桂中医药科教发[2023]9号),项目负责人:梁周。
背景:山柰酚具有抗骨质疏松的作用,但山柰酚通过调控肠道菌群、代谢物防治骨质疏松的作用机制尚不明确。目的:基于肠道菌群和广泛靶向代谢组学探究山柰酚抗骨质疏松的可能作用机制。方法:将雌性Sprague-Dawley大鼠18只随机分为假手术组...
关键词:山柰酚 骨质疏松 肠道菌群 16SrDNA扩增子测序 广泛靶向代谢组学 超高效液相色谱-串联质谱 作用机制 大鼠 
杂交探针捕获与扩增子文库构建法对HLA基因分型分辨水平的影响
《中国输血杂志》2025年第3期303-308,321,共7页袁晓妮 张腾腾 李杨 姜雪 杨天杰 鲍晓晶 何军 
国家自然科学基金(82070180);江苏高校血液学协同创新中心(SX21100121)。
目的 比较高通量测序(next generation sequencing, NGS)杂交探针捕获和扩增子文库构建方法,分析HLA基因分型分辨水平的影响因素及临床应用中的前景。方法 选择207例已知分型结果临床标本和能力验证计划标本,确认HLA基因分型结果符合率...
关键词:HLA 高通量测序 等位基因 临床应用 
浙江台州典型电器拆解场地上层和下层土壤微生物群落结构与功能分析
《土壤通报》2025年第1期254-261,共8页方莎莎 张世敏 曾军 吴宇澄 林先贵 
国家重点研发计划项目(2019YFC1804203)。
【目的】电器拆解场地地表污染物可能向下层迁移,了解不同深度土壤微生物群落组成和功能特征有助于评估生物降解潜力。【方法】以浙江省台州市某电器拆解场地为研究对象,设置6个采样点。从土壤柱状样中选取上层(0~1 m)和下层(5~6 m)样品...
关键词:电器拆解场地 16SrRNA基因扩增子测序 宏基因组测序 微生物群落分析 
基于FUNGuild的山药腐烂块茎真菌群落研究及潜在病原真菌的分离鉴定
《广西植物》2025年第2期347-359,共13页展莉平 任雪洋 张笑一 王瑞飞 孔盈利 王强 李明军 杨清香 
中原科技创新领军人才(224200510011);国家现代农业产业技术体系(CARS-21);河南省高等学校重点科研项目(22B180006,20A180015);河南省创新重点项目(202310476022)。
为探讨山药腐烂块茎的真菌群落特征及主要病原真菌,该研究采用ITS扩增子测序技术和FUNGuild分析阐明了其真菌群落组成、网络特征及生态功能类群,并对潜在病原真菌进行了分离鉴定。结果表明:(1)山药腐烂块茎中的优势菌门为子囊菌门(Ascom...
关键词:山药 扩增子测序 真菌群落 FUNGuild 生态功能类群 植物病原真菌 
基于16S rDNA扩增子分析柑橘黄龙病植株叶片中脉内生细菌菌群
《浙江农业科学》2025年第2期440-444,共5页张利平 刘顺民 蒲占湑 朱莉 吕佳 
台州市项目(15ny14)。
文章以黄龙病菌亚洲种为样本分析柑橘黄龙病植株叶片中脉的内生细菌种群,通过对发病样本(HLB)总共24个,空白样本(HC)12个,进行16S rDNA V3-V4区扩增子测序,通过生物信息学分析得到60种有注释的微生物OTU(可认为是60种微生物),发现HC组...
关键词:柑橘黄龙病 16S rDNA 内生细菌 
白枇杷微生物组及其与果实品质的关系
《浙江大学学报(农业与生命科学版)》2024年第6期907-919,共13页赵宇卓 吴碧波 余朝旭 钟莺莺 樊树雷 陈丹 肖谋良 王丽 葛体达 吴愉萍 
浙江省宁波市公益类重点科技项目(2021S013);浙江省宁波市象山县科技计划项目“象山枇杷精准施肥增效关键技术研究与示范”(2022C1018)。
植物微生物组是植物健康和生产力的关键决定因素之一,为宿主植物提供如获取低丰度营养物质、抵抗病原体入侵及适应环境等功能。本研究以白枇杷为研究对象,全面地测定了果实的风味物质和理化指标,并基于16S rRNA扩增子技术分析白枇杷根...
关键词:植物微生物组 白枇杷 果实品质 扩增子测序 生态位分化 
基于16SrRNA扩增子序列研究平凉地区冬小麦根际土壤微生物群落多样性
《农业与技术》2024年第23期20-26,共7页周晓伦 李承毅 陈曦 杨玉珍 高文华 
甘肃医学院青年科研基金项目(项目编号:GYSF2021-09)。
随着冬小麦生长环境的改变、生长季延长、越冬期缩短等,冬小麦种植面积逐年减少,为减少不利因素对农作物生长的影响,合理开发利用平凉地区土壤微生物群落资源,为微生物群落资源的最大利用作出科学判断,对提高农作物产量、增加农民收入...
关键词:16SrRNA 微生物多样性 冬小麦 根际土壤 
感染轮状病毒婴幼儿的肠道菌群特征分析
《江苏预防医学》2024年第6期690-693,704,共5页谢楠 李岚 程鑫田 刘凯洋 王凯 包小兵 
安阳市科技发展计划科技攻关项目(2023C01SF118)
目的了解婴幼儿感染轮状病毒后肠道菌群特征,初步揭示肠道菌群在轮状病毒感染中的作用。方法收集45例<3岁感染轮状病毒婴幼儿(病例组)和30例健康儿童(对照组)粪便标本。对其进行16S rRNA扩增子测序,对肠道菌群特征进行分析。通过生物信...
关键词:轮状病毒 肠道菌群 16S rRNA扩增子测序 婴幼儿 
南海深海底层水和沉积物的细菌群落特征及其环境影响因子
《广东海洋大学学报》2024年第6期59-65,共7页黄柳鑫 侯庆华 曲学鹏 孔德明 
国家重点研发计划(2018YFA0605601);广东海洋大学科研启动经费资助项目(060302032101)。
【目的】探索南海深海底层细菌群落结构及其环境影响因子,为南海生态环境监测提供基础数据资料。【方法】利用16S rRNA高通量测序技术和统计学分析[如α多样性分析、β多样性分析和随机森林模型(Random forest analvsis,RF)分析等],结...
关键词:南海 深海 细菌 16S rRNA扩增子测序 环境因子 
黄瓜基于扩增子测序的TILLING技术体系的建立
《核农学报》2024年第12期2305-2311,共7页厉彦钢 王怡 张孟茹 娄群峰 
江苏省重点研发项目(BE2021357);种业振兴“揭榜挂帅”项目(JBGS2021070)。
定向诱导基因组局部突变(TILLING)技术能够对突变群体中的点突变进行快速筛选,而样品混池深度是影响其效率的主要因素。为提高TILLING的突变检测效率,本研究以甲基磺酸乙酯(EMS)诱变群体构建的突变体库为基础,对其中部分M2代植株进行突...
关键词:黄瓜 扩增子测序 TILLING 生物信息学 突变检测 
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