保守结构域

作品数:75被引量:209H指数:7
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黍子SRS基因家族的全基因组鉴定与表达分析
《草业科学》2024年第9期2035-2045,共11页李佳祯 杨梦珂 宋晓涵 王月 王禹茜 王世纪 张美春 邓欣 王红艳 
国家自然科学基金项目(31100172);辽宁省科技厅自然科学基金计划面上项目(2022-MS-174);辽宁省教育厅重点攻关项目(JYTZD2023067);辽宁省博士科研启动基金计划项目(2021-BS-082)。
植物特异性SHI-related sequence(SRS)转录因子在调控植物生长发育、激素生物合成和胁迫反应中起着至关重要的作用。本文研究了黍子(Panicum miliaceum)SRS基因家族(PmSRS),利用生物信息学方法分析了PmSRS的结构和功能,并通过转录组数...
关键词:生物信息学分析 比较基因组学 系统发育分析 保守结构域 转录组 黍子 
工业大麻CsIAA1基因克隆及表达分析
《中国麻业科学》2024年第4期213-221,228,共10页杨晓娟 阳锡涛 苏雨娟 黄彤 刘婕 高泽昕 栾明宝 潘根 黄思齐 
中央科研院所基本科研业务费(1610242021006)。
研究以工业大麻云麻7号(Y7)为材料,克隆CsIAA1(Auxin-responsive protein IAA1)基因,通过生物信息学分析CsIAA1序列特征,经RT-qPCR研究CsIAA1组织特异性表达模式;结果表明,CsIAA1基因的CDS全长为621 bp,编码了206个氨基酸,含AUX_IAA保...
关键词:工业大麻 CsIAA1 氨基酸序列 保守结构域 表达量 
呼吸道合胞病毒G蛋白功能的研究进展
《微生物学免疫学进展》2024年第1期79-83,共5页张勇侠(综述) 周觉非(审校) 
呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus, RSV)是全球≤5岁儿童严重下呼吸道感染的主要病原之一,在免疫功能低下人群(尤其是≥65岁老年人)中反复感染往往会导致严重疾病甚至死亡。因此,研发安全、高效的预防性药物和疫苗是预防RSV...
关键词:中心保守结构域 基序 嗜酸性粒细胞增多症 发病机理 趋化因子受体 糖胺聚糖 
双孢蘑菇中一种4R型MYB转录因子的基因克隆和生物信息学分析
《食品研究与开发》2024年第2期185-194,共10页刘翔 赵紫璇 赵月盈 赵诗睿 贾子怡 姜含越 袁帅 孟德梅 
国家自然科学基金(32372391、31501544);国家级大学生创新创业训练计划资助项目(202310057218)。
MYB转录因子广泛存在于真核生物中,在植物的生长发育、逆境胁迫等过程中发挥重要作用。与植物相比,对食用菌中MYB转录因子的研究有限。为探究MYB转录因子在食用菌中的生物学功能,对前期转录组发现的一个编码双孢蘑菇(Agaricus bisporus)...
关键词:双孢蘑菇 MYB转录因子 基因克隆 生物信息学分析 保守结构域 
芹菜CESA基因鉴定与表达分析
《河北师范大学学报(自然科学版)》2023年第6期611-619,共9页郭新月 张红梅 刘洪博 李艳玲 张晴 袁敏 
河北省自然科学基金(C2020209020);河北省重点研发计划项目(20326513D)。
纤维素是植物细胞壁的主要成分,纤维素合成酶是纤维素合成过程中的重要酶类.通过生物信息学方法对芹菜纤维素合成酶(Apium graveliens cellulose synthases A,AgCESA)基因家族进行了全基因组水平的鉴定,共获得了11个AgCESA基因家族成员...
关键词:芹菜 CESA基因家族 保守结构域 顺式作用元件 组织表达 
三七SBP转录因子基因家族鉴定与生物信息学分析被引量:3
《中成药》2023年第6期2073-2079,共7页潘建英 张诗焉 郭宜欣 唐诗成 邓伟 张子龙 
国家自然科学基金资助项目(82274090)。
目的鉴定三七SBP(PnSBP)家族,并分析其蛋白序列特征、功能特性及表达模式。方法采用生物信息学方法,从三七基因组文件中鉴定出具有完整开放阅读框的PnSBP基因,对其蛋白理化性质、亚细胞定位、保守基序(motif)、启动子顺式元件、蛋白互...
关键词:三七 SBP转录因子 基因家族鉴定 生物信息学 保守结构域 
葫芦科作物抗氧化基因的全基因组鉴定及分析被引量:2
《江苏农业科学》2023年第8期51-61,共11页钱玉磊 闫晋强 刘文睿 吴智明 谢大森 江彪 
国家自然科学基金(编号:31972403、32102406);广东省农业科学院中青年学科带头人项目(编号:R2020PY-JG003);广东省农业科学院优秀博士项目(编号:R2021YJ-YB2004)。
抗氧化(oxidation resistance, OXR)基因是含有TLDc结构域的一类基因,能有效清除活性氧,在抗氧化过程中发挥着重要作用。基于葫芦科基因组数据库,从6个葫芦科作物中共鉴定出37个OXR成员,其中冬瓜、西瓜、甜瓜、葫芦和黄瓜均有6个成员,...
关键词:葫芦科 OXR基因 保守结构域 顺式作用元件 生物信息学 表达谱 亲缘关系 
黑斑原鮡(Glyptosternum maculatum)皮肤RNA-Seq数据中补体样组分分析
《高原科学研究》2022年第2期1-10,共10页张颖 马波 李宝海 尹家胜 储明星 
博士后面上基金项目(2017M623324XB);西藏重点水域渔业资源与环境调查专项项目(xz03-2018)。
黑斑原鮡为我国雅鲁藏布江特有鱼类,其皮肤补体系统在适应低温、急流水域特性中发挥着重要的作用。文章基于前期RNA-Seq数据检索黑斑原鮡(Glyptosternum maculatum)皮肤补体样组分,并对其结构域及高温应激后的基因表达水平进行了分析。...
关键词:黑斑原鮡 RNA-SEQ 补体样组分 保守结构域 
白菜、甘蓝和甘蓝型油菜PAP1/2同源基因的鉴定及分析
《园艺学报》2022年第6期1301-1312,共12页陈道宗 刘镒 沈文杰 朱博 谭晨 
江西省自然科学基金项目(20212BAB215002);国家自然科学基金项目(32160454);赣州市科技计划项目(赣市科发[2020]60号)。
PAP1/2转录因子是参与形成MBW复合体从而调控花青素合成的主要MYB转录因子。以拟南芥PAP1/2转录因子核酸和蛋白序列比对及Pfam验证,研究白菜、甘蓝和甘蓝型油菜等芸薹属植物中PAP1/2转录因子调控花青素代谢的确切同源拷贝数、进化关系...
关键词:白菜 甘蓝 甘蓝型油菜 同源基因 保守结构域 花青素 R2R3-MYB转录因子 PAP1/2 
Elp3基因缺失对酿酒酵母咖啡因耐受性的影响被引量:1
《河南师范大学学报(自然科学版)》2022年第2期143-149,共7页胡孟可 吴秀丽 李芬 
国家自然科学基金(30600343);河南省高校科技创新团队支持计划(13IRTSTHN009).
过量咖啡因(Caffeine,CAF)对真核细胞有毒害作用.Elp3是组蛋白乙酰转移酶Elongator复合物的催化亚基,其缺失会影响Elongator的功能,进而使酵母产生对CAF敏感表型.为研究酿酒酵母CAF耐受性,以不同浓度CAF处理野生型、elp3⊿及转入完整和...
关键词:咖啡因耐受性 酿酒酵母 ELP3 SSA3 保守结构域 
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