同源模建

作品数：218被引量：416H指数：8
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AGPS在神经胶质瘤细胞中的相互作用蛋白及作用模式
《山东医药》2024年第7期1-5,共5页刘颖 马英 朱彧 
国家自然科学基金青年项目(31501159)。
目的探讨胶质瘤细胞(U251细胞)中癌基因烷基甘油酮磷酸合酶(AGPS)的相互作用蛋白及作用模式。方法常规培养U251细胞并随机分为对照组、shR-AGPS-1组、shR-AGPS-2组,分别加入阴性对照慢病毒和不同沉默水平的AGPS shRNA慢病毒,用Western b...
关键词：神经胶质瘤 烷基甘油酮磷酸合酶 不均一核糖核蛋白K 同源模建 
Tigolaner及其类似物WY-403的合成与杀虫活性
《农药》2023年第12期874-881,共8页毕庆杰 刘东东 李泽东 罗春凤 张静 张立新 
南宁市创新创业领军人才“邕江计划”创业项目(2020002-1);辽宁省“揭榜挂帅”科技攻关计划项目(2022JH1/10400018);辽宁省自然科学基金计划(2022-KF-15-04)。
[目的]为探索tigolaner及其类似物WY-403在农业害虫防治领域的应用前景。[方法]以全氟-4-甲基-2-戊烯为原料,经过4步反应制得目标化合物,并测试其对鳞翅目害虫小菜蛾、半翅目害虫桃蚜及蜱螨目害螨朱砂叶螨的杀虫活性。以秀丽隐杆线虫谷...
关键词：tigolaner GABA受体拮抗剂 杀虫杀螨剂 同源模建 分子对接 
细胞周期蛋白D2同源模建及其与CDKs抑制剂对接研究
《化学研究与应用》2023年第12期2871-2879,共9页杜亚男 陈靖峰 先正平 曹洪玉 唐乾 王立皓 郑学仿 
国家自然科学基金(Nos21601023);辽宁省教育厅基本科研项目(LJKQZ2021168)资助。
细胞周期蛋白D2(CyclinD2,CCND2)在细胞中的异常表达会诱发肿瘤等疾病,设计高选择性CCND2药物对抑制肿瘤具有重要意义。本文选用PDB数据库中与CCND2一级序列同源性最高的3G33为模板蛋白建模,通过Loop环区能量优化最终得到具有较高合理...
关键词：细胞周期蛋白D2 细胞周期依赖性激酶 同源建模 分子对接 
多光谱法、分子对接模拟和生物膜干涉研究槲皮素与小窝蛋白-1的相互作用被引量：1
《光谱学与光谱分析》2023年第3期890-896,共7页侯倩宜 董壮壮 原红霞 李青山 
国家自然科学基金项目(82003881);山西省自然科学基金项目(201801D121231);山西省高校科技创新基金项目(2019L0718);人才培养专项计划山西中医药大学青年科学家基金项目(2021PY-QN-05)资助。
小窝蛋白-1(CAV-1)在动脉粥样硬化等心血管疾病的发生发展中发挥关键作用。为了解槲皮素与CAV-1的相互作用,在模拟生理环境和不同温度条件下,采用多光谱法、同源模建、分子对接模拟和生物膜(BLI)技术进行研究。荧光猝灭数据结果显示,猝...
关键词：槲皮素 小窝蛋白-1 相互作用 多光谱法 同源模建 分子对接 生物膜干涉技术 
嗜热酸性Ⅲ型普鲁兰多糖水解酶TK-PUL保守基序中关键氨基酸残基对其催化性质的影响被引量：1
《食品科学》2022年第22期113-120,共8页曾静 何础阔 郭建军 侯安伟 聂俊辉 袁林 
国家自然科学基金地区科学基金项目(32160579);江西省杰出青年科学基金项目(20202ACBL215001);江西省主要学科学术和技术带头人培养计划项目(20212BCJ23033)。
对嗜热酸性Ⅲ型普鲁兰水解酶TK-PUL保守基序中非保守氨基酸残基进行定点突变,通过比较TK-PUL与突变体的酶学性质,确定保守基序中关键氨基酸残基对其催化性质的影响。TK-PUL保守基序Ⅱ中I500W位点变化不影响其最适反应pH值、pH值稳定性...
关键词：Ⅲ型普鲁兰多糖水解酶 保守基序 定点突变 催化活性 同源模建 
基于分子动力学模拟的TRPM8通道门控特性分析
《高等学校化学学报》2022年第6期196-205,共10页高志伟 李军委 史赛 付强 贾钧儒 安海龙 
国家自然科学基金(批准号:11647121,81830061,11747610);河北省自然科学基金(批准号:F2021202001,H20202005,19JCY⁃BJC28300);河北省留学引进人员资助项目(批准号:C20210337)资助.
TRPM8通道的温度感知等生理功能依赖于正常的门控,但现有晶体结构中S6跨膜螺旋C末端形成的门控结构存在氨基酸缺失,所以其门控特性未能揭晓.本文基于已有的晶体结构和AlphaFold算法构建了11个完整不同构象的TRPM8通道,发现其S6跨膜螺旋...
关键词：TRPM8通道 门控 同源模建 分子动力学模拟 
猪肾上皮细胞SLA-1基因的克隆及分子结构特征分析
《中国畜牧兽医》2022年第5期1671-1678,共8页王宝宝 金行 鲜钰涵 冯宏盛 高凤山 
国家自然科学基金项目(31672525);大连大学创新团队项目(XLJ202005)。
【目的】利用猪肾上皮细胞15(PK15)建立系统的猪白细胞抗原1(SLA-1)抗原表位筛选系统。【方法】提取PK15细胞总RNA,设计特异性引物,应用RT-PCR方法扩增SLA-1基因(SLA-1*PK15),将该基因克隆到pMD18-T载体上,并进行双酶切及测序鉴定;利用D...
关键词：猪肾上皮细胞15(PK15) 猪白细胞抗原1(SLA-1) 克隆 生物信息学分析 同源模建 
离子型GABA受体新型拮抗剂的虚拟筛选被引量：1
《化学与生物工程》2021年第12期19-24,53,共7页赵锦 王雯洁 王晨晨 巨修练 
湖北省教育厅科学技术研究项目(B2018478);国家自然科学基金项目(21807082)。
离子型GABA受体是杀虫剂的重要靶标之一。以人GABA受体为模板同源模建了黑腹果蝇GABA受体的三维结构,通过药效团模型和分子对接方法对小分子数据库进行了虚拟筛选,结合对接模式发现了6个GABA受体拮抗剂苗头化合物,为靶向GABA受体新型杀...
关键词：GABA受体 拮抗剂 同源模建 分子对接 药效团 虚拟筛选 
松针鞘瘿蚊气味结合蛋白TjapOBP1的同源模建及活性气味分子的筛选被引量：1
《北京林业大学学报》2021年第9期77-86,共10页朱蕊 焦继鹏 孙慧敏 武海卫 陶静 
森林重要生物危害因子的监测预警和检疫技术与产品研发(2018YFC1200404)。
【目的】松针鞘瘿蚊是近几年新发现入侵我国的林业有害生物,已经在山东省青岛市黄岛区造成了以黑松为主的沿海防护林大面积衰弱枯死。作为新入侵种对于松针鞘瘿蚊的防控基础研究极为薄弱,为了研发有效的防控技术,尽快遏制该虫的严重危害...
关键词：松针鞘瘿蚊 气味结合蛋白 同源模建 分子对接 
基于分子对接发现抗SARS-CoV-2的潜在天然化合物
《中国科技论文在线精品论文》2021年第3期402-407,共6页席莉莉 石阿茜 沈阗阗 秦红岩 李加忠 雒馨怡 魏玉辉 
甘肃省科技重大专项-应对新冠肺炎专项(20YF2FA016)
目的:筛选靶向新型冠状病毒(SARS-CoV-2)刺突糖蛋白(S蛋白)(记为SARS-CoV-2-S蛋白)的天然小分子化合物.方法:采用同源模建方法,以同源性高的SARS-CoV的S蛋白为模板,建立SARS-CoV-2-S蛋白的三维空间结构并进行优化.利用Glide方法进行分...
关键词：药学其他学科 同源模建 分子对接 新型冠状病毒 
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