计算机克隆大片段EST序列的方法研究  

作　　者：杨灿珠[1] 凌伦奖[1] 宣震宇[1] 陈润生[1] 

机构地区：[1]中国科学院生物物理研究所,北京100101

出　　处：《自然科学进展（国家重点实验室通讯）》1999年第9期812-817,共6页

基　　金：国家自然科学基金重大资助项目(批准号:39392900)

摘　　要：构建了从表达序列片段(Expressed sequence tags,EST)数据库进行基因计算机克隆的一系列软件,并对程序中的重要参数进行了认真调试。为保证克隆片段的质量,筛选、建立了载体序列、种子序列和人EST序列等多个数据库,同时发展了相应的理论检验方法。软件系统建成后,从GenBank中取出4 562条人成纤维细胞EST作为种子序列,在大型计算机上进行克隆、组装,最后得到了238条kb量级的contig。结果表明,组建的软件系统是可靠、有效的。目前,正在应用该系统作大规模的人类基因克隆。

关 键 词：EST序列 基因 计算机克隆 人类基因组计划 

分 类 号：Q78[生物学—分子生物学] Q987