系统进化树

作品数:428被引量:1522H指数:15
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基于trnL-trnF基因序列鉴别魔芋属核心种质资源
《安徽农业科学》2025年第5期93-95,105,共4页王孟 杨朝柱 覃宇 赵青华 
湖北省农业科技创新中心项目(2016-620-000-001-062)。
采用株芽魔芋(A.mueller)、甜魔芋(A.paeoniifolius‘Yellow’)、滇魔芋(A.yunnesis)、勐海魔芋(A.kachinensis)、攸乐魔芋(A.yuleon-sis)、梳毛魔芋(A.sinensis)、西盟(A.krausei)、A.asterostigmatus、白魔芋(A.albus)、花魔芋(A.konj...
关键词:魔芋 TRNL-TRNF 系统进化树 
西藏日喀则地区羊梨形虫病原调查和分析
《中国兽医杂志》2025年第3期39-43,共5页朱浩瀚 赵帅阳 张少华 张楚晗 苏书晓 关贵全 殷宏 罗建勋 刘军龙 
国家重点研发计划项目(2022YFD1302102-06);国家自然科学基金项目(32202836,31972706);国家寄生虫资源库项目(NPRC-2019-194-30);农业科技创新工程(ASTIP)(CAAS-ASTIP-2016-LVRI);甘肃省基础研究创新群体项目(22JR5RA024);甘肃省科技厅特派团项目(22CX8NA011)。
为了解我国西藏自治区日喀则市藏羊梨形虫病的流行情况,本试验采集了366份藏羊血液样品并提取基因组DNA,采用巢式PCR方法对藏羊梨形虫病病原进行检测和鉴定,并基于梨形虫18S rRNA基因序列构建系统进化树。结果显示,梨形虫阳性率为35.79%...
关键词:藏羊 梨形虫 巢式PCR 系统进化树 流行病学调查 
伞形科13种植物CHS基因的生物信息学分析
《贵州农业科学》2025年第2期9-21,共13页王堃 钟秀来 朱顺华 罗庆 张新圻 谭国飞 
贵州省农业科学院青年基金项目(黔农科院青年科技基金〔2021〕04号);贵州省科学技术厅项目“园艺植物基因库创制平台建设及利用”(黔科合服企〔2022〕005号),(黔科合中引地〔2023〕033,黔科合基础-ZK〔2024〕一般543);贵阳市科技计划项目(筑科合同〔2021〕5-1号);贵州省现代农业产业技术体系-蔬菜产业技术体系(GZCYTX2024-0101)。
【目的】探明查尔酮合成酶(CHS)基因在伞形科不同植物中的结构特征,为了解类黄酮化合物在伞形科植物中的生物学功能及其综合利用提供参考。【方法】以伞形科六合黄心芹(Apium graveolens‘Liuhe Huangxinqin’)、津南实芹(A.graveolens...
关键词:查尔酮合成酶 伞形科 野生胡萝卜 生物信息学 系统进化树 
基于转录组信息的甘松CONSTANS转录因子家族分析
《中草药》2025年第4期1346-1354,共9页刘芳 王远航 陈红 黄雄杰 白怡婷 崔琪 雷语妍 李莹 李文兵 张绍山 陈晨 刘圆 
四川省自然科学基金资助项目(2025ZNSFSC1124);西南民族大学青藏高原研究首批科技创新团队(2024CXTD04);西南民族大学人才科研项目(RQD2021110);中央高校基本科研业务费专项基金项目(ZYN2024189)。
目的基于转录组数据筛选鉴定分析甘松Nardostachys jatamansi CONSTANS(CO)转录因子家族。方法运用生物信息学技术对甘松植物的CO转录因子家族成员展开综合分析,深入探究其蛋白的理化特性、基因序列结构、亚细胞位置、导肽和信号肽的预...
关键词:甘松 CONSTANS转录因子家族 光周期 系统进化树 生物信息学分析 
中国南瓜bHLH转录因子家族的鉴定与生物信息学分析
《生物技术通报》2025年第1期186-197,共12页李彩霞 李艺 穆宏秀 林俊轩 白龙强 孙美华 苗妍秀 
山西省重点研发计划项目(202102140601013);山西省基础研究计划青年科学研究项目(20210302124242)。
【目的】基于中国南瓜全基因组数据,鉴定中国南瓜bHLH转录因子家族成员并分析其理化性质和结构等,为中国南瓜bHLH转录因子家族的生物学功能研究提供理论支撑。【方法】利用NCBI和中国南瓜基因组数据库等对中国南瓜bHLH基因家族进行鉴定...
关键词:中国南瓜 BHLH 理化性质 系统进化树 组织表达模式 盐胁迫表达模式 
西伯利亚鲟促黄体激素受体基因的克隆及其生物信息学分析
《贵州农业科学》2025年第1期62-69,共8页周洲 孔杰 赵振新 赵飞 吕盛寒 刘霆 
贵州省基础研究(自然科学)项目“鲟鱼卵子质量蛋白标志物筛选及影响机制研究”(黔科合基础-ZK〔2023〕一般175);国家体系建设项目“特色淡水鱼产业技术体系”(CARS-46)。
【目的】阐明促黄体激素受体(Luteinizing hormone receptor,LHR)的生理功能和LHR基因在西伯利亚鲟性腺发育过程的功能作用,为鲟鱼的生殖调控提供参考。【方法】采用兼并引物扩展及RACE技术,克隆西伯利亚鲟LHR基因cDNA全长,并利用TMHMM...
关键词:西伯利亚鲟 促黄体激素 受体 克隆 生物信息学 系统进化树 
基于SNP位点及系统进化树分析辽宁省水痘-带状疱疹病毒基因特征
《中华微生物学和免疫学杂志》2024年第12期1067-1075,共9页王文思 王艳 王樱槥 方兴 安淑一 郭晋源 费思平 
目的分析辽宁省水痘-带状疱疹病毒(varicella-zoster virus,VZV)基因序列,确定流行的优势基因型及核苷酸、氨基酸变异情况。方法PCR方法对2017-2020年辽宁省31株VZV基因组开放阅读框(open reading frame,ORF)1、6、12、16、17、21、22...
关键词:水痘-带状疱疹病毒 基因型 单核苷酸多态性 系统进化树 
某三甲中医院耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌临床分离株耐药性和同源性
《中华医院感染学杂志》2024年第22期3376-3381,共6页武文君 王炜 陈明心 李强 荆鹏伟 任伟宏 王海峰 蒋雪松 
国家自然科学基金委员会面上基金资助项目(81774222);河南省高校科技创新团队支持计划经费基金资助项目(22IRTSTHN029)。
目的分析临床分离的耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌(CRPA)耐药情况,通过基因测序对分离株进行同源性分析。方法收集河南中医药大学第一附属医院2021年7月-2022年6月临床首次分离的CRPA 35株,采用微量肉汤稀释法进行最低抑菌浓度(MIC)测定,使...
关键词:耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌 多位点序列分型 最低抑菌浓度 系统进化树 
基于全基因组重测序的罗坑鸡遗传结构分析及特征位点挖掘被引量:1
《中国畜牧杂志》2024年第10期100-105,共6页严霞 莫玙 孔少芬 罗威 王春兰 陈细浩 钟澜 罗成龙 蔡柏林 聂庆华 
韶关市科技计划项目(220610144531382);广东省级乡村振兴战略专项(2022-XBH-06-002、2023-XBH-06-002);广东省农业科学院专家工作站(2023工作站11)。
本文旨在研究新资源罗坑鸡与其他著名广东地方品种鸡的遗传关系和挖掘罗坑鸡的特征性位点。对20个罗坑鸡血样进行DNA提取和30×全基因组重测序。同时,将这些数据与本课题组已有的5个广东鸡种(共77只)样本的数据相结合,采用系统进化树、...
关键词:罗坑鸡 全基因组重测序 系统进化树 主成分分析 血缘成分分析 群体分化指数 
柚XTH基因家族全基因组鉴定与分析
《现代农业科技》2024年第20期138-143,154,共7页谭烨欢 巫国军 黄城 李国华 温清英 马瑞丰 
乡村振兴战略专项项目(农业科技能力提升)“柚果品质提升生产技术集成与示范”(2023TS-1-1);国家柑橘产业技术体系建设专项(CARS-26)。
木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(XTH)是植物细胞壁修饰和重塑的关键酶之一,在植物生长发育和抗逆性方面发挥着关键作用。利用生物信息学方法对柚XTH基因家族进行鉴定与分析,共鉴定出24个CgXTHs,分为4组;CgXTHs蛋白的氨基酸长度为212~564 aa...
关键词: XTH基因家族 鉴定 染色体定位 系统进化树 基因结构 顺式作用元件 
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