基因组图谱

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基于缺氧相关基因的头颈部鳞状细胞癌分子分类及STC2的临床意义
《口腔疾病防治》2025年第5期345-358,共14页朱嘉宁 王天天 张瑞 宋红权 
黑龙江省自然科学基金项目(LH2022H0569);黑龙江省博士后科研启动基金(LBH-Q21143)。
目的基于缺氧相关基因(hypoxia-related genes,HRGs)表达谱构建头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)分类系统,并探讨缺氧基因斯钙素2(stanniocalcin 2,STC2)的临床病理特征及生物学功能。方法从癌症基因组图...
关键词：头颈部鳞状细胞癌 口腔鳞状细胞癌 缺氧相关基因 癌症基因组图谱 生物信息学分析 斯钙素2 预后标记 预后模型 肿瘤微环境 免疫治疗 
hsa-miR-17-3p在膀胱癌中的表达及其与预后、免疫浸润及免疫治疗效果的关系
《海南医学》2025年第7期913-918,共6页蒋曼妃 王宝锋 黄清迈 胡强华 车宪平 
海南省自然科学基金(编号:819MS127);海南省科技厅高层次人才项目(编号:822RC842)。
目的探讨hsa-miR-17-3p在膀胱癌(BLCA)中的表达及其与预后、免疫浸润及免疫治疗效果的关系。方法从TCGA数据库(截至2024年)下载418例BLCA组织样本和19例正常组织样本的miRNA表达数据以及相应的临床数据。首先,使用R语言中的“limma”包...
关键词：hsa-miR-17-3p 膀胱癌 癌症基因组图谱 免疫细胞浸润 富集分析 
TCGA与CGGA脑胶质瘤相关数据库的研究及应用现状
《中华神经外科杂志》2025年第3期302-309,共8页冯宇童 张莹 江涛 保肇实 
首都医科大学优秀青年人才培育项目(B2101);中国医学科学院临床与转化医学研究专项(2022-I2M-C&T-B-115)。
脑胶质瘤是成人颅内最好发的恶性肿瘤,致死率和致残率均高。近年来,生物检测技术的快速发展为脑胶质瘤的精确识别及个性化治疗方案的制定提供了支持,技术的进步与数据库的完善共同推动了全新的癌症研究。两者相得益彰,共同促进了脑胶质...
关键词：中国脑胶质瘤基因组图谱 癌症基因组图谱 
肿瘤蛋白D52基因在乳腺癌组织中的表达与临床意义
《标记免疫分析与临床》2025年第3期522-527,共6页王雨新 王威 黄奔 张燕 
TLR8介导卵巢癌Tregs免疫抑制功能逆转的分子机制研究(编号:81772779)。
目的探讨肿瘤蛋白D52(TPD52)基因在乳腺癌组织中的表达水平,分析其与患者临床病理学特征和预后的关系,并进一步探究TPD52在乳腺癌发生发展中可能的生物学功能。方法通过TCGA、GTEx以及在线数据库分析TPD52在乳腺癌组织和正常癌旁组织中...
关键词：肿瘤蛋白D52 乳腺癌 预后 标志物 癌症基因组图谱 
肺癌患者免疫微环境评分及与预后的关系
《癌症进展》2025年第5期572-576,共5页王丽飞 许帧 刘倩 陈康 
常州市卫生健康青苗人才资助项目(CZQM2022016)。
目的利用生物信息学方法分析肺癌患者免疫微环境评分及与预后的关系。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载肺癌患者的临床数据,分析出差异表达基因(DEG),使用STRING在线工具分析DEG的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,比较不同DEG表...
关键词：肺癌 癌症基因组图谱 基质评分 免疫评分 免疫微环境 
不同分子分型子宫内膜癌的淋巴脉管间隙浸润情况的临床分析
《中文科技期刊数据库(文摘版)医药卫生》2025年第2期083-086,共4页王梵 王龙 马倩 
探讨不同分子分型子宫内膜癌患者的临床脉管间隙浸润(LVSI)情况的临床特征。方法 采用回顾性分析方式,对医院2022年7月至2024年7月期间收治的子宫内膜癌患者56例作为观察对象,以癌症基因组图谱(TCGA)将患者划分为POLE超突变型(POLE mut)...
关键词：子宫内膜癌 淋巴转移 淋巴管 肿瘤浸润 癌症基因组图谱分型 
SMC1A在乳腺癌中的表达及对乳腺癌细胞凋亡的影响
《南京医科大学学报(自然科学版)》2025年第2期245-252,共8页丁峰 喻夏飞 朱妍慧 杨君哲 吴娴 刘晓安 邹黎 
国家自然科学基金(82072931);南京医科大学科技发展基金(NMUB20220098)。
目的:探讨染色体结构维持蛋白1A(structural maintenance of chromosome 1A,SMC1A)在乳腺癌中的表达情况,分析其与临床病理特征的相关性以及对乳腺癌细胞凋亡的影响。方法:利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库分析S...
关键词：乳腺癌 SMC1A 细胞凋亡 癌症基因组图谱 
基于转录组测序数据构建线粒体相关基因模型以评估肝细胞癌免疫、预后和治疗特征
《中华微生物学和免疫学杂志》2025年第1期53-63,共11页汤婷 李钰博 张昕彤 胡艳芬 吴昊 朱剑军 李莉 刘铭 
中国博士后科学基金(2023M732157);山西省基础研究计划项目(202103021224228,20210302124376,202303021211114)。
目的在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中构建线粒体相关基因(mitochondria-related genes,Mito-RGs)模型,基于模型预测HCC免疫、预后和治疗特征,为HCC的诊断和治疗提供新思路。方法从癌症基因组图谱数据库中获得肝细胞癌的表...
关键词：肝细胞癌 线粒体相关基因 癌症基因组图谱 转录组测序 预后 
基于癌症基因组图谱数据库挖掘乳头状肾细胞癌预后相关基因
《中华实验外科杂志》2025年第1期130-133,共4页马彦 马静 赵鹏程 田沛 冯超杰 
目的采用生物信息学方法对癌症基因组图谱(TCGA)数据库进行挖掘,寻找影响乳头状肾细胞癌(KIRP)患者预后的相关基因。方法TCGA中下载KIRP患者相关数据,应用RStudio软件筛选差异表达基因,cluster Profiler包对上调及下调表达前50的差异基...
关键词：乳头状肾细胞癌 减数分裂结构特异性核酸内切酶1 着丝粒蛋白H DNA结合蛋白2 细胞分裂周期45 富含亮氨酸重复蛋白20 生物信息学 
细胞衰老相关的CASC15/hsa-miR-30c-5p/ SERPINE1轴影响胃癌的发生发展
《临床医学进展》2025年第1期1110-1124,共15页张康洋 王子晨 郭振 张伟 孙培春 
河南省医学科技攻关计划项目(SBGJ202102025)。
目的:寻找影响胃癌发生发展的衰老基因,构建内源竞争性RNA (ceRNA)调控网络,为发掘胃癌有效的诊断、预后生物标志物和治疗靶点提供依据。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载胃癌的表达数据和临床生存数据,在Aging Atlas数据库中获...
关键词：胃癌 SERPINE1 衰老基因 ceRNA 癌症基因组图谱 
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