膀胱癌表达谱的全基因组芯片检测及易感标志基因的筛选研究  

作　　者：赵镇[1] 毛向明[2] 陈清[1] 聂军[1] 李建栋[1] 朱文昌[1] 石嵘[3] 俞守义[1] 

机构地区：[1]南方医科大学热带与公共卫生学院,广东广州510515 [2]南方医科大学南方医院泌尿外科,广东广州510515 [3]南方医科大学基因工程研究所,广东广州510515

出　　处：《南方医科大学学报》2009年第5期1026-1029,共4页Journal of Southern Medical University

摘　　要：目的采用70mer全基因组寡核苷酸基因芯片研究膀胱癌基因表达谱,获得差异基因并筛选出膀胱癌特异的肿瘤易感标志基因。方法取正常膀胱移行上皮、肌层浸润性(T2以上)膀胱癌组织各10例,抽提mRNA逆转录成cDNA后,再反转录成cRNA并标记后,与70mer oligo全基因组基因芯片杂交,洗脱,扫描及数据分析,采用Cluster及Treeview等统计分析软件比较正常膀胱移行上皮与膀胱癌组织基因表达谱差异,获得差异基因及其表达差异水平。进一步采用Panther数据库检索差异基因在各信号通路中的存在情况,初步阐述浸润性膀胱癌发生的可能的分子机制,筛选出膀胱癌特异的肿瘤标志基因。结果在19568个探针的全基因组芯片上,发现膀胱癌基因表达谱共同差异表达基因152个,其中表达上调的基因70个(膀胱癌中上调10倍以上的29个),与肿瘤发生明确相关的基因23个;下调基因81个(膀胱癌中下调10倍以上的16个),与肿瘤发生明确相关的基因17个;通过Panther数据库检索,发现上调基因涉及32条信号通路,下调基因涉及38条信号通路,其中部分信号通路已被证实与肿瘤发生密切相关。结论采用70mer oligo全基因组基因芯片分析膀胱癌基因表达谱,获得的差异表达基因及膀胱癌标志基因,对膀胱癌发生机理阐明、早期诊断以及人群基因易感性预测的前瞻性研究具有重要意义。

关 键 词：膀胱癌 基因表达谱 基因芯片 

分 类 号：R737.14[医药卫生—肿瘤]