徐淮山羊PPAR基因cDNA的克隆和生物信息学分析  

作　　者：秦玉蓉[1] 许峰[1] 田智泉[1] 高波[1] 张振韬[1] 阴彦辉[1] 孙敏[1] 李碧春[1] 

机构地区：[1]扬州大学动物科学与技术学院,江苏扬州225009

出　　处：《江苏农业科学》2011年第2期59-61,共3页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：国家转基因重大专项(编号:2008ZX08008-003;2009ZX08008-003B)

摘　　要：为克隆徐淮山羊过氧化氢酶体激活增殖受体(PPAR)基因的cDNA,探讨徐淮山羊PPAR基因的生物信息学功能。根据GenBank中发表的绵羊PPAR基因序列,设计并合成1对引物,采用RT-PCR方法克隆徐淮山羊脂肪组织中PPAR基因cDNA,提交GenBank,并运用DNAStar软件及在线工具进行生物信息学分析。成功克隆出徐淮山羊PPAR基因的编码区全序列cDNA,大小为1 428 bp,GenBank登录号为GU082382,有起始密码子ATG和终止密码子TAG,编码475个氨基酸;徐淮山羊PPAR基因序列与鸡、鼠、猪、牛、绵羊相应编码区(CDS)的同源性分别为81%、89%、92%、98%、99%,徐淮山羊PPAR氨基酸序列与鸡、鼠、猪、牛、绵羊的PPAR氨基酸序列同源性分别为92.9%、97.3%、98.3%、99.6%、99.8%;PPAR蛋白无信号肽区域,属于非分泌型蛋白。

关 键 词：徐淮山羊 过氧化氢酶体激活增殖受体 CDNA 克隆 生物信息学 

分 类 号：Q785[生物学—分子生物学]