系统发育树的构建方法  

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出  处:《微生物学报》2011年第7期983-983,共1页Acta Microbiologica Sinica

摘  要:构建系统树是为了鉴定菌株的分类学地位,应该使用正确的方法构建。具体要求如下:1.将鉴定菌的16S rRNA序列递交GenBank,用Blast软件搜索相似的16S rRNA,然后一起构树。2.采用能反应分支长度的软件(如NJ法),并用Boostrap值分析分支聚类的稳定性。3.用国际较为通用的一些建树方法,如Neighbour-Joining等,这样结果就更为可靠,更直观。

关 键 词:系统发育树 RRNA序列 GENBANK 软件搜索 分类学地位 BLAST 16S 系统树 

分 类 号:Q939[生物学—微生物学]

 

参考文献:

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