中国近海13种对虾分子系统演化和近似种问题的研究  

Study on Molecular Evolutionary of 13 Kinds of Penaeidae in the Offshore of China and Allied Species

作　　者：麦维军[1] 张吕平[2] 沈琪[2] 胡超群[2] 

机构地区：[1]江苏大学生命科学研究院,江苏镇江212013 [2]中国科学院南海海洋研究所,广东广州510301

出　　处：《安徽农业科学》2011年第18期11122-11126,共5页Journal of Anhui Agricultural Sciences

基　　金：863国家重点基础研究发展规划项目(006AA10A406);国家自然科学基金青年项目(31001132);中国博士后基金面上项目(20090460784);LMB2009年度开放基金项目(LMB091008);江苏大学高级专业人才科研启动基金项目(128133001)

摘　　要：对中国沿海13种对虾科动物的16S rRNA基因(约371 bp)和细胞色素氧化基因I(COI)部分序列(约385 bp)进行了分析,并采用"最大简约法"、"最小进化法"和"最大似然法"构建了分子系统树。结果表明:在COI基因序列中,有113个位点存在变异(约为总位点数的31.8%),高于16S rRNA基因序列的44个变异位点(约为总位点数的11.9%);构建的分子系统树显示,所构建的NJ、ME和MP树的拓朴结构较为相似,但斑节对虾、日本对虾和缘沟对虾在3个树中相聚位置不同。中国沿海对虾科6属13种,形成3个明显的分支,这3支分别隶属新对虾属、仿对虾属和原对虾属。对虾属、新对虾属、仿对虾属的种间关系与分子系统发育分析结果与传统分类学相一致。16S rRNA序列可能更适用于对虾属以上阶元的遗传多样性分析;COI序列更适合对虾科种间和群体遗传多样性的研究。APartial sequences of 16S rRNA gene （about 371 bp） and cytochrome oxidase I （about 385 bp） gcne from 13 shrimp species from South China Sea were analyzed. Molecular phylogenetie trees were reconstructed using Maximum Parsimony （MP） method and Maximum Likeli- hood （ML） method as well as Maximum Likelihood. According to the results, 113 nucleotide sites substituted in COI gene （3l. 8% of the total nucleotide sites in COI gene）and 44 nucleotidc sites substituted in 16S rRNA gene（ 11.9% nucleotide sites substituted in 16S rRNA gene） were obtained. The phylogeny resulting from the combined 16S and COI partial sequences showed that these species form three well-supported mono- phyletic clades consistent with the three genera proposed in a recent systemalic review of the suborder Dendrobranchiata. This contl＂asted with con- clusions drawn from recent molecular phylogenetic work on penaeid shrimps based on partial sequences of the mitochondria] COI region that sup- port recent revisions of the Dendrobranchiata based on morDholozical analysis.

关 键 词：对虾科 分子系统发育 16S RRNA COI 

分 类 号：S96[农业科学—水产养殖]