基于微阵列数据构建的基因通路分析软件的研究进展  

Research Progress of Various Soft-wares Constructed for Gene pathway Analysis based on Microarray Data

作　　者：周才秀[1] 王忠[1] 荆志伟[1] 谢力[2] 胡木林[1] 

机构地区：[1]中国中医科学院中医临床基础医学研究所,北京100700 [2]中南大学湘雅医院中西医结合研究所,湖南长沙410008

出　　处：《现代生物医学进展》2009年第7期1352-1355,共4页Progress in Modern Biomedicine

基　　金：国家科技支撑计划课题(2006BAI08B04)

摘　　要：如今生物信息学领域有一个共识,即基因组学和蛋白组学研究产生了爆炸性的微阵列数据,如何利用这些数据构建基因调控网络也成为一个研究热点。文章利用相关的软件平台实现对基因调控网络的构建,并对网络进行分析,在生物信息学、系统生物学、生物医学等领域起着重要的作用。通过综合分析各种软件的特点,有利于帮助研究者根据自己的需要进行合理的选择。Nowadays, genomics and proteomics research have produced explosive microarray data. Based on these data, constructing gene regulatory networks has become a hotspot. In this paper, we presented the relative software and platforms to construct gene regulatory networks, which played a significant role in bioinformatics, system biology, biomedicine area and so on. By comprehensively evaluating each kind of software, the goal of this review was to help the researchers to use these soft-wares effectively and further to develop more suitable soil-wares.

关 键 词：通路 软件 网络 可视化 

分 类 号：Q78[生物学—分子生物学] TP311.52[自动化与计算机技术—计算机软件与理论]