丁达夫

作品数：59被引量：140H指数：6
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供职机构：中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所更多>>
发文主题：蛋白质蛋白蛋白质结构同源模建基因组更多>>
发文领域：生物学医药卫生自然科学总论理学更多>>
发文期刊：《北京师范大学学报（自然科学版）》《物理学进展》《生物化学与生物物理进展》《物理》更多>>
所获基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划中国科学院知识创新工程国家重点基础研究发展计划更多>>
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从酵母表达时间序列估计基因调控网络被引量：9
《生物化学与生物物理学报》2003年第8期707-716,共10页徐肖江 王连水 丁达夫 
国家高技术研究发展计划 (863计划)项目(No.2 0 0 2AA2 3 40 2 1);中国科学院知识创新工程项目(No.KJCX1 0 8);上海市科学技术委员会科技项目(No .0 0JC14 0 18)资助~~
基因调控网络是生命功能在基因表达层面上的展现。用组合线性调控模型、调控元件识别和基因聚类等方法 ,从基因组表达谱解读酵母在细胞周期与环境胁迫中的基因调控网络。结果表明 ,细胞在不同环境条件下会调整基因调控网络。在适应的环...
关键词：基因调控网络 基因组表达时间序列 细胞周期 环境胁迫 
用于串联质谱鉴定多肽的计量方法被引量：3
《生物化学与生物物理学报》2003年第8期734-740,共7页盛泉虎 汤海旭 解涛 王连水 丁达夫 
国家高技术研究发展计划 (863计划)资助项目(No .2 0 0 2AA2 3 40 2 1) ;中国科学院知识创新工程项目(No.KJCX1 0 8);上海市科学技术委员会科技项目(No.0 0JC14 018);国家自然科学基金重大项目(No.3 9990 60 00 3 )~~
目前已有多种对串联质谱与数据库中多肽的理论质谱的一致性进行评估的高通量计量算法用于鸟枪法蛋白质组学 (shotgunproteomics)研究。然而这些方法操作时存在大量错误的多肽鉴定。这里提出一种新的串联质谱识别多肽序列的计量算法。该...
关键词：蛋白质组信息学 数据库搜索 多肽鉴定 概率模型 串联质谱 
从GDNF家族及其受体GFRα家族的进化分析中解析相互作用的功能决定位点
《生物化学与生物物理学报》2003年第4期331-337,共7页张磬 王丽梅 陈哲宇 丁达夫 
国家自然科学基金重大项目课题 (No .3 9990 60 0 0 3 ) ;中国科学院知识创新工程项目课题 (No .KJCX1 0 8) ;上海市科学技术委员会科技项目 (No .0 0JC14 0 18)~~
胶质细胞源神经营养因子 (glialcellline derivedneurotrophicfactor,GDNF)对神经退行性疾病具有潜在的治疗作用 ,因此解析GDNF及其糖基磷脂酰肌醇锚联受体GFRα的相互作用机制具有重要意义。根据蛋白质残基的功能重要性与自然选择压力...
关键词：胶质细胞源神经营养因子 GDNF家族 受体 GFRα家族 相互作用机制 功能决定位点 进化踪迹分析 TGF-Β超家族 神经退行性疾病 
大鼠GDNF基因的克隆表达及对PC12工程细胞的影响被引量：3
《基础医学与临床》2003年第3期263-268,共6页王丽梅 魏传垠 陈雪红 张磬 陈哲宇 丁达夫 路长林 
国家自然科学基金 (30 0 0 0 0 4 8) ;上海市青年科技启明星计划 (0 1QB14 0 0 1) ;国家教育部优秀青年教师资助计划项目 (30 0 70 16 7) ;国家重点基础研究"973"项目 (19990 5 4 0 0 5 )
克隆与表达大鼠胶质细胞源性神经营养因子 (glialcellline derivedneurotrophicfactor,GDNF)并观察其对PC12工程细胞的影响。从新生 4天的SD大鼠海马组织中提取总RNA ,通过RT PCR方法 ,扩增出GDNFcDNA。构建表达质粒pET GDNF ,转化大肠...
关键词：大鼠 GDNF基因 胶质细胞源 神经营养因子 PC12工程细胞 影响 基因表达 反转录—聚合酶链反应 
判定直系同源关系的进化分析方法被引量：3
《生物化学与生物物理学报》2002年第1期88-94,共7页时硕永 丁达夫 
国家自然科学基金重大项目课题 (No .39990 6 0 0 0 3);中国科学院知识创新工程项目课题 (KSCX2 2 0 7;KJCX1 0 8)~~
如何正确判定基因之间的直系同源 (ortholog)和旁系同源 (paralog)关系 ,仍是基因组功能诠释和比较基因组学中有待更好解决的关键问题。在以前的工作中 ,曾用进化分析方法解决多基因家族的直系 /旁系同源关系的判定问题 ,现进而完整地...
关键词：直系同源 旁系同源 进化分析 比较基因组学 
生物信息学被引量：2
《科技术语研究》2001年第3期46-48,共3页丁达夫 
关键词：生物信息学 数据库 应用软件 因特网 
甾体激素受体功能特异性的结构基础被引量：4
《生物物理学报》2001年第4期685-694,共10页张磬 叶玉珍 丁达夫 
国家自然科学基金重大项目课题 (39990600 -03);中国科学院知识创新工程项目课题(KSCX2 -2 -07 ;KJCX1 -08)
甾体激素受体家族包括雌激素受体、雄激素受体等五个亚家族 ,在机体组织细胞的生长分化、发育生殖、内环境稳定等几乎所有生理过程中都起着重要的作用。研究甾体激素受体亚家族的特异性可以加深对该家族功能的理解 ,并且具有潜在的临床...
关键词：甾体激素受体 配体结合域 加权进化踪迹分析 踪迹残基 特异性 
应用定点突变与分子模建方法研究蛋白酶抑制剂eglin C突变体对蛋白酶furin和kexin的抑制活力(英文)被引量：1
《生物化学与生物物理学报》2001年第6期591-599,共9页费浩 罗明娟 叶玉珍 丁达夫 戚正武 
国家重点基础研究发展规划项目 ( 973) (No .G19980 5 112 1);国家高技术"86 3"计划项目 (No .10 3 13 0 1 0 3)~~
蛋白质前体加工酶参与许多重要蛋白质前体的加工成熟过程 ,哺乳动物来源的furin和酵母中的kexin是该家族的重要成员。首先人工合成了编码枯草杆菌蛋白酶抑制剂eglinC的基因片段 ,组装后在大肠杆菌中得到表达。以定点突变方法在野生型egl...
关键词：蛋白质前体加工酶 蛋白酶抑制剂 定点突变 分子模建 eglinC突变体 FURIN Kexin 
Furin/kexin蛋白质前体加工酶抑制剂的理性再设计被引量：1
《生物化学与生物物理学报》2001年第5期504-512,共9页叶玉珍 费浩 丁达夫 
国家重点基础研究发展规划项目课题(No .G19980 5 112 1);国家自然科学基金重大项目课题(No .39990 6 0 0 0 3);中国科学院知识创新
许多重要的生物过程 ,如酶原激活、肽激素合成、病毒蛋白加工和受体成熟 ,均须蛋白质前体加工酶的剪切处理。因此 ,蛋白质前体加工酶可能是一种新药开发的对象。综合利用同源模建技术和序列的进化踪迹分析手段 ,研究了蛋白质前体加工酶f...
关键词：同源模建 进化踪迹分析 界面改造 蛋白质前体加工酶 水蛭抑制剂 理性再设计 
通过自由能的差别划分蛋白质连续结构域被引量：3
《生物化学与生物物理学报》2001年第4期386-394,共9页谢志群 丁达夫 许根俊 
国家自然科学基金 (批准号 :39930 0 6 0 );国家攀登计划资助&&
结构域是蛋白质三级结构下面的结构层次 ,大多数的蛋白质都可分为若干个结构域 ,结构域的不同组合使蛋白质具有不同的三级结构并具有不同的功能。蛋白质结构域的划分在理论与应用上都具有重要意义。但目前对结构域的划分还没有一个十分...
关键词：结构域 自由能 结构参数化 可分离度 划分 蛋白质 
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