基于DNA序列混沌游戏表示的相似性分析  

Similarity Analysis Based on Chaos Game Representation of DNA Sequence

作　　者：石龙[1] 黄海兰[2] 

机构地区：[1]中南林业科技大学理学院,湖南长沙410004 [2]湘潭大学数学与计算科学学院,湖南湘潭411105

出　　处：《吉首大学学报（自然科学版）》2009年第3期31-34,共4页Journal of Jishou University(Natural Sciences Edition)

基　　金：湖南省教育厅科学研究项目(08C882)

摘　　要：基于DNA序列的混沌游戏表示,利用对应测度矩阵的最大特征值组成的6维向量来刻画DNA序列,并利用向量间的相关距离对11种物种的beta球蛋白基因的第1个外显子编码序列进行相似性分析,所得结果与生物学中的进化关系基本一致.Based on chaos game representation of DNA sequence,the authors obtain a 6-component vector whose elements are the leading eigenvalues of corresponding measure matrices to represent the DNA sequence. The correlation distances among introduced vectors are applied to compare the similarities of the coding sequences of the first exon of beta globin gene of 11 different species. The results are basically coincident with their evolutionary relationship.

关 键 词：DNA序列 混沌游戏表示 测度 相关距离 相似性分析 

分 类 号：O29[理学—应用数学] Q751[理学—数学]