7株B亚属人腺病毒纤维基因特征分析  被引量:1

Fiber genetic characteristics of 7 human adenovirus isolates

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作  者:唐浏英[1] 张丽丽[2] 朱贞[1] 许文波[1] 

机构地区:[1]中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,北京100052 [2]首都医科大学附属北京儿童医院

出  处:《中华微生物学和免疫学杂志》2009年第1期62-64,共3页Chinese Journal of Microbiology and Immunology

摘  要:目的了解本实验室2004—之006年分离的7株B亚属腺病毒(adenovims,Ad)的纤维基因特征,并与日本、韩国腺病毒分离株的纤维基因进行比较。方法2004-2006年间,本实验室从上呼吸道感染儿童散发或暴发病例中分离到7株腺病毒毒株,首先对六邻体蛋白基因扩增和序列分析进行基因分型,随后用PCR扩增纤维蛋白基因,进行序列测定,构建亲缘性关系进化树,并对其基因特征进行分析。结果7株腺病毒分离株均属于B亚属,其中有3株为Ad3型,所测定的纤维蛋白基因的核苷酸同源性为98.9%-100%,与2003年中国广州分离株DQ099432和2003年韩国分离株AY224416的同源性为100%;3株为Ad7型,纤维蛋白基因核苷酸同源性为97.6%~100%,与2006年日本分离株AB243119的同源性为97.4%,与2000年韩国分离株AY921620的同源性为100%;1株为Ad11型,与GenBank序列号为L08232的1993年瑞典分离株纤维蛋白基因同源性为100%。结论2004—2006年,北京地区上呼吸道感染散发病例,Ad3和Ad7纤维基因核苷酸变异不大,同时证实本研究用纤维基因片段,与六邻体基因分型具有相同的结果。Objective To analyze the genotypes of adenovirus (Ad) strains isolated from young children with acute respiratory infection syndrome during 2004--2006. Methods Seven human adenovirus strains isolated during 2004 and 2006 were detected with tissue culture, PCR with adenovirus specific-prim- ers and sequencing for hexon and fiber genes. Results The results showed that all 7 adenovirus strains be- longed to adenovirus genera B, 3 of the 7 isolates were Ad3, BJ060605-1, BJ060316-2 and BJ040228 had high homology of nucleic acid, 98.9%-100%. Three of 7 were Ad7, the homology of nucleic acid of BJ050520, BJ06042I-4 and BJ040226 were 97.6% -100%. Strain SX060418-1 was 100% homologie with Adl 1 strain 108232 (GenBank). Conclusion Little variation of fiber gene was found for 2004 to 2006 iso- lates and the typing with fiber sequencing is similar with that of hexon gene of adenovirus isolates.

关 键 词:腺病毒 纤维基因 基因特征 

分 类 号:R[医药卫生]

 

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