分子模建

作品数：24被引量：54H指数：5
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相关作者：蒋勇军俞庆森丁达夫林毅张同武更多>>
相关机构：浙江大学第三军医大学华侨大学军事医学科学院更多>>
相关期刊：《药学学报》《计算机与应用化学》《物理化学学报》《华侨大学学报（自然科学版）》更多>>
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新型靶向HER3抗体偶联药物的抗肿瘤活性研究被引量：1
《药学学报》2022年第6期1825-1831,共7页耿晶 李新颖 
中国医学科学院医学与健康科技创新工程项目(2021-I2M-1-026)。
作为人表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR,HER1,ERBB)家族重要成员,人表皮生长因子受体3(HER3,ERBB3)是PI3K/AKT信号通路中关键的激活因子。近期研究发现,HER3与多种类型肿瘤的发生发展以及对EGFR和人表皮生长因...
关键词：人表皮生长因子受体家族 HER3 单克隆抗体 抗体-药物偶联物 计算机辅助分子模建 
B糖基转移酶p.R168W突变导致B_(el)亚型的分子机制研究被引量：5
《中国输血杂志》2017年第7期679-681,共3页龚淞颂 邹纬 李芳 王钰箐 雷航 王学锋 蔡晓红 
上海市公共卫生重点学科建设项目(15GWZK0501);上海市自然科学基金(17ZR1417000)
目的对B糖基转移酶R168W突变导致B_(el)亚型的分子机制进行研究。方法免疫血清学、ABO基因型SSP-PCR检测及直接测序患者及其家系成员ABO基因第6、第7外显子测序。构建3D分子模型,并就GTB蛋白突变对结构影响进行预测。结果经吸收放散试...
关键词：ABO血型 Bel亚型 基因突变 3D分子模建 
金银花活性成分绿原酸与不同蛋白质相互作用机制的比较分析研究被引量：5
《中国中药杂志》2013年第16期2714-2720,共7页郭明 詹敏忠 鲁小旺 范文翔 
国家自然科学基金项目(20877072);浙江省科技创新项目(2112009007)
目的:分析比较金银花活性成分绿原酸(chlorogenic acid,CGA)与乳铁蛋白(bovine lactoferrin,BLF)及血清白蛋白(bovine serum albumin,BSA)的分子作用机制。方法:光谱法结合计算机模拟技术测定药物与蛋白质相互作用的结合参数、能量转移...
关键词：绿原酸 乳铁蛋白 血清白蛋白 荧光光谱 紫外吸收光谱 分子模建 
米曲霉木糖醇脱氢酶的分子模建与对接被引量：3
《微生物学报》2011年第7期948-955,共8页陈宏文 苟元波 张卡 方柏山 
国家自然科学基金((20676048);教育部留学回国人员科研启动基金(2010);福建省自然科学基金(D0810015);福建省高等学校新世纪优秀人才支持计划(07FJRC03);华侨大学基本科研业务费专项基金(JB-2R1112)~~
【目的】研究米曲霉木糖醇脱氢酶基因的结构与功能。【方法】克隆测序来源于米曲霉的木糖醇脱氢酶(XDH)基因,利用Swiss-MODEL和Modeller对XDH进行三级结构模建,通过PROCHECK和Prosa2003对得到的4个目标模型进行评价,从中得到一个最佳模...
关键词：木糖醇脱氢酶 米曲霉 同源建模 分子对接 
苏云金芽孢杆菌Ⅳ型抗癌晶体蛋白的分子模建
《生物信息学》2009年第4期320-322,325,共4页何伟 张同武 林毅 
国家自然科学基金(40601046);福建省高等学校新世纪优秀人才支持计划资助基金
通过同源建模得到了抗癌晶体蛋白Parasporin-4的初始三维结构,利用分子动力学的方法对初始三维结构进行优化,同时分析了模建分子的结构,最后利用Ramachandran plot,结构匹配等方法对模型进行评价。结果显示得到的Parasporin-4结构是具...
关键词：抗癌晶体蛋白 空间结构 同源建模 分子动力学模拟 
G-蛋白偶联受体GPR120分子模建研究被引量：4
《化学学报》2009年第14期1553-1558,共6页陆绍永 蒋勇军 俞庆森 邹建卫 
国家863项目(No.2007AA02Z301);国家自然科学基金(No.20803063)资助项目
新的长链脂肪酸受体G-蛋白偶联受体120(G-protein-coupled receptor120,GPR120)是2型糖尿病的潜在治疗靶标.由于其晶体结构迄今尚未获得,成为基于结构的新药设计的瓶颈.首先,以人体β2肾上腺能素受体(human β2 adrenergic receptor,β2...
关键词：G-蛋白偶联受体 GPR120 同源模建 分子动力学模拟 2型糖尿病 
苏云金杆菌Ⅰ型抗癌晶体蛋白的分子模建
《华侨大学学报（自然科学版）》2009年第4期420-424,共5页袁宇熹 张同武 陈智山 林毅 
国家自然科学基金资助项目(40601046);细胞生物学与肿瘤细胞工程教育部重点实验室开放基金资助项目(B0510011)
通过同源建模,得到Ⅰ型抗癌晶体蛋白Parasporin-1的初始三维结构.经分子动力学方法优化后,利用Ramachandran Plot检测和结构匹配等方法对模型进行评价.结果显示,结构模型中的键长、键角及二面角的分布合理,与模板蛋白的主链α碳原子的...
关键词：Ⅰ型抗癌晶体蛋白 同源建模 分子动力学模拟 蛋白酶 激活位点 
苏云金杆菌Ⅲ型抗癌晶体蛋白的分子模建被引量：1
《计算机与应用化学》2009年第3期279-282,共4页何伟 张同武 林毅 
国家自然科学基金资助项目(40601046);福建省高等学校新世纪优秀人才支持计划基金资助;福建省自然科学基金资助项目(B0510011).
通过同源建模获得抗癌晶体蛋白Parasporin-3的初始三维结构,利用分子动力学方法优化之。分析模建分子的结构,最后利用Ramachandran plot,结构匹配等方法评价模型。结果显示Parasporin-3蛋白模型分子具有3个结构域,与经典的杀虫晶体蛋白...
关键词：抗癌晶体蛋白 空间结构 同源建模 分子动力学模拟 
以特异性噬菌体为靶进行配基筛选的分子模建及活性鉴定
《南方医科大学学报》2007年第8期1127-1131,共5页罗海波 胡远东 刘北一 李松 富宁 
国家自然科学基金(30471550);广东省自然科学基金(32877)~~
目的利用计算机辅助分子模拟技术,分析TNF模拟序列与配基的结合。方法利用计算机模建,对特异性模拟TNF的环七肽单表位克隆LCS-7(c-RRPAQSG-c)与以其为靶筛选获得的配基即TNFα结合肽LLT-18(EHMALTYPFRPP)及TNFα分子间相互结合作用进行...
关键词：同源模建 噬菌体 TNFΑ 单表位 结合肽 
特异性抗肝癌单链抗体HscFv4-16的分子模建被引量：1
《中国病理生理杂志》2007年第6期1246-1248,共3页叶刚 杨冬华 汤绍辉 周旻 丁世华 罗静兰 
广东省科技计划项目资助(No.2006B19901014);广州市科委领域专项创新药物基金资助项目(No.2004Z3-E4l21);广东省名医工程研究项目(No.粤卫[2004]199号)
目的:模建特异性抗肝癌单链抗体HscFv4-16的三维结构,为高亲和力的抗肝癌单链抗体的人源化设计提供结构信息。方法:采用同源模建技术,在SGI图形工作站上,通过Accelrys公司InsightⅡ软件包的Homology模建分子结构,用Discover进行分子力...
关键词：肝肿瘤 抗体 肿瘤 
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