代谢网络

作品数:238被引量:650H指数:12
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代谢功能障碍与免疫微环境关系在肝细胞癌发生发展的作用机制
《中华普通外科学文献(电子版)》2025年第2期124-129,共6页张大山 李贺鹏 蒋福林 商中华 
肝细胞癌(HCC)是最常见的原发性肝脏恶性肿瘤,其复杂的发病机制一直是研究的热点。随着代谢功能障碍与肿瘤免疫微环境相互作用的深入探索,越来越多的证据表明两者在肿瘤演进、免疫逃逸以及免疫治疗反应中发挥着关键作用。代谢功能障碍...
关键词:代谢功能障碍 代谢网络和途径  肝细胞 免疫微环境 肿瘤逃逸 免疫疗法 
细胞生理代谢网络模型重构和优化的进展
《生物工程学报》2025年第3期1112-1132,共21页肖陆驰 鲁洪中 
国家重点研发计划(2022YFA0913000);上海市浦江人才计划;国家自然科学基金(22208211,22378263)。
细胞中自发或由酶催化的代谢反应组成了高度复杂的代谢网络,其与细胞生理代谢活动运作密切相关。细胞生理代谢网络模型的重构有助于从系统层面上解析基因型与生长表型之间的关联,为细胞生理代谢活动精准刻画与生物绿色制造等研究提供重...
关键词:基因组尺度代谢网络模型 动力学模型 酶约束代谢模型 深度学习 
基于CRISPR-Cas系统的微生物基因编辑与调控技术
《微生物学杂志》2024年第6期1-14,共14页刘嵘明 谭慧萍 王晴晴 张皓喃 孜力汗 梁丽亚 
国家重点研发计划项目(2023YFC3402300);国家自然科学基金项目(22208044,22278058);“兴辽人才计划”项目(XLY-C2203075);大连市科技创新基金项目(2023JJ12SN030);大连理工大学基本科研业务医工交叉项目(DUT23YG219,DUT24YG131)。
CRISPR-Cas系统的基因编辑与调控技术为原核和真核微生物的遗传改造提供了高效且精确的工具,显著提升了工业底盘细胞的生产能力和多样性。在原核微生物中,大肠杆菌、枯草芽孢杆菌、谷氨酸棒杆菌等工业重要菌株通过CRISPR-Cas系统实现了...
关键词:CRISPR-Cas系统 微生物 基因编辑 碱基编辑 代谢网络 高通量基因组编辑 细胞工厂 
冬凌草甲素对食管鳞状细胞癌细胞内谷胱甘肽代谢网络影响的研究
《上海中医药杂志》2024年第7期77-82,94,共7页王敏丹 刘莉 崔夏莲 韦懿芯 张雯雯 陈秀萍 张芳 冯陈国 
上海市自然科学基金项目(23ZR1460900)。
目的探究冬凌草甲素(ORI)对人食管鳞状细胞癌(ESCC)细胞KYSE-150内谷胱甘肽代谢网络(GMN)中13个主要代谢物的影响,包括半胱氨酸(Cys)、高半胱氨酸(HCys)、谷胱甘肽(GSH)、甲硫氨酸(Met)、S-腺苷高半胱氨酸(SAH)、胱硫醚(Cysta)、甘氨酸(...
关键词:食管鳞状细胞癌 冬凌草甲素 谷胱甘肽 活性氧 代谢组学 中药研究 
通过神经—内分泌—免疫—代谢网络互作维持的自愈体系理解中医药学原理被引量:2
《中国科学基金》2024年第3期492-500,共9页刘欣安 贾艺聪 王立平 
国家自然科学基金重点项目(32230042LW)、面上项目(32371213XL);广东省基础与应用基础研究基金(2022A1515110624YJ)的资助。
中医药现代化是新时代生命科学的分支内容,也是全球前沿科学的重要方向之一。中医观点中“正气存内,邪不可干”,是指人体正气足,外邪就无法入侵导致疾病。中医的“正气”指的是机体免疫力,是机体自愈力的来源。现代前沿科学认为,机体通...
关键词:神经—内分泌—免疫网络 中药现代化 藏象学说 自愈体系 
传统发酵食品中合成微生物组的网络构建
《食品工业》2024年第6期301-304,共4页周晓龙 
在传统食品发酵过程中,天然微生物群的波动导致了食品质量的不稳定性。目前食品行业在发酵过程中出现微生物代谢不可控、安全性、功能性、资源利用率等诸多问题,利用核心微生物组的网络构建和发酵动力学调控技术研究复杂微生物种群之间...
关键词:传统发酵 合成微生物组 代谢网络 动力学模型 
乳头状甲状腺癌组织中SPCS 2基因表达水平及其意义
《精准医学杂志》2024年第2期159-162,166,共5页陈澎涛 项承 
国家自然科学基金资助项目(81701727)。
目的探讨信号肽酶复合体亚基2(SPCS 2)基因在乳头状甲状腺癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)组织中的表达水平及其意义。方法利用UALCAN及HPA数据分析平台评估PTC组织和正常组织中SPCS 2基因表达水平。在Gepia数据库预测SPCS 2基因...
关键词:甲状腺癌 乳头状 基因表达 SPCS 2基因 预后 线粒体 氧化磷酸化 代谢网络和途径 
低聚木糖对高脂饮食致脂肪肝小鼠的保护作用及其机制
《精准医学杂志》2024年第2期108-113,119,共7页李翰卿 李宇鹍 张震 田字彬 齐兴四 
国家自然科学基金面上项目(81970461)。
目的探讨低聚木糖对高脂饮食所致脂肪肝小鼠的保护作用及机制。方法5周龄C57/BL6J雄性小鼠40只,随机分为4组,每组10只。低脂饮食对照组(LFD组)和高脂饮食模型组(HFD组)分别喂饲脂肪含量10%的低脂饲料和脂肪含量60%的高脂饲料,高脂饮食+...
关键词:寡糖类 益生元 非酒精性脂肪性肝病 胃肠道微生物组 脂类代谢 代谢网络和途径 
融合原子交换特征信息的代谢路径预测
《计算机工程与设计》2024年第4期1087-1092,共6页黄毅然 万志远 钟诚 
国家自然科学基金项目(61862006、61861004);广西自然科学基金项目(2020GXNSFAA159074)。
为获取从任意起始代谢物到目标代谢物的生化相关性较好的代谢路径,提出一种融合原子交换特征信息的基于约束的代谢路径预测算法PVA。结合代谢网络中具有的原子交换特征信息,建立一种基于约束的混合整数线性规划(MILP)代谢路径预测模型,...
关键词:代谢网络 代谢路径预测 原子交换 混合整数线性规划 化学计量 路径优化 代谢工程 
不同代谢目标下甘油代谢通量分布的模型与计算
《应用数学进展》2024年第1期76-83,共8页王梦婷 张政颖 
胞内代谢通量的估计可为理解细胞代谢提供帮助。本研究针对肺炎克雷伯式杆菌甘油代谢,以最大化生物量和最大化ATP作为性能指标函数,以代谢通量作为决策变量,并将代谢通量平衡作为约束条件,建立数学规划模型,用以估计连续培养下不同代谢...
关键词:通量分布 代谢网络 甘油代谢 线性规划 
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