李园园

作品数：6被引量：24H指数：3
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发文主题：基因组DNA提取基因组引物高灵敏度试剂盒更多>>
发文领域：医药卫生自动化与计算机技术农业科学生物学更多>>
发文期刊：《生物信息学》《应用科学学报》《自然科学进展》《科学通报》更多>>
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基于人类信号转导网络研究卵巢癌病变过程的信号转导模式
《生物物理学报》2015年第3期251-262,共12页曹木水 杨竞 吴素娟 李亦学 李园园 
国家自然科学基金项目(31171268;81272279;91229106);上海市科委基础研究项目(14DZ1951300;14DZ2252000)~~
为了系统地研究卵巢癌病变过程的信号转导模式,综合多种信息构建了完整的人类信号转导网络,发现卵巢癌相关基因在网络中的拓扑学性质与其它基因存在显著差异。将正常、早期卵巢癌和晚期卵巢癌三种状态下的基因表达谱数据映射到信号转导...
关键词：人类信号转导网络 卵巢癌 基因表达谱 网络模体 共表达 
血吸虫血红蛋白降解途径的重构及关键酶蛋白保守结构域的分析
《华东理工大学学报（自然科学版）》2011年第6期706-714,共9页魏佳 李园园 李亦学 于复东 
国家自然科学基金(30900834)
利用生物信息学方法,以疟原虫的血红蛋白降解途径为基础,成功地构建出了日本血吸虫和曼氏血吸虫的血红蛋白降解途径,并对降解途径上的关键酶蛋白的保守结构域进行了序列及结构分析。预测得到的血吸虫血红蛋白降解酶保守结构域,与疟原虫...
关键词：日本血吸虫 曼氏血吸虫 疟原虫 血红蛋白降解途径 保守结构域 
基于Bootstrap方法的基因表达谱数据互信息估计研究
《生物信息学》2009年第1期52-54,共3页徐宏强 王新伟 李园园 罗若愚 
国家自然科学基金(30700164)
基因调控网络模型为深入理解生命本质提供了一个新的研究框架和平台。作为基因调控网络模型的其中一种,互信息关联网络模型使用熵和互信息描述基因和基因之间的关联。本文描述了用互信息度量基因表达相似性的方法,提出基于Bootstrap的...
关键词：基因表达谱数据 互信息 BOOTSTRAP 生物信息学 
预测和分析血吸虫含有EF-hand结构域的表膜蛋白的功能被引量：5
《科学通报》2007年第13期1529-1535,共7页于复东 康斌 李园园 李亦学 
血吸虫病仍然是严重危害人类健康的重要寄生虫疾病之一.在血吸虫中发现一类特殊的表膜蛋白,它们含有EF-hand结构域,但是对它们功能的了解除了可以作为抗原之外几乎一无所知.蛋白-蛋白相互作用、位点特异性变异和糖基化位点修饰等insilic...
关键词：血吸虫 宿主-寄生虫相互作用 表膜蛋白 EF-hand结构域 生物信息学分析 
图形聚类算法的代谢网络模块化分析被引量：7
《应用科学学报》2006年第6期588-592,共5页侯静 宋安平 王卓 张武 李园园 李亦学 
国家"973"重点基础研究发展计划(2002CB713807;2004CB518606;2003CB715900);上海市科委重大基础(04DZ14003)资助项目
代谢网络的研究是当今生物学研究中的新热点,使用图形聚类算法对代谢网络进行分析研究是一个有力的手段.文中提出了用图形聚类方法挖掘复杂代谢网络中蕴含的功能信息并进行模块相似性分析的方法,从系统生物学角度揭示光合作用的进化.介...
关键词：代谢网络 马尔可夫聚类算法 模拟退火聚类算法 模块相似度 
基于语义路径覆盖的Gene Ontology术语间语义相似性度量方法被引量：12
《自然科学进展》2006年第7期916-920,共5页李荣 曹顺良 李园园 谭灏 朱扬勇 钟扬 李亦学 
国家"八六三"计划项目(2002AA231011);上海市科委重大项目(02DJ14013)资助
进行GO(gene ontology)语义相似性度量是解决生物学数据集成中语义异构问题的重要方法。传统方法主要是基于距离的度量和基于信息量的度量。文中提出了一种基于语义路径覆盖的度量方法,并实现了其中Combine算法。该算法首先计算出每个...
关键词：GENE ONTOLOGY 语义相似性度量 信息量 
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