蛋白质核心设计的序列组合文库筛选方法  

Design of Protein Cores by Screening Combinatorial Sequence Library

作　　者：叶玉珍[1] 汤海旭[1] 丁达夫[1] 

机构地区：[1]中国科学院上海生物化学研究所

出　　处：《生物化学与生物物理学报》1998年第5期525-529,共5页

基　　金：国家自然科学基金

摘　　要：本文提出一种新的蛋白质序列组合文库筛选方法，异型自洽系综最优法（ｈｅｔｅｒｏ－ＳＣＥＯ，ｈｅｔｅｒｏｇｅｎｅｏｕｓｓｅｌｆ－ｃｏｎｓｉｓｔｅｎｔｅｎｓｅｍｂｌｅｏｐｔｉｍｉｚａｔｉｏｎ），用于从头设计蛋白质核心。经λ－阻遏蛋白、噬菌体４３４ＣＲＯ蛋白、白介素－４、硫氧还蛋白、泛肽等的检验，表明此方法用于从头设计蛋白质的核心是可行的。We have developed a new method, heterogeneous self consistent ensemble optimization(hetero SCEO), to select appropriate hydrophobic cores of proteins. It has been tested with five kinds of proteins: λ repressor, phage 434 CRO protein, interleukin 4, thioredoxin and ubiquitin. The results show that the method can be used for the de novo design of the hydrophobic cores of proteins.

关 键 词：蛋白质核心 设计 序列组合文库 

分 类 号：Q510.3[生物学—生物化学]