基于芸香科的植物通用DNA条形码研究  

作　　者：罗焜[1,2] 陈士林[1] 陈科力[2] 宋经元[1] 姚辉[1] 马新业[1] 朱英杰[3] 庞晓慧 余华[1] 李西文[1,4] 刘震[2] 

机构地区：[1]中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所,北京100193 [2]湖北中医学院药学院.武汉430061 [3]西南交通大学生命科学与工程学院,成都610031 [4]清华大学化学系,北京100084

出　　处：《中国科学：生命科学》2010年第4期342-351,共10页Scientia Sinica(Vitae)

基　　金：国家国际科技合作项目(批准号:2007DFA30990);卫生部卫生行业科研专项基金(批准号:200802043)资助项目

摘　　要：植物DNA条形码研究是近10年来进展最迅速的学科之一,其通用序列的筛选一直是该领域研究的热点问题.2009年,生命条形码联盟植物工作组推荐rbcL+matK组成复合序列作为植物通用条形码,但其研究对象中近缘属、种较少,且物种水平鉴定成功率仅为72%,所以仍在进行验证和新序列的研究工作.本研究选取nrDNAITS2序列,利用其具有Ⅱ级结构的特性、通过不同物种类型模型判定全长,将其和目前热点候选序列(matK,rbcL,psbA-trnH,rpoC1,ycf5)及nrDNAITS序列针对芸香科72属192种300个样本进行比较,试图在同一科属下更多近缘种存在时,真实判定候选序列的鉴定能力.结果表明,自行设计引物的ITS2序列具有较好的PCR扩增和测序成功率,在所考察的候选序列中具有最大的种间变异和较小的种内变异,且两者存在极显著差异,同时物种鉴定成功率最高,各评价指标均优于其他候选序列.证实ITS2序列在单一科属内的"高效性",故推荐其作为植物DNA条形码通用序列之一.

关 键 词：DNA条形码 ITS2 芸香科 鉴定 

分 类 号：Q943[生物学—植物学]