蛋白质相互作用网络

作品数：176被引量：317H指数：8
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基于铁死亡相关基因构建心肌缺血-再灌注损伤的分子网络及其验证分析
《南昌大学学报（医学版）》2024年第6期42-49,79,共9页徐聪聪 叶燕平 黄晓梅 
江西省卫计委科技计划项目(20185214)。
目的探索心肌缺血-再灌注(I/R)损伤中铁死亡相关基因的表达及功能,通过构建分子网络及其验证分析,为心肌I/R损伤的治疗提供新的分子靶点。方法对GSE108940数据库中的基因表达数据进行标准化处理,利用火山图和热图筛选差异表达基因(DEGs...
关键词：心肌缺血-再灌注损伤 铁死亡 差异表达基因 功能富集分析 蛋白质相互作用网络 
基于临床生物信息学的白藜芦醇对自闭症谱系障碍的潜在治疗意义
《护理研究》2024年第21期3768-3778,共11页吕艳华 钟小云 王康龙 赵宏霞 于琦 
国家社会科学基金一般项目,编号:20BTQ064。
目的:基于临床生物信息学探讨白藜芦醇对自闭症谱系障碍(ASD)的潜在治疗作用。方法:从基因表达综合数据库(GEO)中获取白藜芦醇和ASD的全基因组表达谱数据;分别对白藜芦醇和ASD的全基因组表达谱数据进行差异基因分析、基因本体(GO)富集...
关键词：白藜芦醇 自闭症谱系障碍 差异基因分析 富集分析 蛋白质相互作用网络 领域知识得分 临床生物信息学 
有氧运动对伴随衰老代谢综合征基因表达的调控
《西北民族大学学报（自然科学版）》2023年第3期45-53,共9页宋雷 蒋文杰 
中央高校基本科研业务费项目(31920220113);甘肃省自然科学基金项目(21JR11RA016);西北民族大学2022年校级大学生创新创业训练计划项目(X202210742321)。
目的:探索有氧运动对代谢综合征患者血液基因表达的影响,分析运动前后血液转录表达谱的差异,研究差异表达基因涉及的功能与内在联系.方法:从美国国立生物技术信息中心(NCBI)公共基因芯片数据平台(GEO)下载GSE10540数据集mRNA芯片数据,对...
关键词：生物信息学 有氧运动 代谢综合征 蛋白质相互作用网络 
基于边权重信息深度网络嵌入的PPIN功能模块检测被引量：2
《计算机工程》2023年第8期69-76,共8页李泽水 冀俊忠 杨翠翠 
国家自然科学基金(61375059)。
现有基于网络嵌入的蛋白质相互作用网络(PPIN)功能模块检测方法通常仅对蛋白质节点信息进行网络嵌入,并未对蛋白质间的边权重信息进行网络嵌入,导致蛋白质功能模块检测质量不理想。针对该问题,提出一种基于边权重信息深度网络嵌入的PPI...
关键词：蛋白质相互作用网络 功能模块检测 深度学习 网络嵌入 核心附属聚类 
基于生物信息学方法筛选前列腺癌中的关键表达基因及其对预后影响的分析被引量：2
《现代泌尿生殖肿瘤杂志》2023年第3期182-184,共3页张冠 杨登科 
前列腺癌是男性泌尿生殖系统最常见的恶性肿瘤之一,其发病率呈逐年升高趋势,很多患者在初诊时已属中晚期。临床诊疗中,患者在接受常规的内分泌治疗无效后会面临疾病进展、生活质量下降、生存期缩短等问题[1],一部分病例经内分泌治疗、...
关键词：内分泌治疗 COX回归分析 前列腺癌 预后影响 诊疗思路 疾病进展 蛋白质相互作用网络 生存分析 
基于蛋白质相互作用网络的肺癌骨转移基因识别方法
《计算机与数字工程》2023年第5期1108-1112,共5页杨天濠 王新赠 
肿瘤转移通常发生在癌症晚期,是一个复杂且致命的过程,发现与肿瘤转移相关的基因对肿瘤的治疗和预后有着至关重要的作用。通过计算方法发现肿瘤转移基因,相对于昂贵且耗时的生物学方更加高效。基于蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPIN),论...
关键词：肿瘤细胞转移 肺癌骨转移 蛋白质相互作用网络 随机游走重启算法 
基于谷物蛋白质序列与PPI网络的功能预测研究
《食品与生物技术学报》2023年第4期75-84,共10页王钰 刘静 管骁 崔双龙 汤杏华 
上海市科委地方高校能力建设项目(20060502100);上海市科技兴农项目(2021-02-08-00-12-F00780)。
谷物中现存大量未经注释、功能未知的蛋白质,且难以通过实验验证,因此计算方法成为预测谷物蛋白质功能的主流方法之一。作者以玉米、小麦、籼稻、粳稻4种谷物蛋白质为研究对象,利用数据库获取结构域相互作用信息。从蛋白质中较为稳定的...
关键词：蛋白质相互作用网络 结构域 谷物 ADABOOST算法 协同分类 多层感知机 
类风湿关节炎免疫相关差异表达基因分析被引量：1
《牡丹江医学院学报》2023年第1期44-50,共7页章鲁瑶 张洋 张书筠 代海燕 司子厚 白宇希 苏俊鹏 朱伟 
黑龙江省教育厅基本科研业务费项目(2021-KYYWF-0480)。
目的通过分析类风湿关节炎(Rheumatoid Arthritis,RA)差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)及相关信号通路,探究RA发生发展过程中的分子免疫机制。方法从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)下载基因表达谱...
关键词：类风湿关节炎 差异表达基因 蛋白质相互作用网络 
糖尿病肾病肾小管病变关键基因的预测被引量：1
《中国免疫学杂志》2023年第3期520-524,共5页刘莉 杨娇娇 林鹏 任建民(指导) 
国家自然科学基金面上项目(82070799)。
目的:基于生物信息学探索糖尿病肾病(DKD)肾小管差异表达基因(DEGs)与相关信号通路,结合蛋白互作(PPI)网络分析与比较毒理基因组学数据库(CTD)筛选在DKD肾小管病变中发挥关键作用的基因。方法:选取基因表达公共数据库(GEO)中芯片数据集G...
关键词：糖尿病肾病 生物信息学 蛋白质相互作用网络 肾小管 富集分析 
Neuritin结构组成分析及其相互作用蛋白生物信息学预测被引量：3
《石河子大学学报（自然科学版）》2023年第1期87-92,共6页李煜 孟平平 王宿洁 朱礼彦 朱金辉 陈仁伟 杨磊 
国家科技重大专项(民口)重大新药创制项目(2019ZX09301-161);浙江省重点研发项目(2019C03060)。
目的对Neuritin的理化性质及结构组成,蛋白质相互作用网络进行生物信息学预测分析,为进一步研究Neuritin的功能和作用机制提供新的思路与方向。方法应用Protscale和ProtParam、TMHMM、SignalP、PSORTⅡ、NetNGlyc、NetOGlyc和Netphos等...
关键词：NEURITIN 理化性质 结构预测 蛋白质相互作用网络 生物信息学 
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