判定直系同源关系的进化分析方法  

A Evolutionary Approach to Identification of Orthologous Relationship Across Proteomes

作　　者：时硕永[1] 丁达夫[1] 

机构地区：[1]中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所,上海200031

出　　处：《生物化学与生物物理学报》2002年第1期88-94,共7页

基　　金：国家自然科学基金重大项目课题 (No .39990 6 0 0 0 3);中国科学院知识创新工程项目课题 (KSCX2 2 0 7;KJCX1 0 8)~~

摘　　要：如何正确判定基因之间的直系同源 (ortholog)和旁系同源 (paralog)关系 ,仍是基因组功能诠释和比较基因组学中有待更好解决的关键问题。在以前的工作中 ,曾用进化分析方法解决多基因家族的直系 /旁系同源关系的判定问题 ,现进而完整地展开判定直系同源关系的进化分析方法。从 44个同源蛋白质家族的案例观察表明 ,与流行的COG方法 (直系同源蛋白质的聚类 )比较 。How to identify the true orthologous and paralogous relationships among protein families is still a key problem in genome annotation and comparative protemics. Here, a evolutionary approach to ascertainment of the orthologous relationships across the genomes is developed. Forty-four cases of protein families are used in the test for the evolutionary approach. Compared with the method of COG (cluster of orthologous groups of proteins), this approach can generally identify the orthologous relationships and accurately predict the genome function.

关 键 词：直系同源 旁系同源 进化分析 比较基因组学 

分 类 号：Q343.2[生物学—遗传学]