EST-SSR

作品数：576被引量：2979H指数：30
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基于EST-SSR的钟花樱与近缘种的聚类分析及嫁接亲和性研究
《广西植物》2025年第4期761-772,共12页刘夔 李梓函 张依 郝文洁 姜蕾 叶琦 付涛 
浙江省教育厅科研项目(Y202044834);高校国内访问工程师“校企合作项目”(FG2024302);宁波城市职业技术学院校级重点科研项目(04640950338);大学生科技创新资助项目(046001815)。
该研究以16种樱属植物为研究材料,利用EST-SSR分子标记技术对其进行聚类分析,旨在为钟花樱及其近缘种的物种分类、物种资源保护、砧木选择和杂交亲本选择提供分子水平的依据和技术支持。结果表明:(1)遗传多样性分析发现17对EST-SSR引物...
关键词：樱属 钟花樱 遗传多样性 亲缘关系 育种 EST-SSR 
增补无性系对湿地松种子园遗传多样性的影响
《广西植物》2025年第4期689-701,共13页覃先玉 冯源恒 谢俊康 蒙兰杨 杨章旗 
广西科技基地和人才专项(桂科AD19254004)。
对于建园无性系较少或缺株较多的种子园增补无性系是种子园科学管理的重要措施。该研究以南宁市林业科学研究所湿地松无性系种子园为研究对象,分析增补无性系对该园遗传多样性的影响作用,以期为种子园科学管理提供参考建议。采用16对SS...
关键词：湿地松 EST-SSR 遗传多样性 无性系扩充 遗传育种 
丛生盔形珊瑚转录组微卫星标记的分离和鉴定
《海南大学学报(自然科学版中英文)》2025年第1期25-32,共8页卢章旺 李福宇 廖婷馨 李立微 王嫣 
国家科技基础资源调查专项课题(2022FY100604);国家自然科学基金项目(41376174)。
丛生盔形珊瑚是中国南海岛礁造礁珊瑚的代表性物种。根据其刺丝囊形态与线粒体基因组CYTB-ND2基因间区插入/缺失(indel)的基因型,丛生盔形珊瑚可分为S和H两种形态型,且二者的遗传和生态表型有明显的分化。本研究通过挖掘丛生盔形珊瑚编...
关键词：丛生盔形珊瑚 EST-SSR 形态型 线粒体基因型 遗传分化 
60份莲种质资源遗传多样性分析
《种子》2025年第2期133-141,共9页高翔 陈岳 张微微 刘青青 田代科 
上农植慧种质资源创新团队项目(KY6-0100-24-01)。
为研究莲种质的遗传多样性和亲缘关系,应用43对EST-SSR引物对60份不同莲种质资源进行遗传多样性分析,并构建DNA指纹图谱及其QR编码。结果表明,43对引物共检测出4784个多态性位点,平均111个;等位基因数总数148个,平均3.44个;有效等位基...
关键词：莲 EST-SSR 遗传多样性 亲缘关系 DNA指纹图谱 
基于山药转录组测序的EST-SSR信息分析及分子标记开发被引量：1
《分子植物育种》2025年第4期1269-1277,共9页李锦超 董俊美 贾凯旋 孟义江 杨太新 侯孟泽 葛淑俊 
河北省现代农业产业技术体系中药材产业创新团队项目(HBCT201806202)资助。
山药(Dioscorea opposita Thunb.)为药食同源作物,为解析其遗传背景,本研究基于山药珠芽转录组数据挖掘SSR位点。结果表明,在46701条unigenes中检测到24467个SSR,平均每2.29 kb发现1个SSR位点,发生频率33.78%,出现频率53.40%。重复基元...
关键词：山药 转录组 SSR分子标记 
异质生境下山东银莲花的转录组分析及EST-SSR分子标记开发
《广西植物》2025年第1期95-107,共13页单筱涵 安康 周春霞 张鑫 逄玉娟 李丽霞 卞福花 
国家自然科学基金面上项目(31971546)。
为探究稀有物种山东银莲花在全光照的山顶灌丛和阴暗的针阔混交林下两种不同生境中的生态适应机制,并开发其EST-SSR分子标记,该研究利用Illumina高通量测序技术对开花期的山东银莲花叶片进行转录组测序,获取其功能注释和差异表达基因(DE...
关键词：异质生境 山东银莲花 转录组 EST-SSR 生态适应机制 
不同来源SSR引物对刺梨种群遗传差异性分析
《林业科学研究》2024年第6期171-179,共9页刘粉粉 黄秦军 高铖铖 刘进 欧国腾 莫亮团 
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(CAFYBB2020ZC001)。
[目的]研究刺梨EST-SSR与近缘物种萨蔓莎月季的EST-SSR对刺梨种群遗传分析产生的差异,为刺梨遗传多样和遗传结构研究提供不同来源SSR标记位点。[方法]采用6对萨蔓莎月季EST-SSR引物和6对刺梨EST-SSR引物对261个野生刺梨样本进行基因分型...
关键词：刺梨 萨蔓莎月季 EST-SSR 遗传多样性 相关性分析 
基于EST-SSR分子标记对乌天麻和红天麻的鉴定
《耕作与栽培》2024年第6期57-62,共6页何薇 胡艺镨 李胜男 徐娇 欧小宏 
贵州中医药大学大学生创新创业训练计划项目[2021(33)]。
本研究利用MISA软件对乌天麻转录组筛选得到SSR位点并对其特征进行分析,通过设计引物对25份乌天麻和红天麻样本进行PCR扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,对扩增条带进行聚类分析。结果表明,利用MISA软件共筛选得到EST-SSR位点12744个,发生...
关键词：天麻 分子标记 EST-SSR 鉴定 
170份非洲菊种质资源遗传多样性及亲缘关系分析
《福建农业学报》2024年第10期1120-1129,共10页夏朝水 曹奕鸯 陈玮婷 甘玮欣 林发壮 许克正 林辉锋 
福建省农业引导性项目(2021N0042);三明市科技计划项目(2023-N-3)
【目的】对170份非洲菊种质资源的遗传多样性及亲缘关系进行研究,为非洲菊种质资源的引进、保护及利用等提供依据。【方法】采用表达序列标签SSR(expressed sequence tags-SSR,EST-SSR)分子标记,每对染色体挑选1~3对多态性高、条带清晰...
关键词：非洲菊 EST-SSR 遗传多样性 聚类分析 
青檀(Pteroceltis tatarinowii)全长转录组SSR分布及其序列特征
《分子植物育种》2024年第19期6396-6402,共7页郭伟 罗磊 李国华 王迎 季霞 周光锋 于永畅 孙忠奎 程甜甜 边晓惠 杨波 王新花 张林 
泰安市乡土观赏树种国家林木种质资源库项目(林场发[2016]153号);2019年山东省农业科技园区产业提升工程项目(2019YQ012);泰安市科技发展计划(引导计划)(2018NS0090)共同资助。
采用生物信息学方法对青檀(Pteroceltis tatarinowii)全长转录组中的SSR位点信息进行分析,以期为青檀SSR标记开发提供依据。利用MISA工具对全长转录组测序获得的基因序列进行SSR检索、位点信息分析。从11801条基因序列中检索到6524个SS...
关键词：青檀 全长转录组 EST-SSR 
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