三维分子结构检索系统的柔性构象检索  

CONFORMATIONALLY FLEXIBLE SEARCHING IN 3 DIMENSIONAL STRUCTURE SEARCHING SYSTEM

作　　者：陈海峰[1] 姚建华[1] 袁身刚[1] 荔建锋[1] 杨铄[1] 郑崇直[1] 范波涛[2] A.PANAYE J.P.DOUCET 

机构地区：[1]中国科学院上海有机化学研究所中国科学院计算机化学开放实验室 [2]法国巴黎第七大学拓扑及系统动力学研究所

出　　处：《计算机与应用化学》1999年第2期101-104,110,共5页Computers and Applied Chemistry

基　　金：国家"九五"攻差项目;国家自然科学基金;中法先进研究计划

摘　　要：介绍了ＭｏｎｔｅＣａｒｌｏ法和遗传算法两种柔性构象检索方法，并对４种药效团进行了柔性构象检索，经过对比发现遗传算法可以在比较合理的时间内得得到较多的命中结构，比ＭｏｎｔｅＣａｒｌｏ法更适用于柔性构象检索。Two conformationally flexible searching methods,Monte Carlo and genetic algorithm,are introduced in this paper. Their performance was tested by four pharmacophores searching against a 25 000 3D structural database. The result showed that genetic algorithm can get more hit structures in a reasonable time than Monte Carlo does. It is concluded that genetic algorithm is more relevant method for 3D conformationally flexible searching.

关 键 词：柔性构象检索 三维分子结构 分子结构 检索 

分 类 号：O6-39[理学—化学]