TBTV卫星RNA不同分离物的序列测定及系统进化分析  

Sequencing and Phylogenetic Analysis of Tobacco Bushy Top Virus Satellite RNA Isolates

作　　者：尹朝先[1] 包娜[1] 冉志伟[1] 陈海如[1] 李凡[1] 

机构地区：[1]云南农业大学,农业生物多样性与病害控制教育部重点实验室,云南昆明650201

出　　处：《云南农业大学学报（自然科学版）》2010年第6期797-801,共5页Journal of Yunnan Agricultural University:Natural Science

基　　金：国家自然科学基金项目(30660101)

摘　　要：利用RT-PCR方法对烟草丛顶病毒(tobacco bushy top virus,TBTV)卫星RNA不同分离物进行扩增和克隆测序,同时运用DNAMAN,MEGA,ClustalX等生物软件对TBTV和其它幽影病毒的卫星RNA核苷酸序列进行同源性比较,构建了幽影病毒属成员卫星RNA的系统进化树。E结果显示:TBTV不同分离物卫星RNA的核苷酸同源性为79.2%～99.0%。它们与幽影病毒属其它成员卫星RNA的核苷酸同源性为32.5%～44.1%。通过构建幽影病毒属成员卫星RNA的系统进化树可以看出:TBTV的卫星RNA与GRV的卫星RNA亲缘关系最近,与CMoMV的亲缘关系最远。The satellite RNA of tobacco bushy top virus （TBTV） isolates were cloned by RT-PCR and sequenced. Sequences were then analyzed by DNAMAN, MEGA and ClustalX. Results showed that different TBTV satellite RNA isolates shared 79.2% -99.0% identities, and the TBTV satellite RNA isolates shared 32.5% -44. 1% nucleotide sequence identities with other umbraviruses satellite RNA. Phylogenetic analysis showed that the satellite RNA of TBTV was more closely related to that of groundnut rosette virus （GRV）, but far to carrot mottle mimic virus （CMoMV）.

关 键 词：烟草丛顶病毒 幽影病毒 卫星RNA 序列分析 系统进化 

分 类 号：S435.72[农业科学—农业昆虫与害虫防治]