酶反应速率方程的普适形式  

Generic Enzymatic Rate Equation

作　　者：徐岷涓[1] 朱晓梅 林保宏 敖平[1] 

机构地区：[1]上海交通大学系统生物医学研究院,系统生物医学教育部重点实验室,上海200240 [2]GenMath,Corp.5525 27th Ave.N.E.,Seattle,USA,WA 98105 [3]台湾科技大学,电资学院电子工程系,中国台北10607 [4]台湾科技大学,电资学院光电工程研究所,中国台北106071

出　　处：《生物化学与生物物理进展》2011年第8期759-767,共9页Progress In Biochemistry and Biophysics

基　　金：国家重点基础研究发展计划(973)资助项目(2010CB529200,2007CB914700)~~

摘　　要：酶反应速率方程的普适形式是应用于相互关联的大规模代谢途径动力学建模的重要方法.把酶反应速率方程写成Michaelis-Menten-King-Altman方程形式可以使得动力学参数(或函数)容易与数据库中的实验数据相接轨,并可以处理任意数量的底物和产物,有利于大规模的计算.普适形式可以同时描述正、负反应方向,并能精确地用于准稳态条件.展示了在三类生物体系中广泛存在的酶反应机制中普适方程的严格推导过程,并讨论了普适方程的特点,针对不可逆反应酶反应产生的产物抑制效应可以自然消除,总结了在普适速率方程中体现调节剂的作用和协同作用.Kinetic modeling of large-scale metabolic network require a generic enzymatic rate equation.In the generic form,kinetic parameters are clear and precise enough to correlate to experimental data and construct a database.Such a uniform form is easy to deal with arbitrary number of substrates and products in computation of dynamic modeling.The generic rate equation is symmetrical in both directions of reversible reaction and formally exact under the quasi-steady state condition.Here presented the rigorous derivation of generic rate equation from further three classical enzymatic rate equations and discussed the characters and uses of the generic form.

关 键 词：普适酶反应速率方程 动力学模型 系统生物学 酶动力学 

分 类 号：Q31[生物学—遗传学]