药效团模型

作品数：137被引量：327H指数：8
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基于药效团模型对麻黄与细辛中抑制Toll样受体4化合物的虚拟筛选
《中国新药杂志》2025年第2期183-190,共8页李佳颖 邓芳 黄慧学 梁晓 
国家自然科学基金资助项目(82160778);广西高校中青年教师科研基础能力提升项目(2021KYO513)。
目的:基于共同分子特征药效团模型和分子对接技术,探讨麻黄与细辛药对中潜在抑制Toll样受体4(Toll-like receptor 4,TLR4)抗炎活性化合物的物质基础。方法:通过中药系统药理学分析平台(Traditional Chinese Medicine System Pharmacolog...
关键词：药效团 分子对接 麻黄 细辛 TOLL样受体4 支气管哮喘 
计算机辅助药物设计筛选鞘氨醇激酶1型抑制剂
《华西药学杂志》2024年第6期649-654,共6页苟渟婷 冯蓉 何俊 师健友 许建 龚军 叶强 
西南特色中药资源国家重点实验室开放基金(2021HX026);四川省科技计划项目(2022YFS0224)。
目的寻找和发现具有新骨架的鞘氨醇激酶1型(SphK1)抑制剂,并预测其活性。方法采用药效团模型和分子对接虚拟筛选ChemDiv数据库,得到排序靠前的化合物,并通过定量构效关系(QSAR)模型预测其活性。结果得到6个化合物,其Fit value值和分子...
关键词：鞘氨醇激酶1型 小分子抑制剂 计算机辅助药物设计 药效团模型 定量构效关系 广义波恩表面积模型 ADMET预测 虚拟筛选 分子对接 
PTP1B抑制剂药效团模型的构建及应用
《山东第一医科大学（山东省医学科学院）学报》2024年第9期528-532,共5页王桂玲 解钏浚 
泰安市科技创新发展项目(政策引导类)(2022NS330)。
目的构建蛋白酪氨酸磷酸酶1B(protein tyrosine phosphatase 1B,PTP1B)抑制剂的药效团筛选模型。方法通过收集文献中已报道的PTP1B小分子抑制剂,选择其中活性较强的化合物作为训练集,利用Discovery Studio中的HypoGen算法构建PTP1B抑制...
关键词：PTP1B 药效团模型 计算机辅助药物设计 
基于药效团模型的PPAR激动剂的筛选及活性研究
《中南药学》2024年第7期1705-1711,共7页李琦 魏朝 张鑫磊 郭凯蕾 马丽莎 何金穗 孙定康 梁佳龙 林佳艳 张彭湃 刘雪英 
陕西省2021年创新能力支持计划(No.2021GCZX-07号);陕西省秦创原“科学家+工程师”队伍建设(No.2023KXJ-080号)。
目的筛选具有PPARδ激动活性的化合物。方法通过构建PPARδ药效团模型对Top Science数据库中的780万个小分子进行筛选,并采用对接分析通过化合物与受体之间的结合作用模式及其靶点选择性进行筛选;通过分子动力学模拟的方法,确定苗头化合...
关键词：虚拟筛选 药效团模型 分子对接 分子动力学模拟 
基于中医药化学生物信息学探讨归芪白术方抑制葡萄膜黑色素瘤细胞增殖的物质基础被引量：1
《中国现代应用药学》2024年第14期1900-1912,共13页王锐峰 靳晓杰 刘昊 李程豪 张敏 李咪 李浩田 张宇 马欢欢 张月梅 
国家自然科学基金项目(82160857);甘肃省科技计划项目(21JR7RA352);甘肃省高等学校产业支撑计划项目(2022CYZC-54)。
目的利用药效团模型-分子对接-结合自由能计算的虚拟筛选策略结合细胞生物学实验的中医药化学生物信息学方法,挖掘归芪白术方中靶向磷脂酰肌醇3-激酶(phosphatidylinositide 3-kinases,PI3K)抑制葡萄膜黑色素瘤(uveal melanoma,UM)细胞...
关键词：葡萄膜黑色素瘤 归芪白术方 中医药化学生物信息学 药效团模型 
基于BiRNN模型的DPP-4和SGLT-2双靶点抑制剂设计
《现代药物与临床》2024年第7期1689-1703,共15页孙定康 张鑫磊 郭凯蕾 李琦 梁佳龙 马丽莎 林佳艳 何金穗 刁春妍 王育伟 刘雪英 
陕西省秦创原“科学家+工程师”队伍建设(2023KXJ-080号)。
目的 设计DPP-4和SGLT-2双靶点抑制剂。方法 根据现有的DPP-4和SGLT-2活性化合物训练BiRNN模型,使其生成具有潜在活性的双靶点新分子,并使用已经报道的活性化合物构建HipHop药效团模型,通过药效团模型对新分子进行初筛,然后使用分子对...
关键词：糖尿病 SGLT-2/DPP-4抑制剂 分子对接 药效团模型 分子动力学模拟 
靶向冠状病毒核衣壳蛋白NTD-RNA位点的小分子抑制剂虚拟筛选
《药物化学》2024年第2期147-155,共9页玄亚男 张娜 
核衣壳蛋白(Nucleocapsid Protein,N蛋白)是冠状病毒(CoVs)家族保守的结构蛋白,其N端结构域(NTD)与病毒RNA结合形成核糖核蛋白复合物(RNP),参与病毒复制与组装,已被认定为重要的抗冠状病毒药物靶点。以NTD-RNA结合位点为靶点,针对小分...
关键词：核衣壳蛋白 药效团模型 分子对接 虚拟筛选 
基于药效团模型筛选CTX-M-14型超广谱β-内酰胺酶抑制剂
《生物技术通报》2024年第6期319-329,共11页王梦帆 赵子玉 王春光 刘廷玉 陈曦 张铁 
河北省省级科技计划资助项目(21326617D);河北省现代农业产业技术体系建设专项资金(HBCT2024240207,HBCT2024250206)。
【目的】开发针对头孢噻肟-水解酶-14(CTX-M-14)型超广谱β-内酰胺酶(extended-spectrumβ-lactamase,ESBLs)的抑制剂,用以缓解细菌耐药带来的严重危害。【方法】使用DiscoveryStudio Visualizer(DS Visualizer)构建基于受体结构的药效...
关键词：甘草酸 CTX-M-14 药效团模型 分子动力学模拟 联合抑菌 
抗肿瘤新靶点MTH1抑制剂药效团模型的研究
《山东化工》2024年第6期10-14,共5页刘康博 张万存 顾月清 
国家自然科学基金(32201237);河南省科技攻关项目(232102311135)。
目的:研究抗肿瘤靶点人MutT同源体1蛋白(Human MutT Homolog-1,MTH1)抑制剂的构效关系,构建药效团筛选模型筛选潜在的MTH1抑制剂。方法:采用计算机辅助药物设计方法,通过Discovery Studio 3.0软件包中分子共同特征药效团HipHop算法,使...
关键词：人MutT同源体1抑制剂 抗肿瘤靶点 虚拟筛选 药效团模型 分子对接 
基于虚拟筛选和分子动力学模拟发现新型ULK1抑制剂被引量：3
《化学通报》2024年第1期92-97,1,共7页杨艺璠 宋秀庆 高志明 未朝春 闫红 钟启迪 
河北省自然科学基金项目(C2020209081)资助。
Unc-51样自噬激活激酶1(ULK1)作为自噬启动的重要调控因子,是肿瘤治疗的关键靶点之一。首先,以已知ULK1抑制剂为基础构建药效团模型,通过药效团模型筛选、分子对接以及分子力学广义波恩表面积(MM/GBSA)结合自由能计算等方法,对含有52万...
关键词：ULK1抑制剂 药效团模型 分子对接 分子动力学模拟 
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