蒙古冰草基因组类反转录转座子基因同源序列的克隆与序列分析  

Isolation and Sequence Analysis of a Retrotransposon-like Sequence Derived from Agropyron mongolicum Keng

作　　者：石凤敏[1] 云锦凤[1,2] 赵彦[1,2] 张瑞霞[3] 

机构地区：[1]内蒙古农业大学生态环境学院,内蒙古呼和浩特010018 [2]内蒙古自治区草品种育繁工程技术研究中心,内蒙古呼和浩特010018 [3]内蒙古大学,内蒙古呼和浩特010021

出　　处：《华北农学报》2010年第6期52-56,共5页Acta Agriculturae Boreali-Sinica

基　　金："973"项目子课题(2007CB108901-1);国家自然科学基金资助项目(30760159);内蒙古草业重大专项(20091401)

摘　　要：以蒙古冰草DNA为模板,采用PCR扩增的方法从蒙古冰草（Agropyron mongolicumKeng）中分离得到了一个类反转录转座子基因序列,命名为MwRRT（GenBank：GQ855806.1）。序列分析结果表明：该序列长为1 005 bp,包含780 bp的开放阅读框,编码260个氨基酸。经GenBank中BLAST程序分析表明,该片段98~255处氨基酸与水稻（Oryza sativa）预测逆转录转座子蛋白Ty3-gypsy亚类、预测种属特异抗原—聚合酶（Gag-Pol）前体和预测聚合酶氨基酸同源性为47%;与高粱（Sorghum bicolor）的预测GAG-POL前体氨基酸同源性为52%。A new DNA fragment was amplified by PCR from DNA of Agropyron mongolicum Keng and was named MwRRT（GenBank：GQ855806.1）.Sequencing results showed that MwRRT was composed of 1 005 bp and encoded 260 amino acid residues.The homologies analysis of the amino acid sequence in GenBank showed that： it has 47% identity with putative retrotransposon protein Ty3-gypsy subclass、putative gag-pol precursor and putative polyprotein in Oryza sativa at the 98-255 amino acid;it has 52% identity with putative gag-pol precursor in Sorghum bicolor.

关 键 词：蒙古冰草 反转录转座子 克隆 

分 类 号：S543.9[农业科学—作物学] Q78[生物学—分子生物学]