用嫁接活性位点方法设计新的功能蛋白质  被引量:3

Engineering Novel Functional Proteins: Grafting Active Sites into Natural Scaffolds

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作  者:叶玉珍[1] 汤海旭[1] 丁达夫[1] 

机构地区:[1]中国科学院上海生物化学研究所

出  处:《生物化学与生物物理学报》1999年第3期303-308,共6页

基  金:国家生物高技术863项目;国家自然科学基金

摘  要:将一个蛋白质的活性位点,嫁接到另一个分子量较小但是稳定的蛋白质(骨架蛋白)上,从而形成一种新的功能蛋白质,这是蛋白质设计中一种很有效的方法。在我们发展的异型自洽系综最优化方法(heteroSCEO)的基础上,结合3D模体搜索等工具,实现了这种位点嫁接的设计。并以在卡律蝎毒素分子骨架上嫁接碳酸酐酶B的Zn2+结合位点的设计为例进行检验,表明此设计系统是可行的和有效的。Engineering novel small functional proteins by grafting active sites into small but stable proteins is an efficient protein design method. Combining heterogeneous self consistent ensemble optimization (hetero SCEO) with 3D motif search tool, we developed a system to accomplish such method. It is tested by transferring zinc binding site of carbonic anhydrase form B to charybdotoxin and its efficiency is demonstrated.

关 键 词:功能蛋白质设计 位点嫁接 异型自洽系综 最优化 

分 类 号:Q753[生物学—分子生物学]

 

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