功能歧化分析揭示代谢型谷氨酸受体亚家族VFTM的分化决定位点  

Functional Divergence Analysis Reveals the Determinant Sites of the VFTM of Metabotropic Glutamate Receptor Subfamily

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作  者:曹建华[1] 刘剑峰[1] 

机构地区:[1]华中科技大学生命科学与技术学院分子生物物理教育部重点实验室,湖北武汉430074

出  处:《生物技术通讯》2009年第2期155-160,共6页Letters in Biotechnology

基  金:国家高技术研究发展计划(2007AA02Z300)

摘  要:目的:研究哺乳动物代谢型谷氨酸受体(mGluR)亚家族捕蝇夹结构模块(VFTM)的系统进化形式,确定其VFTM的功能分化决定位点。方法:通过基于系统进化的功能歧化分析,根据贝叶斯模型计算VFTM的选择性限制位点,推测功能分化决定位点。结果:mGluR亚家族VFTM的祖先通过2次基因复制,在不同的氨基酸位点进行选择性限制,形成3组不同的mGluR亚家族成员。结论:不同功能分化决定位点的选择性功能歧化塑造了mGluR亚家族VFTM的结构与功能,为进一步研究mGluR亚家族的激活机制奠定了基础。Objective: To investigate the evolutionary pattern of Venus flytrap module(VFTM) of metabotropic glutamate receptor(mGluR) subfamily and validate the determinant sites involved functional divergence. Methods: The' functional divergence analysis based on the evolutionary pattern of VFTM was used to identify the determinant sites involved functional divergence according to the Bayesian post probability model. Results: The constraints on different sites were resulted in the three groups of mGluR via two continuous gene duplication events. Conclusion: The selective functional constraints on the determinant sites shaped the structures and functions of the VFTM of mGluR subfamily, which shed light on the activation mechanism of mGluR subfamily.

关 键 词:G蛋白偶联受体 代谢型谷氨酸受体 捕蝇夹结构模块 功能歧化 系统进化 

分 类 号:Q111[生物学—普通生物学] Q71

 

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