同源建模

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基于同源建模和虚拟筛选松材线虫海藻糖磷酸酶抑制剂的发现研究
《西部林业科学》2025年第1期73-84,共12页杨鑫 陈双扣 黄夏 陈秋月 朱万宏 王瑜 陈俊杰 
重庆市科技兴林科学研究类项目(渝林科研YB2024-2);重庆科技大学研究生创新计划(YKJCX2420509)。
采用同源建模技术和虚拟筛选方法,从天然产物化合物库中筛选出环境友好型松材线虫海藻糖磷酸酶抑制剂。通过同源建模构建松材线虫TPP的三维蛋白结构,并结合AUC、EF值等参数评估对接模型的活性分子富集能力,筛选出与TPP结合能低于阈值的...
关键词:松材线虫病 虚拟筛选 分子对接 天然产物 芦竹碱 
德国小蠊钠离子通道V295N突变对α-蝎毒素LqhαIT敏感性的影响
《农药学学报》2025年第1期90-97,共8页温淑璇 马媛 陆容材 耿俊杰 张坤 吴少英 
三亚崖州湾菁英人才科技专项项目(No.SCKJ-JYRC-2023-15).
电压门控钠离子通道在细胞电信号传导中是必不可少的,它控制神经元和其他可兴奋细胞间动作电位的启动和传播,钠离子通道的快速失活过程是电信号传导的关键。蝎毒素作用于钠离子通道,影响通道的失活速度,因此解析蝎毒素与钠离子通道相互...
关键词:德国小蠊 钠离子通道 LqhαIT 定点突变 双电极电压钳 同源建模 
长林小蠹气味降解酶基因的鉴定与分子对接
《北京林业大学学报》2025年第2期79-94,共16页李相淳 陶静 李心钰 宗世祥 
国家重点研发计划(2021YFD1400300)。
【目的】对长林小蠹的气味降解酶相关基因进行筛选、分类与组织表达分析,为后续利用分子生物学手段调控长林小蠹的行为提供理论依据。【方法】在长林小蠹全基因组数据中筛选关键的气味降解酶基因,并进行基因的系统发育分析与成虫的组织...
关键词:长林小蠹 气味降解酶 基因鉴定 同源建模 分子对接 害虫防治 
135例ABO变异型的血清学特征和基因序列分析
《中华实用诊断与治疗杂志》2025年第1期38-44,共7页孔存权 孔永奎 崔翠云 孔晓阳 朱伟彦 刘鸿雁 蒋姝婷 马翠霞 戴豫宛 燕备战 
河南省科技攻关计划项目(182102310223)。
目的 分析135例ABO变异型者的血清学特征和ABO血型基因型,探讨其分子生物学基础。方法 2021年1月—2024年7月河南省人民医院行ABO血型鉴定者265 025例,筛选出135例疑似ABO亚型需基因学辅助诊断。提取全血DNA后,采用PCR技术对ABO血型基因...
关键词:ABO变异型 血清学 基因型 新等位基因 同源建模 
利用分子对接分析橙色嗜热子囊菌QH-1酯酶的酯化特性
《中国酿造》2025年第1期85-91,共7页鲁彤 赵微 崔美林 王佳丽 张秀红 
山西省自然科学基金项目(202103021223255,202203021221135);山西省研究生实践创新项目(2023XZY077)。
为探明橙色嗜热子囊菌(Thermoascus aurantiacus)的酯化特性,通过测定酯酶活力从6株橙色嗜热子囊菌菌株(编号为QH-1~QH-4,FH-5~FH-7)中筛选高产酯酶菌株,在基因组测序的基础上,采用在线软件对其酯酶进行理化性质预测、同源建模、酯酶模...
关键词:橙色嗜热子囊菌 酯酶 同源建模 分子对接 酯化反应 
疏棉状嗜热丝孢菌脂肪酶LipTL的酶学性质及脱胶应用研究
《食品与发酵工业》2025年第1期41-46,共6页邵化 单明明 王琼波 徐瑞敏 陈曦 魏涛 
中原科技创新人才项目(224200510017);河南省重点研发专项(231111111700)。
酶法脱胶技术在油脂精炼行业应用潜力巨大,磷脂酶是酶法脱胶技术中的主要用酶,但因现有磷脂酶资源在底物选择性、温度稳定性方面难以满足工业脱胶工艺的要求,限制了磷脂酶在油脂精炼行业中的大规模应用。研究表明,来自疏棉状嗜热丝孢菌(...
关键词:疏棉状嗜热丝孢菌 脂肪酶 酶法脱胶 同源建模 酶学性质 
Bw.03的分子生物学研究及分子同源建模
《中国输血杂志》2025年第1期112-115,共4页王莉 孔永奎 靳慧芳 刘欣 谢莹 刘雪 常艳丽 王雅芳 杨淑淼 朱迪 杨乾坤 
目的对1例ABO血型B亚型进行分子生物学研究,并对突变后的酶进行三维建模预测。方法采用试管法及微柱凝胶法鉴定ABO表型;采用序列特异性引物聚合酶链反应(PCR-SSP)检测ABO血型基因,并对ABO基因第6、7外显子序列进行测序分析;通过Modeller...
关键词:Bw血型 分子生物学 同源建模 分子间作用力分析 
咖啡豹蠹蛾普通气味结合蛋白ZcofGOBP1和ZcofGOBP2同源建模及其与杜仲挥发物分子对接
《应用昆虫学报》2024年第6期1183-1196,共14页黄星瑞 邹洁 杨洁 文玺 黄兴龙 
国家自然科学基金项目(32001320);湖南省研究生科研创新项目(CX20231078);吉首大学校级科研项目(Jdx20031)。
【目的】为揭示钻蛀性害虫咖啡豹蠹蛾Zeuzera coffeae选择杜仲作为寄主的嗅觉识别机制。【方法】借助咖啡豹蠹蛾转录组数据开展普通气味结合蛋白(General odorant binding proteins,GOBPs)基因鉴定,然后通过同源建模和分子对接预测了这...
关键词:咖啡豹蠹蛾 分子对接 普通气味结合蛋白 杜仲 挥发物 
基于分子对接和电子舌感官分析的罗汉果甜苷单体与甜/苦味受体构效关系研究
《食品工业科技》2024年第24期107-117,共11页陈靓 唐国玮 朱康明 龙斌 田星 
湖南省自然科学基金面上科学基金项目(2023JJ30445);湖南省教育厅优秀青年项目(22B0378);湖南省中医药大学“双一流”建设学科“揭榜挂帅”项目(22JBZ053);湖南省中医药管理局科研项目(B2024012)。
目的:从分子水平上揭示罗汉果甜苷单体与人类味觉受体之间的相互作用机制。方法:利用I-TASSER Server建立甜味受体(hT1R2、hT1R3)和苦味受体(hT2R4、hT2R14)的同源模型,依据ERRAT值、拉氏图、C-score等指标评估模型质量,选择最高质量的...
关键词:同源建模 分子对接 甜/苦味受体 交互作用 电子舌 罗汉果甜苷 
基于PacBio三代测序技术鉴定cisAB亚型及利用分子对接探究其分子机制
《临床输血与检验》2024年第6期792-796,共5页夏悦昕 邵林楠 李宁 周世航 刘志远 
目的利用血清学及PacBio三代测序技术鉴定1例罕见cisAB亚型,利用分子对接探讨糖基转移酶氨基酸突变导致亚型的分子机制。方法利用免疫血清学试验鉴定ABO表型,利用PacBio三代测序方法鉴定其基因型。突变后的糖基转移酶同源建模和分子对接...
关键词:cisAB亚型 PacBio三代测序 同源建模 分子机制 分子对接 
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