袁身刚

作品数:42被引量:86H指数:5
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供职机构:中国科学院上海有机化学研究所更多>>
发文主题:化学结构数据库分子结构化学反应含氟农药更多>>
发文领域:理学自动化与计算机技术化学工程医药卫生更多>>
发文期刊:《药学进展》《化学进展》《辐射研究与辐射工艺学报》《计算机与应用化学》更多>>
所获基金:国家自然科学基金“九五”国家科技攻关计划教育部留学回国人员科研启动基金国家重点基础研究发展计划更多>>
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R-基团相似性的比较
《化学学报》2004年第17期1585-1589,共5页朱倩刚 姚建华刚 李丰刚 陈海峰刚 袁身刚 
中国科学技术部;上海市科学技术委员会;中国科学院的资助
介绍了对化学取代基 (R 基团 )进行相似性比较的工作 .每个R 基团主要依赖一些对反应影响较为明显 ,同时又便于计算的结构描述符来进行描述 ,例如电负性、氢键受体、氢键给体等参数 .由于与反应核心相距过远的环境对反应的影响较小 ,R ...
关键词:R-基团 相似性 结构描述符 归一化 重心 向量 化学数据库检索系统 
对化学反应数据分类获取反应知识的新方法
《化学学报》2004年第2期112-119,共8页朱倩 姚建华 李丰 陈海峰 袁身刚 
尽管已有大量化学反应数据可供使用 ,但化学家仍常常感到很难便捷地从中得到所需的信息 .这主要是由于反应数据库基于结构的检索方法与化学家解决问题的方法相去甚远 .为解决这一问题而发展了一种通过对反应进行二级分类得到精细描述反...
关键词:化学反应数据 分类 化学反应知识 同类反应 基核反应 结构描述符 化学超空间 层次模型 
基于分子对接的苯丙素甙(PPGs)类化合物的虚拟筛选和合理设计被引量:2
《化学学报》2002年第10期1860-1866,共7页陈海峰 高坤 范波涛 袁身刚 贾忠建 郑荣梁 PANAYE A DOUCET J.P 
国家基础研究发展规划 (No .G19980 5 1115 ) ;国家自然科学基金重点项目 (No.2 983 2 0 5 0 ) ;国家自然科学基金 (Nos. 2 9872 0 48;2 0 0 73 15 4) ;国家高性能计算基金 (No .995 0 7) ;国家自然科学基金有机化学创新群体项目 (QTProgram);国家烟草专卖局科
采用虚拟化合物生成法对抗肿瘤的苯丙素甙 (PPGs)类化合物进行了配体受体对接研究 .以三种不同的骨架结构为基础分别生成了五十个虚拟苯丙素甙 (PPGs)类化合物 ,并将它们与端粒DNA受体进行分子对接 ,分析已知结构的对接结果 ,通过虚拟...
关键词:虚拟筛选 虚拟化合物生成 苯丙素甙 分子对接 抗肿瘤药物 药物设计 药物筛选 
化学结构中互变键、交替键和芳香键的自动识别被引量:1
《化学学报》2002年第7期1291-1297,共7页姚建华 李丰 罗时玮 袁身刚 陈海峰 李强 郑崇直 
973计划 (No .G19980 5 1115 );国家自然科学基金 (Nos.2 9832 0 5 0 ;2 9872 0 48;2 0 0 730 5 8)资助项目
化学结构计算机处理中最常遇到的困难是互变现象、交替键和芳香键的处理 .尽管解决这些问题的方法早有报道 ,但它们都有仅考虑计算机处理的方便 ,而很少注意其化学应用的不足 .本工作在环系识别算法的基础上 ,设计了新的识别算法 ,使得...
关键词:化学结构 互变键 自动识别 互变现象 交替键 芳香键 计算机处理 
异喹啉类化合物抑制肥大细胞脱颗粒活性的3D—QSAR研究被引量:1
《化学学报》2001年第12期2143-2147,共5页陈海峰 李强 曾宝珊 董喜城 袁身刚 陈敏伯 郑崇直 孙仁山 程天民 粟永萍 刘荣卿 
国家重点基础研究发展计划(973计划),中-法合作项目,国家自然科学基金,国家自然科学基金,国家高性能计算基金,重庆市科委资助项目
对一组抑制肥大细胞脱颗粒的异喹啉类化合物的活性及毒性进行了3D-QSAR研究,采用距离比较法(DISCO)得到了它们的药效团模型,通过选择不同的叠合方式,建立了相关性很好的比较分子力场分析(CoMFA)模型,其交叉验证参数Rcv2分别为0.654和0.6...
关键词:异喹啉类化合物 3D-QSAR DISCO COMFA 肥大细胞脱颗粒 药物设计 药效团模型 抑制活性 毒性 比较分子力场分析 
计算机辅助合成设计
《科学》2001年第4期16-19,共4页姚建华 袁身刚 王利莎 
在实验室或工厂大规模生产具有特定结构的化合物,是人类战胜自然的非凡创造力的一种有力表现。一个复杂化合物的合成,往往要经过几十步的反应。
关键词:计算机辅助合成设计 化学合成 有机合成 
化学反应处理的计算模型被引量:1
《化学学报》2001年第4期472-478,共7页王利莎 袁身刚 郑崇直 
科技部科技攻关项目,国家重点基础研究发展计划(973计划),中-法合作项目,国家自然科学基金,国家自然科学基金,国家高性能计算基金
介绍了一种将同类反应上升为合成反应知识和在计算机上实现反合成分析的方法.反合成分析是合成设计中最关键的一步,在本工作中采用了基于谋略键寻找的合成设计方法.它有逻辑宜于在计算机上实现的优点.为了实现这个方法,我们首次提出了...
关键词:反应知识描述 谋略键 反合成分析 有机合成 计算模型 设计 计算机处理 
合成目标化合物析分系统被引量:1
《计算机与应用化学》2001年第1期15-22,共8页王利莎 袁身刚(指导) 郑崇直 
国家科技部"九五"重点攻关项目(96-547-01-01、96-547-01-02);国家基础研究发展规划(G1998051115);中法先进研究计划(PRA 98M-A036);国家自然基金重点项目(29832050);国家自然基金(29872048);国家高性能计算基金(99507)
在化学反应处理的计算模型的基础上 ,完成了一个实验性的目标化合物析分系统 (TargetParsingSystem ,TPS)。目前它主要用于测试和优化反应规则的选择和表述方法。TPS的工作逻辑基本上模仿人的思维过程 ,它通过对目标分子析分找出谋略键 ...
关键词:目标化合物 谋略键 反合成分析 
目标化合物析分系统中的重要算法被引量:1
《化学学报》2001年第2期241-246,共6页王利莎 袁身刚 欧阳政 郑崇直 
国家科技部"九五"重点攻关项目 ( 96-5 47-0 1-0 2 );国家基础发展规划 (G19980 5 115 );中法先进研究计划 (PRA98M -A0 36);国家自然基金 ( 2 9872 0 48);国家高性能计算基金 ( 995 0 7)资助项
介绍了目标化合物析分系统中所用到的三个重要算法 .它们是 :最短拓扑距离的求解、析分过程结束的判别以及合成树的构建 .分子结构中任意两个原子之间最短拓扑距离的求解是建立在采用队列数据结构的宽度优先搜索算法基础上的 .析分过程...
关键词:拓扑距离 宽度优先搜索 MORGAN算法 B-树算法 目标化合物析分系统 
含氟农药的比较分子场分析研究被引量:13
《化学学报》2000年第12期1540-1545,共6页谷妍 董喜城 陈海峰 陈敏伯 张世相 袁身刚 郑崇直 
国家科技部"九五"重点攻关项目(96-547-01-01;96-547-01-02);国家基础研究发展规划(G1998051115);国家自然基金(29832050);国家自然基金(29872048;29773058)
用比较分子场分析(CoMFA)方法对112种含氟农药分子的生物活性及毒性同时进行了定量构效关系研究.用78个化合物作为训练集,以距离比较方法(DISCO)确认的药效团为叠合规则构建CoMFA模型,发现影响活性的立体场与静电场的贡献分别为60.4%和...
关键词:3D-QSAR 比较分子场分析 含氟农药 生物活性 
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