GENBANK

作品数:163被引量:375H指数:9
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维管植物质体DNA数据在物种和区域上的空缺研究
《植物学报》2025年第1期1-16,共16页邓言 鲁丽敏 张强 陈之端 胡海花 
国家自然科学基金(No.32200190,No.32122009)。
在植物大数据时代,测序数据成为众多生物学研究的重要基础,了解测序数据的现状有利于更好地利用这些数据。质体DNA数据因易获取、单亲遗传及变异速率适中而被广泛应用。基于GenBank公共数据库全面评估和分析了全世界维管植物质体DNA数...
关键词:质体DNA 维管植物 数据缺失 植物大数据 GENBANK 
GenBase: A Nucleotide Sequence Database
《Genomics, Proteomics & Bioinformatics》2024年第3期107-112,共6页Congfan Bu Xinchang Zheng Xuetong Zhao Tianyi Xu Xue Bai Yaokai Jia Meili Chen Lili Hao Jingfa Xiao Zhang Zhang Wenming Zhao Bixia Tang Yiming Bao 
supported by the Strategic Priority Research Program of the Chinese Academy of Sciences(Grant No.XDB38030200);the National Key R&D Program of China(Grant No.2021YFF0703701);the Professional Association of the Alliance of International Science Organizations(Grant No.ANSO-PA-2023-07);the International Partnership Program of the Chinese Academy of Sciences(Grant No.161GJHZ2022002MI);the Open Biodiversity and Health Big Data Initiative of International Union of Biological Sciences(IUBS).
The rapid advancement of sequencing technologies poses challenges in managing the large volume and exponential growth of sequence data efficiently and on time.To address this issue,we present GenBase(https://ngdc.cncb...
关键词:Nucleotide sequence DATABASE GenBase GENBANK INSDC 
GenBank中裂腹鱼类CO I基因序列的分子标记有效性
《中国水产科学》2022年第7期1073-1090,共18页袁晓倩 迪丽娜·茹斯坦木 张琪 韩洁 
科技部国家科技基础资源调查专项(2019FY101700);生物多样性与生态工程教育部重点实验室自主课题
裂腹鱼类(Schizothoracids)分布有复杂的水系格局,在形态学鉴定时有些鱼种容易混淆。线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(COI)基因是动物学研究中常用的物种分子条形码,分析GenBank数据库中裂腹鱼类COI作为分子标记的有效性,可以加深理解和认...
关键词:裂腹鱼类 CO I 分子标记有效性 GENBANK 
Using DNA Sequences and Phylogenetic Trees as Tools for Teaching Entomology to Undergraduate Students: A Simple Approach
《Advances in Entomology》2021年第4期147-154,共8页Mohammad Ali Al-Deeb 
This technical note aims to show how any instructor teaching entomology can use the Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) and the “one click” mode of Phylogeny.fr to teach undergraduate students about insect DNA...
关键词:DNA Sequence Phylogenetic Tree GENBANK TEACHING ENTOMOLOGY 
基于ITS条形码序列的光慈菇药材及其混伪品的分子鉴定
《当代农机》2021年第9期42-45,共4页孙传伯 李道远 陈存武 赵群 
国家自然科学基金面上项目(项目批准号81872955);安徽高校自然科学研究重大项目(KJ2016SD61);安徽省优秀青年人才计划项目(gxyq2018061、gxyq2020127);安徽高校自然科学研究重点项目(KJ2017A403、KJ2015A454、KJ2013A264)。
本研究以水蓼Polygonum hydropiper的1条ITS序列(GenBank登录号为JF977851)为外群,光慈菇Tulip bulb正品及其混伪品的ITS序列作为内群,其中正品光慈菇的基原植物为老鸦瓣Amana edulis,混伪品主要有金果榄Tinospora capillipes、青牛胆T....
关键词:光慈菇 GENBANK ITS 单系 
Erratum to: Bat origin of a new human coronavirus: there and back again
《Science China(Life Sciences)》2020年第7期1098-1098,共1页Xiang Li Yuhe Song Gary Wong Jie Cui 
We miscalculated identities of several genes, and the corrected Table 1 should be as follows:a、 This table demonstrates identities of 2019-nCoV WIV04 (GenBank Accession No. MN996528.1) compared with bat SARSr-CoV RaT...
关键词:GENBANK there and back again Bat origin of a new human coronavirus Erratum to ORIGIN 
The unbearable lightness of sequenced-based identification被引量:3
《Fungal Diversity》2019年第3期243-284,共42页Valerie Hofstetter Bart Buyck Guillaume Eyssartier Sylvain Schnee Katia Gindro 
Using the basic GenBank local alignment search tool program(BLAST)to identify fungi collected in a recently protected beech forest at Montricher(Switzerland),the number of ITS sequences associated to the wrong taxon n...
关键词:Fungal inventory GENBANK Nuclear ribosomal DNA internal transcribed spacers(ITS) Switzerland Type sequence 
BioAnalyzer: Bioinformatic Software of Routinely Used Tools for Analysis of Genomic Data
《Advances in Bioscience and Biotechnology》2019年第3期33-41,共9页Peter Tharwat Habib Alsamman Mahmoud Alsamman Aladdin Hamwieh 
The massive extension in biological data induced a need for user-friendly bioinformatics tools could be used for routine biological data manipulation. Bioanalyzer is a simple analytical software implements a variety o...
关键词:Biopython Bioinformatics FASTA GENBANK Multiple Sequence Alignment BLAST NCBI Data Visualization 
基于GenBank 数据对红柴胡nrDNA序列ITS2片段的分析被引量:1
《安徽农业科学》2019年第4期114-116,共3页王鹤 杨娜 徐丹丹 孙明阳 郭宏莉 关鑫 王世聪 王长宝 
国家自然科学基金项目(81441132);佳木斯大学骨干人才支持计划项目(JMSURCGG2016-001);"北药与功能食品"黑龙江省特色学科资助项目
[目的]了解红柴胡nrDNA序列ITS2片段特征,为中药柴胡的分子鉴定提供科学依据。[方法]从GenBank中获取已公布红柴胡ITS全长序列38条和ITS2序列3条,利用MEGA6.0进行多序列比对,分析ITS2片段碱基成分、变异位点、信息位点,计算遗传距离,并...
关键词:红柴胡 ITS2 遗传距离 发育分析 
贵州省巴鲵属一新纪录——巫山巴鲵被引量:1
《四川动物》2018年第5期575-576,共2页赵海涛 胡思玉 陈永祥 
贵州省科技拔尖人才项目(黔教合[2017]096);贵州工程应用技术学院动物生物学优秀教学团队项目(2017SZ006);贵州高原湿地生态工程协同创新中心项目(2015XT003)
2012年3月,作者在黔西北乌蒙山区大方县三元乡考察时,发现并采集小鲵雄性成体4只,经形态特征鉴定,以及与重庆巫山(GenBank下载)标本进行的线粒体COⅠ基因序列比对,确定为巫山巴鲵Liua shihi(Liu,1950)。迄今未见贵州省有巫山巴鲵的报道...
关键词:贵州省 巫山 GENBANK 工程学院 形态特征 COⅠ基因 乌蒙山区 序列比对 
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