SNP位点

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基于全基因组SNP位点和性状特征解析我国野生肺形侧耳的遗传多样性
《生物技术通报》2025年第3期282-293,共12页岳园园 胡哲源 何琪 黄晨阳 郑素月 赵梦然 
国家重点研发计划(2022YFD1200600);现代农业产业技术体系建设专项(CARS20)。
【目的】探究我国野生肺形侧耳(Pleurotus pulmonarius)的遗传变异水平,以期为新品种选育提供优异亲本材料和数据支撑。【方法】利用全基因组重测序技术获得的SNP标记对37个野生肺形侧耳菌株进行遗传多样性分析,同时观测其菌丝培养特征...
关键词：秀珍菇 遗传变异 单核苷酸多态性 表型特征 
味觉SNP与环境因素对老年群体认知功能的影响
《广西科学院学报》2025年第1期45-57,共13页胡帅军 陈宁园 黄玲 覃源 彭均华 潘尚领 
国家自然科学基金项目(32060188,81860205,82360286)资助。
本研究旨在探讨遗传因素及其与环境因素的交互作用对广西红水河流域老年人群认知功能的影响。研究纳入895名广西红水河流域的老年人,采用病例-对照设计,将其分为认知正常组和认知损害组进行比较。通过提取外周血DNA检测味觉相关的单核...
关键词：味觉功能 认知功能 GMDR 味觉相关SNP位点 健康长寿 
海南黑山羊SAA3基因多态位点筛查与生物信息学分析
《现代畜牧兽医》2025年第3期1-6,共6页陈祥英 陈韬羽 高宏岩 陈思 满初日嘎 杜丽 王凤阳 陈巧玲 
海南省自然科学基金(324RC447);国家现代农业产业技术体系项目(财政部和农业农村部-CARS38);海南省院士创新平台科研专项(No.YSPTZX202013)。
试验旨在探究海南黑山羊SAA3基因的结构特征及其遗传分布情况,为进一步探索该基因的表达调控机制及免疫功能提供参考。试验采集200只海南黑山羊的血液样本,采用Sanger法测序对海南黑山羊SAA3基因的单核苷酸多态性(SNP)位点进行检测,对...
关键词：海南黑山羊 SAA3基因 SNP位点 生物信息学 
清远麻鸡SNCA基因分子标记位点与其产蛋性状的关联分析
《养禽与禽病防治》2025年第2期20-23,共4页马曼婷 杜庆滔 蔡柏林 聂庆华 
科技创新2030-重大项目(2023ZD04064)。
为了探究清远麻鸡SNCA基因分子标记位点与产蛋性状的关联性,本研究以386只清远麻鸡为研究对象,检测发现SNCA基因上含有5个SNPs位点(g.34968127G>A、g.34968168C>T、g.34968180G>A、g.34968195C>A和g.34968221C>T)。通过对5个SNPs位点进...
关键词：清远麻鸡 SNCA基因 SNP位点 产蛋性状 
基于SNP位点及系统进化树分析辽宁省水痘-带状疱疹病毒基因特征
《中华微生物学和免疫学杂志》2024年第12期1067-1075,共9页王文思 王艳 王樱槥 方兴 安淑一 郭晋源 费思平 
目的分析辽宁省水痘-带状疱疹病毒(varicella-zoster virus,VZV)基因序列,确定流行的优势基因型及核苷酸、氨基酸变异情况。方法PCR方法对2017-2020年辽宁省31株VZV基因组开放阅读框(open reading frame,ORF)1、6、12、16、17、21、22...
关键词：水痘-带状疱疹病毒 基因型 单核苷酸多态性 系统进化树 
基于液相芯片“黄海芯1号”55K SNP信息开展凡纳滨对虾收获体重的ssGWAS和FarmCPU分析
《水产学报》2024年第12期40-50,共11页夏岩 孔杰 王平 傅强 罗坤 陈宝龙 隋娟 周浩 孟宪红 代平 曹家旺 谭建 强光峰 刘绵宇 栾生 
国家重点研发计划(2022YFD2400202);中国水产科学研究院科技创新团队(2020TD26);现代农业产业技术体系专项(CARS-48);广东省“十四五”广东省农业科技创新十大主攻方向“揭榜挂帅”项目(2022SDZG01);泰山学者工程;山东省重点研发计划(农业良种工程)(2024LZGC038)。
为鉴定出与凡纳滨对虾生长性状相关的SNP位点和功能基因,本研究针对来自具有快速生长特性的选育和引进品系共74个家系进行生长和存活测试,利用液相芯片“黄海芯1号”(55K SNP)对其中39个家系个体进行高通量基因分型,通过ssGBLUP方法估...
关键词：凡纳滨对虾 ssGWAS FarmCPU 体重 显著关联SNP位点 
基于全基因组重测序的拟鳄龟遗传多样性及遗传结构分析
《南方农业学报》2024年第11期3392-3403,共12页杨华琳 李伟 纪利芹 朱新平 洪孝友 
国家自然科学基金青年基金项目(32102789);中国水产科学研究院科技创新团队项目(909231004);农业农村部政府购买服务项目(191231009);中国—东盟海上合作基金项目(CAMC-2018F)。
【目的】从全基因组水平开展拟鳄龟养殖群体遗传多样性及群体遗传结构分析,评估养殖拟鳄龟的种质资源状况,为拟鳄龟种质资源的开发与利用及促进其养殖产业健康发展提供参考依据。【方法】分别从肇庆高要市活道镇荣杰龟鳖专业合作社(RJ)...
关键词：拟鳄龟 全基因组重测序 遗传多样性 遗传结构 SNP位点 
鹅掌楸基因组部分SNP标记在种源评价中的应用
《安徽农业科学》2024年第21期93-96,共4页陆叶 施季森 
江苏省农业科技自主创新资金项目“耐盐型杂交鹅掌楸新品种培育及推广示范”(SCX(23)3628)。
以6个鹅掌楸(Liriodendron chinense)种源和3个北美鹅掌楸(Liriodendron tulipifera)种源共计23个个体作为研究群体,选取11对真实SNP位点,对这253个SNP标记的PCR产物进行正反向Sanger测序。结果表明:在11个真实SNP位点中,8个SNP位点在...
关键词：北美鹅掌楸 鹅掌楸 SNP标记 SNP位点 种源 
不同藏羊群体ASIP基因SNP位点筛选及其遗传分析
《家畜生态学报》2024年第10期15-21,共7页张耀 王啟婷 张存芳 多杰才旦 蔡伟杰 郝佳慧 覃敏欣 
青海省应用基础研究项目(2021-ZJ-728)。
藏羊产于青藏高原及其毗邻地区,外部特征非常突出,杂色藏羊约占总群体的90%,被毛纯白和纯黑个体很少。为研究ASIP基因的SNPs多态性与藏羊毛色遗传之间的关系,本研究采用混池测序及PCR-SSCP法对ASIP基因7个外显子在高原型、欧拉型、扎什...
关键词：藏羊 ASIP基因 SNP 遗传多样性 
TRPM1基因分型及其与乌骨鸡皮肤乌色度关联分析
《安徽农业大学学报》2024年第5期796-801,共6页屠云洁 章明 巨晓军 姬改革 刘一帆 单艳菊 邹剑敏 束婧婷 赵伟东 郑国庆 
江苏省种业振兴揭榜挂帅项目(JBGS[2021]107);现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-41);江苏省农业自主创新基金项目(CX(21)2011-1);扬州市现代农业项目(YZ2021029)共同资助。
为了对TRPM1基因SNPs位点进行基因分型,分析多态位点与皮肤乌色度的关联性,找出对皮肤乌色度相关的SNP标记,采用基于飞行时间质谱分析技术的MassARRAY平台对TRPM1基因的SNPs位点进行基因分型,分析单个SNP标记与皮肤亮度L^(*)值性状的相...
关键词：乌骨鸡 TRPM1 乌色度 SNP位点 连锁不平衡 
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