朱英杰

作品数：13被引量：313H指数：9
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供职机构：中国中医科学院中医药信息研究所更多>>
发文主题：DNA条形码ITS2基因组转录组赤芝更多>>
发文领域：医药卫生农业科学生物学自动化与计算机技术更多>>
发文期刊：《菌物学报》《中国现代中药》《世界科学技术-中医药现代化》《中国科学：生命科学》更多>>
所获基金：国家自然科学基金国际科技合作与交流专项项目国家科技支撑计划卫生行业科研专项更多>>
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基于全基因组的紫芝细胞色素P450分析被引量：2
《中国现代中药》2016年第12期1555-1559,共5页曾欣宜 朱英杰 李滢 孙超 
国家自然科学基金委面上项目(81273485);国家自然科学基金委面上项目(81573704)
目的:紫芝是多孔菌科灵芝属的重要传统中药。细胞色素P450是一类含血红素的单加氧酶。本研究的目的是对紫芝基因组编码的CYP450序列进行比对及系统进化分析。方法:发掘紫芝基因组编码的所有P450基因,构建紫芝CYP450系统进化树,比较灵芝...
关键词：紫芝 CYP450 灵芝三萜 进化 
长春花密码子使用偏好性分析被引量：6
《中国中药杂志》2016年第22期4165-4168,共4页李滢 匡雪君 朱孝轩 朱英杰 孙超 
国家自然科学基金面上项目(81273485;81503199);国家科技支撑计划项目(2011BAI07B08)
以长春花为研究对象,分析其密码子使用偏好性,以期为相关基因的异源表达、基因的预测、物种的进化研究提供指导。该研究以长春花的30 437条蛋白质编码序列为数据来源,对长春花密码子组成和密码子偏性的各项参数进行了计算和统计分析。...
关键词：长春花 基因组 密码子偏好性 萜类吲哚生物碱 生物合成途径 
基于全基因组和转录组分析的赤芝密码子使用偏好性比较研究被引量：14
《药学学报》2014年第9期1340-1345,共6页朱孝轩 朱英杰 宋经元 孙超 陈士林 
国家自然科学基金面上项目(81273485);协和青年基金(3332013159);中央高校基本科研业务费专项资金(3332013159)
密码子使用偏好性是物种在遗传信息传递过程中的一个重要特点,分析物种的密码子使用偏好性对于了解该物种遗传信息的传递规律具有重要意义。原有的密码子偏好性分析主要基于全基因组数据完成,然而由于目前可获得的高等生物全基因组数据...
关键词：赤芝 基因组 转录组 密码子偏好性 
中国动物药材DNA条形码数据库被引量：19
《中国中药杂志》2014年第12期2155-2159,共5页石林春 姚辉 谢丽芳 朱英杰 宋经元 张辉 陈士林 
国家"重大新药创制"科技重大专项(2013ZX09301307;Z131100006513017);国家高技术研究发展计划(863)项目(2012AA021602)
课题组联合相关研究者开展动物药材DNA条形码分子鉴定研究,并结合分析GenBank序列,采用BLAST分析防错、系统树分析防错和Barcoding Gap检验防错等方法核验序列的可靠性,构建了中国动物药材DNA条形码数据库。该库由样品数据库、序列数据...
关键词：动物药材 数据库 COI 鉴定 
基于流式细胞技术的灵芝基因组大小估测被引量：18
《菌物学报》2013年第5期899-906,共8页李秋实 徐江 朱英杰 孙超 宋经元 陈士林 
国家自然科学基金重点项目(No.81130069);国家科技支撑计划(No.2012BAI29B01);教育部长江学者和创新团队发展计划(No.IRT1150)
以药典规定的灵芝正品来源灵芝Ganoderma lucidum作为研究对象,利用已完成全基因组测序的黑曲霉Aspergillus niger作为内标,通过机械破碎菌丝体的方法获得合适浓度的细胞核悬液,碘化丙啶荧光染色后成功应用流式细胞术进行基因组大小估...
关键词：DNA含量 荧光染色 蕈菌 
金银花中表达基因密码子偏好性分析被引量：4
《世界科学技术-中医药现代化》2013年第3期360-366,共7页何柳 朱英杰 孙超 
国家自然科学基金委青年科学基金项目(81102761):基于赤芝与紫芝全基因组比较阐明灵芝三萜类物质合成途径,负责人:何柳;国家自然科学基金委面上项目(81273485):灵芝三萜的生物合成途径解析及其异源生物合成研究,负责人:孙超
密码子是生物体中重要的遗传信息载体,经过长期进化,不同的生物体对同一密码子形成了一定程度的使用偏好性。本研究对已获得的金银花转录组进行基因预测,利用CodonW程序对所有含有完整阅读框的预测基因,以及参与绿原酸合成的羟基化肉桂...
关键词：密码子 转录组 金银花 绿原酸 
西洋参PqERF1基因的克隆和生物信息学分析被引量：13
《药学学报》2011年第8期1008-1014,共7页孙永珍 牛云云 李滢 朱英杰 罗红梅 陈士林 
国家自然科学基金资助项目(30873459)
乙烯响应因子(ethylene response factor,ERF)是具有PETALA2(AP2)结构域的转录因子。本研究通过西洋参(Panax quinquefolius L)的转录组高通量测序结果分析获得75条具有AP2结构域的转录因子序列,并克隆到一条开放阅读框为933对碱基的基...
关键词：西洋参 乙烯响应因子 实时荧光定量PCR 次生代谢 植物防御 
基于芸香科的植物通用DNA条形码研究被引量：99
《中国科学：生命科学》2010年第4期342-351,共10页罗焜 陈士林 陈科力 宋经元 姚辉 马新业 朱英杰 庞晓慧 余华 李西文 刘震 
国家国际科技合作项目(批准号:2007DFA30990);卫生部卫生行业科研专项基金(批准号:200802043)资助项目
植物DNA条形码研究是近10年来进展最迅速的学科之一,其通用序列的筛选一直是该领域研究的热点问题.2009年,生命条形码联盟植物工作组推荐rbcL+matK组成复合序列作为植物通用条形码,但其研究对象中近缘属、种较少,且物种水平鉴定成功率仅...
关键词：DNA条形码 ITS2 芸香科 鉴定 
重楼属药用植物DNA条形码鉴定研究被引量：157
《药学学报》2010年第3期376-382,共7页朱英杰 陈士林 姚辉 谭睿 宋经元 罗焜 鲁静 
国际科技合作项目(2007DFA30990);卫生行业科研专项(200802043)
为评价DNA条形码候选序列对重楼属药用植物的鉴定作用,探讨重楼属药用植物鉴定新方法,本研究对重楼属11个物种17份样品的psbA-trnH、rpoB、rpoC1、rbcL、matK和核ITS2序列进行PCR扩增和测序,比较各序列扩增和测序效率、种内和种间变异,...
关键词：重楼属 DNA条形码 ITS2 药用植物 鉴定 
中国黄芪属药用植物DNA条形码(ITS2)鉴定被引量：26
《世界科学技术-中医药现代化》2010年第2期222-227,共6页高婷 姚辉 马新业 朱英杰 宋经元 
科技部卫生行业科研专项(200802043):药用植物DNAbarcoding(条形码)鉴定研究;负责人:陈士林
中国黄芪属植物种类繁多,具有重要的药用及生物学价值。本文采用了植物DNA条形码候选序列之一的ITS2片段来探讨在黄芪属药用植物中的鉴定能力。结果显示,ITS2基因区通用性强,序列在黄芪属物种间的差异较大,具有明显的Barcoding Gap,能...
关键词：ITS2序列 黄芪属 鉴定 DNA条形码 
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