基于DNA分子标记数据构建系统进化树的新策略  被引量:29

A new strategy for construction of Phylogenetic tree based on DNA molecular mark data

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作  者:李亚玲[1,2] 韩国民[3] 何沙娥[1] 张智俊[1] 

机构地区:[1]浙江林学院浙江省现代森林培育技术重点实验室,杭州311300 [2]浙江林学院农业与食品科学学院,杭州311300 [3]南京大学生命科学学院,南京210092

出  处:《生物信息学》2008年第4期168-170,共3页Chinese Journal of Bioinformatics

基  金:浙江省森林培育重中之重学科开放课题;浙江林学院人才引进项目

摘  要:结合DPS软件和MEGA软件优点,进行DNA分子标记数据处理和系统发育树构建的新策略:首先使用DPS软件进行0,1数据系统聚类方法获得遗传距离矩阵,然后将此矩阵输入MEGA3,利用NJ或者UPGMA进行系统进化树的构建和树的优化。该方法操作简单,得到的树形美观。A new strategy was used for construction of Phylogenetic tree based on DNA molecular mark data by combined DPS statistic software and MEGA software. Firstly, computed phylogenetie distance matrix in DPS software from 0,1 data, and then imported the matrix into MEGA. Finally, phylogenetic tree was constructed by NJ/UPGMA methord.

关 键 词:DPS MEGA DNA分子标记 进化树构建 

分 类 号:Q522.6[生物学—生物化学]

 

参考文献:

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