基于Web Service的蛋白质相互作用网络PSE  

Protein-protein interactions network PSE based on web service

作　　者：赵志康[1] 谢江[1,2] 李松倍[1] 张武[1,2] 

机构地区：[1]上海大学计算机工程与科学学院,上海200072 [2]上海大学系统生物技术研究所,上海200072

出　　处：《计算机工程与设计》2009年第18期4326-4329,共4页Computer Engineering and Design

基　　金：上海市重点学科建设基金项目(J50103);上海大学系统生物研究基金项目(SBR08001)

摘　　要：为了让蛋白质相互作用网络研究人员高效共享大量的生物实验数据和方便的利用与蛋白质相互作用网络相关的各种工具及方法,提出了一个基于Web Service的面向蛋白质相互作用网络PSE的方法。通过分析蛋白质相互作用网络研究的特点,指出面向蛋白质相互作用网络PSE需要基于Web Service技术。在此基础上,设计了面向蛋白质相互作用网络PSE的体系结构,体系结构符合SOA(service-oriented architecture)的标准要求,具有很好的可扩展性。实验结果表明了面向蛋白质相互作用网络PSE的有效性。To enable researchers on PIN （protein-proteininteractionsnctwork） to share large amounts of biological data efficianfly and use kinds of tools and methods conveniently, the protein-protein interactions network PSE based on web service is mentioned. First, after analyzing the characteristics of protein-protein interactions network research, the protein-protein interactions network PSE must use the web service technology. Then, the system structure of the PSE is given, which is based on SOA （service-oriented architecture） that enables the PSE to be expanded easily. Finally, validity of the protein-protein interactions network PSE is verified by experiment.

关 键 词：问题求解环境 蛋白质相互作用网络 Web服务 JNI JAVABEAN 

分 类 号：TP393[自动化与计算机技术—计算机应用技术]