Java AWT和JAI技术在生物数据库图像显示上的应用  

Creating Images for Biological Databases with Java AWT and JAI

作　　者：李泽[1] 赵晓飞[1] 沈翔[2] 张国庆[2] 郭景康[1] 王健[1,2] 

机构地区：[1]上海大学生命科学学院,上海200444 [2]上海生物信息技术研究中心,上海200235

出　　处：《生物信息学》2010年第4期347-349,355,共4页Chinese Journal of Bioinformatics

基　　金：上海市科学技术委员会上海研发公共服务平台建设专项资金(07DZ22901)

摘　　要：利用Java AWT和JAI技术绘制生物图像的方法可以使在实验室中得到的生物实验数据自动转化为需要的图谱,并且图像的精确度高。绘制成的图像既可以保存在本地硬盘中,也可以在浏览器中以网页的形式展示出来供研究人员分析使用。该方法目前已在上海生物信息技术研究中心开发的可视化工具MapViewer和主题数据库H2H,SRA中得到应用。Here we describe a method that uses Java AWT and JAI to create genome map.This method can transform the biological data to interactive maps displayed on webpages with precision.This technology has been applied to LSBI sites such as MapViewer browser,H2H database and SRA database,which was developed by Shanghai Center for Bioinformation Technology.

关 键 词：AWT JAI 基因组图谱 

分 类 号：TP392[自动化与计算机技术—计算机应用技术]