三七SBP转录因子基因家族鉴定与生物信息学分析  

作　　者：潘建英 张诗焉 郭宜欣 唐诗成 邓伟[2] 张子龙[1] 

机构地区：[1]北京中医药大学,北京102488 [2]重庆大学,重庆401331

出　　处：《中成药》2023年第6期2073-2079,共7页Chinese Traditional Patent Medicine

基　　金：国家自然科学基金资助项目(82274090)。

摘　　要：目的鉴定三七SBP(PnSBP)家族,并分析其蛋白序列特征、功能特性及表达模式。方法采用生物信息学方法,从三七基因组文件中鉴定出具有完整开放阅读框的PnSBP基因,对其蛋白理化性质、亚细胞定位、保守基序(motif)、启动子顺式元件、蛋白互作网络、表达模式进行分析。结果共鉴定出33个PnSBP基因,均具有SBP-box结构域,系统进化树将拟南芥、水稻、三七的SBP基因共分为8个亚家族,PnSBP启动子有许多激素响应元件及MYB转录因子结合位点,表达分析发现摘蕾会引起6个PnSBP基因在芦头与主根中的表达升高,推测PnSBP家族可能参与调控三七皂苷的生物合成。结论本研究对PnSBP转录因子家族进行全基因组鉴定,初步筛选了在摘蕾后在主根与芦头表达升高的,转录调控皂苷生物合成过程的PnSBP基因。

关 键 词：三七 SBP转录因子 基因家族鉴定 生物信息学 保守结构域 

分 类 号：R282[医药卫生—中药学]