基于弹簧模型的基因表达数据可视化聚类  

Gene Expression Data Visualization Clustering Based on Spring Model

作　　者：颜文胜[1] 

机构地区：[1]台州职业技术学院设备与网络管理中心,浙江台州318000

出　　处：《计算机工程》2011年第5期202-203,206,共3页Computer Engineering

基　　金：2010年浙江省教育技术研究规划基金资助项目(JB019);2010年台州市科技计划基金资助项目(100ky68)

摘　　要：依据基因表达数据的特点,提出一种基于弹簧模型的基因表达数据可视化聚类方法,将多维空间的基因表达数据映射到二维空间中,较好地保持了原始多维数据间的时空相似性。实验结果表明,该方法能发现基因表达数据集中隐含的类簇结构以及共表达基因模式。According to the characteristic of gene expression data,this paper proposes a gene expression data visualization clustering method based on spring model.It projects the multi-dimensional gene expression data to 2D space,and keeps some temporal-spatial features in the original data after mapping.Experimental results demonstrate that the method is effective and can discover the co-expression pattern and cluster structure in the data.

关 键 词：基因表达数据 可视化聚类 弹簧模型 共表达基因 

分 类 号：TP393[自动化与计算机技术—计算机应用技术]