EST序列

作品数：128被引量：601H指数：14
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熊猫EST序列的生物信息学分析
《当代畜禽养殖业》2021年第5期29-31,共3页张帅团 邵俊红 白俊艳 樊红灯 陈梦柯 牛程炜 王龙威 李静云 王新乐 王亮 
河南科技大学校本研究项目。项目名称:河南科技大学学生创新创业能力提升策略。项目编号:XBYJ2020016。。
熊猫是我国的国宝,是生物界的“活化石”。但是由于种种原因,熊猫的数量逐渐减少,其中繁殖率低是一个很重要的因素。所以通过各种方法提高熊猫的繁殖率就显得尤为重要,而熊猫基因组序列图谱的绘制不失为解决这一问题的好办法之一。本文...
关键词：熊猫 EST SSR 生物学信息 
牛樟芝菌丝体全长cDNA文库构建及EST序列分析被引量：1
《中草药》2020年第4期1052-1059,共8页李晶 陈莉 刘朋虎 夏舒宁 刘艳玲 林占熺 
福建省教育厅中青年科技项目“牛樟芝深层发酵及其三萜成分差异研究”(JT180121)。
目的为了更好地挖掘牛樟芝Antrodiacinnamomea菌丝体三萜合成和代谢相关基因、筛选互作蛋白和牛樟芝指纹图谱分析,构建了牛樟芝菌丝体cDNA文库并分析其表达序列标签(EST)序列。方法以牛樟芝菌丝体为材料,采用Gateway法构建其cDNA文库,...
关键词：牛樟芝 CDNA文库 表达序列标签 GO功能注释 SSR 
香蕉EST-SNP标记的开发
《江苏农业科学》2019年第21期107-110,共4页赵涛 王静毅 刘菊华 徐碧玉 金志强 
海南省重点研发计划(编号:ZDYF2018097);国家自然科学基金(编号:31501043);国家现代农业产业技术体系建设专项(编号:CARS-31);中央级公益性科研院所基本科研业务费项目(编号:1630052017018)
为发掘出一批香蕉的SNP位点、进一步研究香蕉的遗传关系、相关性状的定位等打下基础,从美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)的dbEST数据库下载46665条香蕉EST序列,经生物信息学方法分析发掘E...
关键词：香蕉 EST序列 SNP位点 重叠群 转换 颠换 序列比对分析 遗传多样性 
甜叶菊EST序列特征分析与分子标记开发被引量：2
《分子植物育种》2019年第15期5045-5050,共6页盛文涛 邓建兰 饶友生 柴学文 邹鑫 
江西省教育厅科技项目(GJJ161243);南昌师范学院11531工程项目共同资助
为了明确甜叶菊EST序列中SSR的总体特点,开发甜叶菊EST-SSR分子标记,为利用EST-SSR标记开展甜叶菊分子遗传研究提供科学依据。本研究从NCBI数据库中下载获得了5 646条EST序列,利用在线软件SSRtool和Websat检测所含SSR位点进行分析。结...
关键词：甜叶菊 NCBI 多态性 EST-SSR 
绒毛状烟草和林烟草全长cDNA文库构建及EST序列分析
《中国烟草科学》2018年第5期9-16,共8页孙榕 陈明丽 解敏敏 孙玉合 龚达平 
中国农业科学院烟草研究所青年基金项目"烟草腺毛NtTe基因的精细定位"(2015B01);中国烟草总公司烟草基因组计划重大专项项目"K326和红花大金元蚜虫抗性的定向改良"(110201801024JY-01)
表达序列标签(EST)广泛应用于基因功能研究和分子标记开发。以普通烟草两个二倍体祖先种绒毛状烟草(Nicotiana tomentosiformis, TT)和林烟草(Nicotiana sylvestris, SS)多个组织为试验材料,使用CloneMiner cDNA文库构建方法构建了均一...
关键词：烟草 CDNA文库 EST SNP SSR 
应用石斛EST序列对SNP位点开发与分析
《东北林业大学学报》2018年第5期74-80,85,共8页毛立彦 龙凌云 檀小辉 檀业维 韦勇杰 於艳萍 宾振钧 覃剑锋 覃茜 金刚 
广西自然科学基金项目(2016GXNSFAA380093);广西亚热带作物研究所基本科研业务费专项资金项目(桂热研201602)
利用生物信息学手段,从NCBI中db EST数据库获取大量的石斛属(Dendrobium Sw.)EST序列,对SNP与EST的数量及拼接结果之间的关系、SNP碱基置换的偏好性进行了分析。采用DNASTAR软件中的SeqMan程序对获取的16 183条石斛EST序列构建叠连群,得...
关键词：石斛 EST序列 SNP位点 
黄独冻后培养愈伤ESTs序列和抗氧化酶的qPCR验证
《分子植物育种》2018年第7期2237-2243,共7页夏瑾华 贺伟华 
国家自然科学基金项目(31360072);江西省教育厅2014年度科学技术研究一般项目(GJJ14712)共同资助
为了对黄独冻后培养胚性愈伤组织正反向SSH-ESTs序列的测序分析及其抗氧化酶进行检测,本研究对其SSH-ESTs(A1~A4以及B1~B16)以及其抗氧化酶如过氧化氢酶(CAT)、过氧化物酶(POD)、超氧化物歧化酶1(Cu Zn-SOD)和过氧化物歧化酶2(Mn-SOD)...
关键词：黄独 冻后培养 胚性愈伤组织 正反向SSH-EST序列 抗氧化酶 qPCR检测 
西施舌浮游幼虫cDNA文库构建及EST序列初步分析被引量：3
《内蒙古民族大学学报（自然科学版）》2018年第1期49-55,共7页郭永明 孟学平 
江苏省自然科学基金项目(BK20131210)
为了研究西施舌浮游幼虫阶段的基因表达规律,构建了7日龄浮游幼虫的cDNA文库,对文库质量的分析结果表明,cDNA文库的库容量为2.3×10~5,重组率达95%,平均插入片段长度1.0 kb左右.挑取cDNA克隆进行5′端测序,总共进行了304个成功反应,其中...
关键词：西施舌 浮游幼虫 CDNA文库 表达序列标签(EST) 
基于甾体皂苷的襄麦冬块根抑制性差减杂交文库的构建被引量：1
《西南农业学报》2018年第2期245-252,共8页余海忠 王海燕 赵慧君 孙永林 
国家星火计划面上项目(2015GA760011);湖北省自然科学基金面上项目(2013CFC025);湖北省高等学校优秀中青年科技创新团队计划项目(T201616)
【目的】甾体皂苷是襄麦冬块根主要活性成分之一,为了能在分子水平上实现对相关基因的表达调控,从而使甾体皂苷含量的提高成为可能,筛选参与甾体皂苷合成的蛋白或酶就非常必要。【方法】本实验以襄麦冬始见期块根和采收期块根作为实验样...
关键词：襄麦冬 SMART法 甾体皂苷 抑制性差减杂交 EST序列分析 
长白山鸡爪苓菌核cDNA文库的部分EST序列生物信息分析被引量：1
《延边大学农学学报》2017年第4期7-16,共10页蒋雨函 李杨 李艳茹 李太元 郑大浩 许广波 
国家自然科学基金项目[31160014]
探求由鸡爪苓菌丝体形成菌核的关键结构基因,为深入研究该珍稀药用真菌的生长发育、代谢调控以及优质种质资源的开发、利用与保护提供理论基础。从鸡爪苓菌核全长cDNA文库中随机筛选500个单独克隆进行单方向测序,选取3条全长的ESTs序列...
关键词：鸡爪苓菌核 DNA文库 EST分析 生物信息 
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